SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

Superfamily is undergoing a server migration - you are now browsing on the new server. Please contact us if you experience any problems.

SUPERFAMILY Assignments for Genomes and Sequence Collections

We provide assignments for 3250 distinct organisms.

Model Eukaryotes (433) animals (139), fungi (173), plants (66) and protists (55)
Model Prokaryotes (1274) model bacteria (1153) and archaea (121)
Eukaryote strains (58);
Prokaryote strains (1485)
animals (5), fungi (46), plants (3) and protists (4);
bacterial (1442) and archaeal (43)
Longest transcript per gene (62) eukaryote genomes with splice variants removed
Others (20);
Sequence collections (141)
incomplete, low coverage or early release genomes;
UniProt, PDB, viral sequences etc
(show info)

Email superfamily@cs.bris.ac.uk to have a genome added and/or analysed.

Recently added genomes
NCBI 2017_08 genome 2017-09-14
SCOP2 SCOPe CATH ECOD 2017-09-12

Jump to [ Top of page · Model Prokaryotes · Eukaryote strains/versions · Prokaryote strains · Meta-genomics · Pseudogenes · Other ]

Eukaryotes
(show help)
Genome name Dom No. of sequences No. with assignment % with assign. % total sequence coverage No. of domains assigned No. of supfam.s No. of fam.s Average Supfam. size % produced by duplication Average sequence length Average length matched No. of domain pairs No. of unique architectures
Populus trichocarpa v156 E 45033 26591 59 44 37760 974 814 38.8 97 383 286 9943703
Theileria parva   E 4079 1948 48 29 2761 568 262 4.9 79 465 287 3121048
Physcomitrella patens E 35938 14093 39 31 19897 996 832 20 95 362 282 9653181
Plasmodium yoelii ssp. yoelii 1  E 7861 2624 33 22 3671 642 309 5.7 83 432 280 3701303
Acremonium alcalophilumv 1.0 E 9491 4737 50 35 6930 863 671 8 88 450 317 6371993
Coniophora puteana E 13761 6917 50 36 9512 849 654 11.2 91 437 313 6522096
Dichomitus squalens E 12290 6287 51 38 8732 866 675 10.1 90 418 309 6522092
Dothistroma septosporum E 12580 6270 50 38 8679 895 711 9.7 90 407 308 6512149
Fomitiporia mediterranea v1.0 E 11333 6011 53 39 8511 855 665 10 90 427 316 6572090
Fomitopsis pinicolav1.0 E 14724 6942 47 35 9390 888 672 10.6 91 395 296 6472149
Gloeophyllum trabeumv1.0 E 11846 6322 53 39 8679 888 685 9.8 90 420 305 6672158
Hansenula polymorpha v2.0 E 5177 3439 66 46 4949 778 589 6.4 84 448 311 5531572
Pichia membranifaciensv1.0 E 5363 3313 62 40 4830 771 578 6.3 84 481 314 5381566
Punctularia strigosozonata v1.0 E 11538 6332 55 39 8828 865 662 10.2 90 439 311 6612118
Aspergillus brasiliensis v1.0 E 13000 7699 59 43 11188 909 730 12.3 92 464 334 7372367
Heterobasidion annosum  E 12270 5578 45 36 7708 880 675 8.8 89 382 300 6312021
Rhodotorula graminis WP1 v1.0 E 7283 4331 59 36 6159 849 624 7.3 86 500 307 5811896
Microsporum canis CBS 113480  E 8765 5049 58 40 7516 868 650 8.7 88 486 334 6412054
Septoria musiva v1.0 E 10233 5626 55 39 8006 890 706 9 89 449 319 6632131
Setosphaeria turcica v1.0 E 11702 6391 55 39 9242 899 724 10.3 90 455 324 6912289
Stereum hirsutum FP-91666 SS1  v1.0 E 14072 7399 53 36 10216 881 689 11.6 91 457 311 6732244
Trametes versicolor v1.0 E 14296 7013 49 35 9501 871 678 10.9 91 421 303 6632120
Melampsora laricis-populina  E 16694 5182 31 23 6923 829 591 8.4 88 377 282 5541892
Hydra vulgaris E 17002 10366 61 40 16656 999 819 16.7 94 421 277 12313674
Wallemia sebi v1.0 E 5284 3365 64 46 4881 796 579 6.1 84 422 306 5271586
Wolfiporia cocos MD-104 SS10  v1.0 E 12746 6196 49 36 8522 877 663 9.7 90 408 303 6422093
Acyrthosiphon pisum  E 10466 7362 70 46 13549 951 831 14.2 93 514 336 10432924
Penicillium chrysogenum v1.0 E 11396 6823 60 42 9764 903 732 10.8 91 468 327 6962219
Brugia malayi WS250 E 17153 8738 51 39 15321 902 703 17 94 381 290 8923032
Carica papaya  E 27950 12654 45 40 16946 937 743 18.1 94 295 260 8653093
Amborella trichopoda 22 E 27313 12509 46 39 17060 961 808 17.8 94 314 270 8963042
Pisolithus microcarpus 441 v1.0 E 21064 6566 31 30 8868 857 622 10.3 90 281 273 6322125
Sebacina vermifera MAFF 305830 v1.0 E 15312 7389 48 37 10619 868 648 12.2 92 409 311 6672284
Phytophthora ramorum 1.1 E 15743 9232 59 40 13977 882 664 15.8 94 475 322 10543010
Trichoderma reesei 1.2 E 9129 5667 62 41 8213 894 692 9.2 89 491 327 6772107
Cryptosporidium hominis E 3934 1810 46 29 2586 503 236 5.1 81 450 280 276969
Rattus norvegicus 76_5.0 E 25724 18941 74 46 36627 1102 1338 33.2 97 510 317 14634845
Trichoplax adhaerens  E 11520 8049 70 50 13900 969 841 14.3 93 453 325 10342998
Macaca mulatta 76_1 E 36384 25062 69 44 52167 1100 1347 47.4 98 480 308 15445863
Rhizopus oryzae RA 99-880  E 17459 8318 48 41 12131 834 643 14.5 93 342 297 7272339
Rhizomucor miehei CAU432  E 10345 6055 59 42 9121 865 685 10.5 91 419 304 7952409
Phytophthora sojae 1.1 E 19027 10343 54 38 16145 879 652 18.4 95 499 347 10663149
Musa acuminata 22 E 36519 20635 57 44 28458 971 787 29.3 97 345 266 10093647
Candida tropicalis MYA-3404  E 6258 3786 60 38 5387 782 587 6.9 85 484 307 5411661
Pyrenophora tritici-repentis  E 12169 6196 51 37 8937 905 702 9.9 90 449 324 7002253
Trypanosoma brucei gambiense v4.1 E 9895 4049 41 28 5729 679 383 8.4 88 454 309 4591620
Ovis aries 76_3.1 E 22823 16556 73 44 33437 1099 1342 30.4 97 531 325 14994875
Pythium aphanidermatum DAOM BR444 22 E 12312 7257 59 38 11220 889 632 12.6 92 489 316 10022892
Tribolium castaneum 3.0 E 16645 8930 54 40 16567 994 911 16.7 94 462 340 12203438
Tetraodon nigroviridis 76_8 E 23118 17836 77 48 37397 1075 1201 34.8 97 546 338 14384903
Takifugu rubripes 76_4 E 47841 39222 82 49 93451 1084 1212 86.2 99 633 377 15636473
Strongylocentrotus purpuratus v3.1 E 29129 20293 70 45 40403 1036 973 39 97 499 322 18226332
Trichomonas vaginalis  E 97883 27111 28 26 33248 661 330 50.3 98 287 271 5062025
Cochliobolus miyabeanus ATCC 44560 v1.0 E 12007 6437 54 39 9216 903 736 10.2 90 445 323 6782279
Tupaia belangeri 76 E 15475 10738 69 40 21210 1014 1153 20.9 95 527 307 13584220
Cryptosporidium muris E 3934 2123 54 28 3206 560 292 5.7 83 586 309 3361122
Toxoplasma gondii ME49 E 7993 3600 45 19 5483 722 392 7.6 87 744 311 4801700
Toxoplasma gondii GT1 E 8102 3406 42 19 5136 700 384 7.3 86 682 310 4641651
Mucor circinelloides  E 10930 6904 63 44 9999 871 698 11.5 91 424 298 7002195
Ustilago maydis  E 6522 3970 61 33 5954 828 623 7.2 86 612 329 5951900
Neospora caninum E 7082 3658 52 19 5772 711 381 8.1 88 853 316 4991725
Uncinocarpus reesii 1704  E 7798 4458 57 39 6572 832 621 7.9 87 478 325 6261948
Dekkera bruxellensis CBS 2499 v2.0 E 5636 3351 59 42 4860 790 589 6.2 84 439 311 5411609
Tursiops truncatus 76_1 E 16611 11861 71 42 25713 1082 1297 23.8 96 573 336 14804571
Toxoplasma gondii VEG E 7846 3362 43 19 5098 690 381 7.4 86 699 310 4581625
Trypanosoma cruzi strain CL Brener E 10320 4719 46 28 6449 658 352 9.8 90 501 311 4181614
Poecilia formosa 76 E 21104 16292 77 46 35843 1092 1232 32.8 97 591 350 15374892
Aspergillus acidus v1.0 E 13530 7519 56 42 10966 912 727 12 92 447 336 7392394
Verticillium dahliae VdLs.17  E 10535 6094 58 39 8548 894 687 9.6 90 473 316 6722201
Verticillium albo-atrum VaMs.102  E 10220 5763 56 39 7980 875 621 9.1 89 437 306 6372116
Chlorella vulgaris  E 9994 5788 58 42 8249 898 683 9.2 89 402 295 7682300
Procavia capensis 76_1 E 16114 11365 71 41 23581 1040 1214 22.7 96 564 324 14354525
Volvox carteri f. nagariensis  E 15544 7384 48 25 10499 947 672 11.1 91 557 294 8212808
Pteropus vampyrus 76_1 E 17053 12201 72 42 25830 1066 1289 24.2 96 567 333 15304576
Vitis vinifera  E 26346 15429 59 45 22173 967 796 22.9 96 378 292 10513594
Vicugna pacos 76_1 E 11806 8193 69 41 16592 971 1049 17.1 94 538 317 12193575
Vanderwaltozyma polyspora DSM 70294  E 5353 3341 62 38 4827 759 603 6.4 84 504 304 4761570
Plasmodium vivax SaI-1 7.0 E 5432 2549 47 20 3744 660 321 5.7 82 694 302 3861337
Oikopleura dioica E 18020 9095 50 36 14370 899 710 16 94 388 279 9523096
Phaseolus vulgaris v186 E 30721 20005 65 45 28970 966 814 30 97 434 299 9403266
Schizosaccharomyces cryophilus OY26 22 E 5180 3339 64 45 4980 760 569 6.6 85 451 315 5451552
Agaricus bisporus var. bisporus  E 10438 5646 54 39 7793 848 652 9.2 89 425 306 6401973
Aspergillus carbonarius ITEM 5010  E 10238 6795 66 45 9895 894 727 11.1 91 503 338 7152225
Actinidia chinensis Hongyang  E 39040 20028 51 40 28961 945 720 30.6 97 357 279 15754588
Acholeplasma laidlawii PG-8A E 1380 963 70 61 1411 470 278 3 67 327 288 258567
Allomyces macrogynus ATCC 38327  E 17600 10099 57 34 14532 850 623 17.1 94 510 305 7562692
Acropora digitifera v1.0 E 23514 13814 59 42 24685 946 740 26.1 96 419 302 16264815
Arthroderma benhamiae CBS 112371  E 7980 4522 57 38 6726 826 613 8.1 88 493 332 6151965
Aquilegia coerulea v195 E 41063 26825 65 45 39229 984 816 39.9 97 435 302 9893670
Asterochloris sp. Cgr/DA1pho v1.0 E 7159 4948 69 45 7136 880 667 8.1 88 464 301 7072027
Acromyrmex echinatior v3.8 E 17278 7250 42 33 13235 995 877 13.3 92 404 315 11253112
Oryza sativa v193 E 66338 32867 50 39 51632 974 808 53 98 446 352 10844045
Adineta vaga E 49300 29119 59 47 46612 1053 913 44.3 98 384 305 13945209
Brachypodium distachyon  E 31029 19828 64 44 28160 972 821 29 97 426 293 9783340
Volvox carteri v199 E 15285 6919 45 26 9996 935 665 10.7 91 523 302 8132717
Bathycoccus prasinos  E 7919 4827 61 35 7065 889 581 7.9 87 522 303 6842140
Brassica rapa Chiifu-401 1.2 E 41019 24868 61 44 35611 964 810 36.9 97 390 286 12374016
Catenaria anguillulae PL171 v1.0 E 14188 6002 42 30 8337 849 616 9.8 90 411 294 6192149
Candida dubliniensis CD36  E 5868 3680 63 39 5282 797 606 6.6 85 507 311 5261667
Callithrix jacchus 76_3.2.1 E 43771 31128 71 44 65350 1097 1338 59.6 98 509 316 15946489
Cucumis sativus v122 E 30364 19414 64 45 27348 960 819 28.5 96 405 285 9123231
Aspergillus wentii v1.0 E 12442 7516 60 43 10789 909 730 11.9 92 462 327 7392331
Coccomyxa subellipsoidea sp. C-169 v2 E 9629 5668 59 42 8236 891 688 9.2 89 426 305 7762269
Citrus clementina v165 E 35976 24115 67 47 34752 964 822 36 97 416 293 9493532
Gadus morhua 76_1 E 22100 16121 73 48 31476 1065 1174 29.6 97 480 316 14594763
Citrus sinensis v154 E 46147 30817 67 46 44221 951 789 46.5 98 414 285 9433848
Cyanophora paradoxa  E 32167 10628 33 29 12943 908 569 14.3 93 228 199 6752654
Megaselia scalaris 22 E 11463 5102 45 41 7083 767 528 9.2 89 225 206 6051899
Pythium arrhenomanes ATCC 12531 22 E 13805 7842 57 38 11634 889 610 13.1 92 446 294 10442963
Danaus plexippus OGS1.0 E 16866 8829 52 38 15421 984 873 15.7 94 412 301 11383426
Drosophila suzukii E 13583 7989 59 37 16568 958 858 17.3 94 571 362 13163708
Entamoeba dispar 1.2 E 8748 4980 57 41 7176 575 299 12.5 92 408 296 4361481
Entamoeba invadens 1.2 E 11549 6735 58 43 11423 577 307 19.8 95 449 329 4371671
Amorphotheca resinae v1.0 E 9642 5330 55 38 7579 878 703 8.6 88 455 314 6362052
Echinococcus granulosus  E 10241 5513 54 33 9399 868 645 10.8 91 495 305 7352427
Eucalyptus grandis v201 E 46315 29451 64 50 42674 970 812 44 98 392 305 9953760
Ectocarpus siliculosus E 16533 8641 52 30 12717 912 641 13.9 93 513 298 9503083
Physcomitrella patens subsp. patens 22 E 38354 18313 48 39 26203 1008 829 26 96 353 289 9873504
Didymella exigua CBS 183.55 v1.0 E 12394 6221 50 37 8784 912 734 9.6 90 423 315 6852243
Blumeria graminis 22 E 6470 3582 55 35 5188 794 588 6.5 85 484 307 5301691
Oryza brachyantha 22 E 32037 15710 49 41 22255 963 792 23.1 96 353 292 10173439
Choloepus hoffmanni 76_1 E 12435 8612 69 40 17245 961 1019 17.9 94 530 307 12123609
Galerina marginata v1.0 E 21461 8543 40 31 11478 889 684 12.9 92 383 298 6932341
Aspergillus versicolor v1.0 E 13228 8532 64 45 12357 908 745 13.6 93 480 337 7612455
Guillardia theta CCMP2712 v1.0  E 24840 12293 49 33 17471 946 641 18.5 95 409 271 11073414
Cyanidioschyzon merolae strain 10D 22 E 4998 3277 66 40 4745 813 553 5.8 83 503 306 5161656
Heterocephalus glaber v1.7-2 E 22561 16037 71 45 31435 1078 1309 29.2 97 479 304 16085000
Aspergillus sydowii v1.0 E 13620 8384 62 44 11964 910 741 13.1 92 464 329 7782431
Heliconius melpomene  E 12829 7645 60 41 13574 962 808 14.1 93 453 308 10923201
Hymenolepis microstoma  E 10142 5540 55 34 9388 841 598 11.2 91 489 304 7682429
Sporisorium reilianum 22 E 6673 4152 62 34 6143 865 647 7.1 86 596 322 6121946
Ichthyophthirius multifiliis strain G5  E 8056 5083 63 47 7691 639 373 12 92 414 311 5661733
Cochliobolus lunatus m118 v2.0 E 12131 6504 54 39 9317 901 726 10.3 90 443 324 6762282
Scleroderma citrinum Foug A v1.0 E 21012 6747 32 30 9054 858 629 10.6 91 298 275 6252118
Aspergillus glaucus E 11277 6435 57 41 9203 887 702 10.4 90 438 316 7052220
Lucilia cuprina E 14452 7294 50 33 14325 967 858 14.8 93 518 337 10943253
Aureobasidium pullulans var. subglaciale EXF-2481 v1.0 E 10809 6110 57 40 8672 895 731 9.7 90 452 317 6682158
Leishmania mexicana 2.4 E 8041 4209 52 26 5976 695 397 8.6 88 635 309 4691684
Panicum virgatum v202 E 70071 39257 56 43 52694 985 805 53.5 98 340 263 9904281
Latimeria chalumnae 76_1 E 23601 17308 73 45 33273 1075 1236 31 97 518 316 14364924
Bos taurus 76_3.1 E 22118 16393 74 45 33500 1090 1351 30.7 97 534 325 14674725
Ciona savignyi 76_2.0 E 20155 13419 67 53 30631 912 858 33.6 97 481 383 11263872
Pythium irregulare DAOM BR486 22 E 13805 7843 57 35 12003 894 653 13.4 93 497 311 9972922
Caenorhabditis elegans 76_235 E 30250 16476 54 40 29666 944 788 31.4 97 448 326 9793358
Cryptosporidium parvum Iowa II E 3805 2003 53 27 3021 533 272 5.7 82 597 311 3091037
Caenorhabditis briggsae 2 E 21997 10333 47 36 16605 946 764 17.6 94 398 305 10373164
Malus domestica v196 E 63517 35948 57 41 51044 967 774 52.8 98 372 273 17256435
Chlamydomonas reinhardtii 4.0 E 16706 7652 46 26 10686 942 659 11.3 91 496 284 8222696
Dasypus novemcinctus 76_2 E 26551 19439 73 45 38528 1085 1325 35.5 97 501 311 15075118
Daphnia pulex  E 30940 12685 41 34 19578 1042 934 18.8 95 325 270 11733598
Hydnomerulius pinastri v2.0 E 13270 6484 49 37 8944 874 662 10.2 90 405 304 6532149
Danio rerio 76_9 E 43153 31400 73 46 67350 1088 1236 61.9 98 499 313 15355987
Drosophila melanogaster 76_5 E 26950 17699 66 35 38800 985 895 39.4 97 658 354 10453570
Canis familiaris 76_3.1 E 25160 18183 72 42 39025 1091 1343 35.8 97 577 337 15085099
Debaromyces hansenii E 6272 3839 61 40 5491 809 615 6.8 85 479 314 5431672
Drosophila ananassae 1.3 E 15070 8429 56 36 14844 980 879 15.1 93 489 315 10423116
Drosophila pseudoobscura 2.13 E 16265 8790 54 35 15498 974 878 15.9 94 480 311 10443161
Tuber melanosporum Mel28 22 E 7496 4194 56 39 6090 841 651 7.2 86 438 304 6221917
Drosophila persimilis 1.3 E 16878 8798 52 36 14618 967 855 15.1 93 427 293 10083168
Dictyostelium discoideum E 13263 6955 52 33 11119 894 641 12.4 92 533 332 8952645
Drosophila virilis 1.2 E 14491 8266 57 36 14748 973 885 15.2 93 499 314 10163092
Drosophila simulans 1.3 E 15415 8042 52 36 13040 950 811 13.7 93 410 287 9652993
Drosophila mojavensis 1.3 E 14595 8119 56 36 14472 970 884 14.9 93 493 316 10283089
Drosophila yakuba 1.3 E 16082 8564 53 36 15072 971 878 15.5 94 469 315 10203139
Drosophila sechellia 1.3 E 16471 8907 54 36 14972 967 860 15.5 94 434 292 10263172
Zea mays v181 E 63540 34145 54 41 45617 985 806 46.3 98 332 254 12974576
Naegleria gruberi  E 15753 9232 59 37 13179 843 569 15.6 94 491 309 8462785
Echinops telfairi 76 E 16575 11426 69 41 22697 1031 1167 22 95 522 307 13864409
Erinaceus europaeus 76 E 14605 10229 70 41 20151 1008 1119 20 95 541 313 13294078
Leishmania major strain Friedlin  E 8408 4431 53 26 6298 702 399 9 89 631 309 4711709
Entamoeba histolytica 1 E 8306 4743 57 41 6856 579 302 11.8 92 418 300 4221413
Equus caballus 76_2 E 22654 16229 72 45 36832 1082 1328 34 97 562 355 14514660
Plasmodium berghei ANKA  E 4858 2501 51 22 3665 653 324 5.6 82 692 300 3761324
Phanerochaete chrysosporium RP-78 2.1 E 10048 5970 59 40 8222 834 661 9.9 90 454 305 6291982
Felis catus 76_6.2 E 20259 14847 73 45 29829 1095 1345 27.2 96 528 323 14854642
Fusarium graminearum  E 13321 7179 54 39 10215 921 732 11.1 91 445 325 7242327
Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici 4286  E 17701 9690 55 41 13194 912 733 14.5 93 407 305 7352455
Paxillus rubicundulus Ve08.2h10 v1.0 E 22065 5895 27 28 7951 867 641 9.2 89 263 278 6222014
Fusarium verticillioides 7600  E 14188 7910 56 42 10913 903 736 12.1 92 419 314 7022337
Plasmodium knowlesi strain H  E 5185 2529 49 20 3702 658 320 5.6 82 720 301 3831324
Plasmodium chabaudi  E 5124 2629 51 23 3791 658 325 5.8 83 676 297 3781334
Manihot esculenta v147 E 34151 21616 63 45 30061 961 816 31.3 97 390 278 9273378
Mimulus guttatus v140 E 28282 18398 65 47 25750 962 803 26.8 96 391 284 9243162
Meloidogyne incognita  E 20359 9366 46 35 14191 827 609 17.2 94 354 270 8322778
Meleagris gallopavo 76_2 E 16494 12076 73 45 24404 1021 1177 23.9 96 532 325 13054286
Mnemiopsis leidyi E 16058 9111 57 37 15415 919 683 16.8 94 461 304 12173471
Musa balbisiana E 39914 22578 57 41 32796 951 739 34.5 97 404 290 14944868
Meloidogyne hapla  E 13072 5216 40 32 7324 798 553 9.2 89 310 246 6312093
Apiospora montagnei NRRL 25634 v1.0 E 16992 8184 48 38 11594 922 745 12.6 92 420 327 7112432
Mustela putorius furo 76_1.0 E 20062 14065 70 44 29313 1072 1314 27.3 96 534 332 14584604
Mortierella verticillata NRRL 6337  E 12569 7504 60 37 11326 891 711 12.7 92 518 320 7772439
Oryza barthii 22 E 41672 21411 51 41 33435 958 788 34.9 97 404 325 11614299
Piloderma croceum F 1598 v1.0 E 21583 8020 37 33 10932 885 672 12.4 92 331 293 6952386
Nomascus leucogenys 76_1.0 E 19988 14014 70 43 30589 1091 1328 28 96 541 331 14844707
Oryza glaberrima E 31044 16088 52 41 22409 941 760 23.8 96 362 289 9183111
Oreochromis niloticus 76_1.0 E 26763 21062 79 46 45961 1076 1215 42.7 98 594 348 15055039
Aegilops tauschii 22 E 33849 20395 60 44 29326 940 730 31.2 97 401 293 11954037
Cronartium quercuum f. sp. fusiforme G11 v1.0 E 13903 4616 33 29 6369 835 587 7.6 87 330 290 5691897
Ailuropoda melanoleuca 76_1 E 21136 15553 74 45 32314 1093 1344 29.6 97 539 328 14614758
Penicillium chrysogenum Wisconsin 54-1255  E 12788 6988 55 39 9986 889 731 11.2 91 449 324 6902223
Zasmidium cellare ATCC 36951 v1.0 E 16015 9284 58 41 12624 907 734 13.9 93 449 318 7172379
Prunus persica v139 E 28702 17475 61 45 24895 953 798 26.1 96 403 296 9303224
Penicillium marneffei ATCC 18224  E 10638 6895 65 42 10055 895 729 11.2 91 503 328 7042278
Pleurotus ostreatus  E 11603 6284 54 37 8663 873 670 9.9 90 444 307 6552110
Pichia pastoris GS115  E 5040 3238 64 42 4764 792 587 6 83 476 314 5571573
Proterospongia sp. ATCC 50818  E 11590 7279 63 35 13111 924 655 14.2 93 628 347 11573278
Phyllostachys heterocyclavar. pubescens E 31987 18735 59 41 26884 933 727 28.8 97 403 283 13304279
Petromyzon marinus 76_7.0 E 11442 8339 73 50 14727 899 872 16.4 94 403 274 9403053
Perkinsus marinus ATCC 50983  E 23654 11343 48 39 15407 769 496 20 95 321 262 7392673
Porphyridium purpureum 02_2012 E 8355 4991 60 38 7032 836 588 8.4 88 479 301 6191971
Picea abies E 26437 14609 55 45 19036 809 574 23.5 96 306 247 6972715
Pinus taeda E 34059 25205 74 57 34226 859 605 39.8 97 318 244 12414264
Ficedula albicollis 76_1.0 E 15983 11221 70 44 23330 1069 1233 21.8 95 544 339 14754237
Pelodiscus sinensis 76_1.0 E 20669 15386 74 46 31140 1055 1244 29.5 97 529 328 13694567
Pythium ultimum v1.7-2 E 15323 8519 56 39 12672 900 651 14.1 93 432 301 9392839
Oryza meridionalis 22 E 39932 21385 54 41 33179 940 763 35.3 97 425 325 11634074
Trichoderma asperellum CBS 433.97 v1.0 E 12586 6886 55 40 9932 906 707 11 91 441 326 7082291
Aspergillus zonatus v1.0 E 11362 7184 63 44 10670 1040 884 10.3 90 470 329 9312627
Daldinia eschscholzii EC12 v1.0 E 11173 6451 58 40 9120 901 715 10.1 90 466 322 6672213
Sphaeroforma arctica JP610  E 18730 7414 40 31 9991 903 628 11.1 91 302 235 7412483
Saccoglossus kowalevskii v3.0 E 45358 23665 52 38 55500 1061 1042 52.3 98 487 354 16635691
Serpula lacrymans var. lacrymans S7.9  E 12917 5459 42 38 7595 844 643 9 89 338 305 6101946
Sus scrofa 76_10.2 E 25882 18173 70 45 33531 1082 1305 31 97 451 290 13754915
Sarcoptes scabiei E 10471 5724 55 41 9489 930 746 10.2 90 381 285 8712622
Sporotrichum thermophile ATCC 42464  E 8806 5012 57 38 7281 870 673 8.4 88 478 319 6522062
Setaria italica v164 E 40599 22288 55 43 31535 983 805 32.1 97 377 294 9843516
Onchocerca volvulus 22 E 12994 6170 47 37 10647 903 718 11.8 92 389 307 9072757
Hyphopichia burtonii NRRL Y-1933 v1.0 E 6005 3667 61 41 5286 797 610 6.6 85 469 314 5471667
Ictidomys tridecemlineatus 76_2 E 20000 14693 73 45 28276 1076 1305 26.3 96 513 314 14114504
Gasterosteus aculeatus 76_1 E 27576 20165 73 49 39910 1078 1213 37 97 492 329 14304910
Drosophila grimshawi 1.3 E 14986 8609 57 36 15267 970 881 15.7 94 495 313 10213148
Drosophila erecta 1.3 E 15048 8345 55 36 14768 972 879 15.2 93 484 314 10153061
Giardia lamblia 2.3 E 5064 2735 54 29 4240 485 201 8.7 89 621 335 2341020
Gallus gallus 76_4 E 16354 11686 71 44 24444 1055 1234 23.2 96 555 339 13894169
Aspergillus terreus NIH2624  E 10406 6643 64 44 9919 891 720 11.1 91 499 344 7832361
Selaginella moellendorffii  E 34697 21319 61 46 29628 967 800 30.6 97 391 294 9983356
Candida glabrata CBS138 E 5202 3314 64 39 4840 767 620 6.3 84 507 311 5101579
Ashbya gossypii ATCC 10895  E 4703 3026 64 41 4417 765 600 5.8 83 491 311 5031537
Microsporum gypseum  E 8876 4908 55 39 7298 865 635 8.4 88 475 332 6272035
Aspergillus flavus NRRL3357  E 12587 7665 61 45 11216 920 732 12.2 92 459 340 8302499
Magnaporthe grisea 70-15  E 11054 6106 55 38 8868 886 691 10 90 481 331 6742231
Cavia porcellus 76_3 E 19774 14499 73 45 28466 1095 1334 26 96 522 324 14334475
Drosophila willistoni 1.3 E 15513 8518 55 36 15024 975 884 15.4 94 487 316 10323159
Gorilla gorilla 76_3.1 E 27473 19148 70 43 41872 1089 1341 38.4 97 535 331 15184984
Lottia gigantea  E 23851 13143 55 42 22635 1047 987 21.6 95 378 287 12823994
Malassezia globosa CBS 7966  E 8606 5757 67 42 8344 747 513 11.2 91 483 303 4851492
Chlorella variabilis sp. NC64A  E 9791 6410 65 40 8984 910 649 9.9 90 455 281 8142477
Fomitopsis pinicola FP-58527 SS1 v3.0 E 13885 6803 49 36 9217 881 670 10.5 90 404 298 6502133
Papio anubis 76 E 20977 15418 73 44 33684 1092 1344 30.8 97 556 331 14804679
Trichoderma longibrachiatum ATCC 18648 v1.0 E 10792 5568 52 39 7988 885 655 9 89 423 316 6752114
Chaetomium globosum CBS 148.51  E 11124 5942 53 36 8874 863 639 10.3 90 493 336 7092300
Schizosaccharomyces japonicus yFS275  E 4814 3196 66 45 4807 752 549 6.4 84 468 316 5431525
Histoplasma capsulatum class NAmI strain WU24  E 9251 4465 48 35 6328 840 601 7.5 87 426 305 5941957
Phycomyces blakesleeanus  E 14792 6906 47 35 10037 858 681 11.7 91 391 292 7022170
Albugo laibachii 22 E 13804 6173 45 33 10200 818 544 12.5 92 456 336 8252289
Homo sapiens 76_38 E 99458 60672 61 44 115355 1113 1380 103.6 99 373 270 16897644
Pediculus humanus corporis  E 10773 6721 62 39 12641 983 875 12.9 92 514 322 10843019
Helobdella robusta  E 23432 12165 52 35 18915 991 874 19.1 95 375 254 10743579
Tetrahymena thermophila SB210 1  E 24725 11743 47 27 20279 777 439 26.1 96 649 364 7593089
Schistosoma mansoni  E 13191 7056 53 33 11383 900 673 12.6 92 447 278 8472828
Pisolithus tinctorius Marx 270 v1.0 E 22701 6701 30 29 9014 862 638 10.5 90 289 280 6262095
Capitella sp. I  E 32415 18288 56 43 28833 1146 1096 25.2 96 355 269 14454609
Coccidioides posadasii RMSCC 3488  E 9964 4750 48 36 6892 860 654 8 88 415 318 6241965
Bigelowiella natans CCMP2755 22 E 21706 11374 52 32 15466 960 635 16.1 94 442 269 10313466
Sphaerobolus stellatus v1.0 E 35274 12718 36 32 16398 875 672 18.7 95 308 270 7382551
Postia placenta  E 17173 9446 55 36 13067 864 652 15.1 93 458 302 7242483
Leishmania braziliensis MHOM/BR/75/M2904 2.4 E 8310 4333 52 26 6119 697 393 8.8 89 623 307 4671719
Culex pipiens quinquefasciatus  E 18883 11412 60 39 19368 980 854 19.8 95 436 282 10703617
Tarsius syrichta 76_1 E 13675 9553 70 41 19982 989 1076 20.2 95 543 317 12993978
Ixodes scapularis  E 20486 10159 50 43 15525 985 841 15.8 94 284 248 10403204
Micromonas sp. RCC299  E 9815 5829 59 38 8252 898 627 9.2 89 451 289 7422335
Candida parapsilosis  E 5733 3621 63 39 5170 769 583 6.7 85 510 314 5211623
Coccidioides immitis RS  E 9910 4958 50 37 7178 865 666 8.3 88 435 318 6271987
Dipodomys ordii 76_1 E 15853 11285 71 41 23079 1050 1204 22 95 561 326 14494420
Microcebus murinus 76_1 E 16319 11366 70 41 23447 1031 1199 22.7 96 541 319 14164497
Pichia stipitis CBS 6054  E 5839 3738 64 41 5353 795 604 6.7 85 492 315 5361657
Micromonas pusilla CCMP1545 v3.0 E 10672 6004 56 36 8691 892 622 9.7 90 450 291 8032444
Paramecium tetraurelia  E 39525 18956 48 31 28398 744 430 38.2 97 455 298 6992725
Ciona intestinalis 76 E 17302 9140 53 45 15488 956 904 16.2 94 333 287 10753295
Candida lusitaniae ATCC 42720  E 5941 3443 58 38 4925 775 585 6.4 84 462 306 5441624
Paracoccidioides brasiliensis Pb18  E 8741 4243 49 34 6156 847 620 7.3 86 448 313 5981958
Phytophthora infestans T30-4  E 22658 10216 45 35 15000 901 658 16.6 94 392 301 10313066
Ajellomyces dermatitidis SLH14081  E 9555 4757 50 35 6819 873 651 7.8 87 449 315 6242015
Oryza punctata 22 E 41060 22875 56 42 35041 956 785 36.7 97 433 323 11664173
Symbiodinium minutum clade B1 v1.2 E 47014 21997 47 26 34743 942 591 36.9 97 569 314 24146738
Trypanosoma vivax  E 11885 4342 37 25 5931 668 370 8.9 89 434 297 4571641
Thelohanellus kitauei E 15020 4868 32 33 6402 687 349 9.3 89 239 240 4071410
Tuber melanosporum Vittad  E 12826 7043 55 47 10379 858 661 12.1 92 370 314 6652129
Trichophyton tonsurans CBS 112818  E 8521 4735 56 38 6960 857 636 8.1 88 469 325 6191987
Trichophyton rubrum CBS 118892  E 8706 4798 55 39 7040 867 647 8.1 88 463 324 6122007
Thielavia terrestris NRRL 8126  E 9815 5410 55 38 7804 869 685 9 89 465 319 6612101
Trichophyton verrucosum HKI 0517  E 8023 4538 57 38 6707 824 613 8.1 88 488 330 6021954
Trypanosoma brucei TREU927 v4.1 E 9826 4543 46 30 6431 680 386 9.5 89 493 317 4591616
Theobroma cacao B97-61/B2 v1 E 46143 24090 52 46 35581 983 826 36.2 97 384 335 11533867
Sarcophilus harrisii 76_7.0 E 22404 16110 72 44 33499 1070 1257 31.3 97 534 327 14094723
Taenia solium  E 12353 6384 52 33 9785 867 631 11.3 91 410 264 7032510
Thecamonas trahens ATCC 50062  E 10627 6719 63 35 11696 875 571 13.4 93 652 364 10523100
Tetranychus urticae  E 18198 8594 47 39 14047 930 796 15.1 93 356 294 9442966
Triticum aestivum 22 E 98779 57084 58 47 73412 995 804 73.8 99 289 233 9994833
Crassostrea gigas 22 E 26089 15267 59 41 28659 1000 930 28.7 97 447 312 18775312
Pyrenophora teres f. teres 22 E 11799 6373 54 38 9317 899 721 10.4 90 463 326 7172320
Hyaloperonospora arabidopsidis 22 E 14321 5542 39 34 8026 827 569 9.7 90 323 285 7292205
Hebeloma cylindrosporum h7 v2.0 E 15382 6584 43 33 8962 882 662 10.2 90 385 298 6692191
Hanseniaspora valbyensis NRRL Y-1626 v1.1 E 4800 2725 57 38 3790 703 464 5.4 81 443 297 4101351
Oryza nivara 22 E 48361 24630 51 40 38301 957 786 40 98 420 329 11914377
Microbotryum violaceum 22 E 7819 4595 59 34 6642 841 614 7.9 87 537 312 6061942
Xiphophorus maculatus 76_4.4.2 E 20454 15411 75 46 31607 1094 1232 28.9 97 546 331 14204747
Linum usitatissimum v200 E 43484 26434 61 44 37684 955 797 39.5 97 399 289 12794378
Aspergillus niger ATCC 1015  E 8592 5367 62 44 7734 737 521 10.5 90 487 342 5211709
Aureococcus anophagefferens  E 11501 8124 71 40 11868 842 579 14.1 93 522 297 9562727
Aspergillus clavatus NRRL 1  E 9120 5708 63 42 8404 890 716 9.4 89 494 331 6752118
Aspergillus oryzae RIB40  E 12063 7445 62 46 10585 871 723 12.2 92 449 333 7072256
Amanita thiersii Skay4041 v1.0 E 10354 5532 53 38 7697 870 674 8.8 89 422 300 6522034
Anopheles gambiae 49_3j E 13133 8387 64 42 15113 972 867 15.5 94 474 313 10073103
Apis mellifera 38.2d E 27755 16426 59 52 30043 973 819 30.9 97 361 315 10063569
Candida albicans SC5314 E 6165 3795 62 39 5360 797 585 6.7 85 479 300 5231703
Aspergillus nidulans FGSC A4  E 10560 6671 63 43 9710 899 727 10.8 91 487 332 6992279
Aspergillus fumigatus Af293 E 9887 6055 61 42 8819 885 716 10 90 485 330 6982211
Arabidopsis thaliana 10 E 35381 22134 63 45 32197 988 828 32.6 97 409 292 9713391
Aedes aegypti 55 E 16789 10689 64 42 18961 972 881 19.5 95 457 301 10223313
Botrytis cinerea B05.10  E 16448 6236 38 34 8667 865 643 10 90 334 302 6442217
Amanita muscaria Koide v1.0 E 18153 6846 38 34 9417 866 631 10.9 91 327 291 6642185
Octopus bimaculoides 280 E 38585 16722 43 37 38501 1027 919 37.5 97 341 292 12014238
Kluyveromyces lactis E 5076 3213 63 41 4672 770 625 6.1 84 485 313 5071578
Thellungiella halophila v173 E 29284 18789 64 45 26936 963 811 28 96 410 287 9333177
Kluyveromyces waltii E 5214 3239 62 41 4644 763 619 6.1 84 464 305 4921540
Alternaria brassicicola  E 10688 5572 52 37 7936 860 667 9.2 89 444 311 6812232
Arabidopsis lyrata  E 32670 18324 56 44 25968 968 816 26.8 96 360 281 10193395
Leishmania infantum JPCM5 2.4 E 8216 4294 52 26 6092 698 394 8.7 89 628 309 4691700
Loxodonta africana 76_3 E 25635 19349 75 46 37914 1093 1332 34.7 97 541 328 14454913
Laccaria bicolor S238N-H82  E 20614 7654 37 29 10387 869 644 12 92 366 282 6232241
Tremella mesenterica  E 8313 4084 49 32 5807 822 585 7.1 86 465 299 5621787
Glomerella graminicola 22 E 12020 6882 57 40 9866 906 747 10.9 91 465 325 6882296
Myotis lucifugus 76_2.0 E 20719 15276 74 44 29505 1079 1319 27.3 96 511 308 14004533
Lodderomyces elongisporus NRRL YB-4239  E 5799 3506 60 37 5019 771 579 6.5 85 509 309 5261659
Sclerotinia sclerotiorum  E 14522 5852 40 35 8330 874 672 9.5 90 362 312 6532176
Strigamia maritima 22 E 15008 8956 60 41 17237 1009 940 17.1 94 482 332 13823809
Mixia osmundae IAM 14324 v1.0 E 6903 3831 55 36 5708 832 597 6.9 85 499 321 6081872
Echinococcus multilocularis  E 10490 5838 56 33 9809 875 644 11.2 91 499 300 7392471
Mus musculus 76_38 E 52998 34563 65 44 68456 1110 1363 61.7 98 449 301 15726021
Macropus eugenii 76_1.0 E 15342 11173 73 42 22544 1031 1138 21.9 95 557 321 13924395
Medicago truncatula  E 62319 32276 52 43 47289 1009 828 46.9 98 352 296 11434138
Neurospora discreta FGSC 8579  E 9948 4819 48 33 6997 868 684 8.1 88 468 320 6392077
Neurospora tetrasperma  E 10640 4920 46 32 7148 866 685 8.3 88 461 319 6562082
Stagonospora nodorum  E 16597 7261 44 35 10114 907 709 11.2 91 389 312 7002374
Candida guilliermondii ATCC 6260  E 5920 3771 64 42 5339 783 598 6.8 85 466 306 5511657
Neosartorya fischeri NRRL 181  E 10407 6526 63 43 9498 902 731 10.5 91 488 332 7012251
Trichoderma virens Gv29-8  E 11643 7274 62 44 10585 910 710 11.6 91 478 333 7222304
Anolis carolinensis 76_2.0 E 19177 14148 74 46 32447 1064 1250 30.5 97 529 331 13884646
Podospora anserina  E 10614 6003 57 37 8715 905 700 9.6 90 497 321 6982252
Neurospora crassa OR74A  E 9907 5172 52 33 7481 883 694 8.5 88 501 317 6632123
Theileria annulata E 3795 1908 50 28 2784 558 263 5 80 534 301 3151031
Nematostella vectensis 1.0 E 27273 15983 59 47 25640 1087 1040 23.6 96 330 265 14814286
Nectria haematococca mpVI  E 15707 9568 61 41 13156 915 742 14.4 93 479 322 7352409
Nasonia vitripennis  E 9254 6892 74 45 12254 947 831 12.9 92 566 344 10442791
Anopheles darlingi 22 E 11430 6297 55 33 11195 908 771 12.3 92 517 313 10202941
Babesia bovis T2Bo  E 8029 3982 50 30 5734 556 282 10.3 90 487 293 3311057
Trypanosoma congolense 2.4 E 13459 4862 36 26 6657 678 373 9.8 90 410 299 4591688
Trichophyton equinum CBS 127.97  E 8560 4639 54 38 6797 851 627 8 87 458 324 6131967
Ostreococcus sp. RCC809  E 7773 4709 61 44 6487 839 581 7.7 87 383 279 6121898
Schizosaccharomyces octosporus yFS286  E 4925 3275 66 45 4901 760 567 6.4 84 464 316 5461531
Aspergillus tubingensis v1.0 E 12322 7346 60 43 10810 908 730 11.9 92 474 342 7352349
Otolemur garnettii 76_3 E 19986 15044 75 46 31222 1081 1331 28.9 97 539 326 14524540
Pongo abelii 76_2 E 21414 14520 68 44 30666 1096 1337 28 96 501 322 14994694
Ornithorhynchus anatinus 76_5 E 23584 15674 66 45 26519 1035 1183 25.6 96 388 265 12484500
Sorghum bicolor  E 34496 19353 56 40 27504 960 778 28.6 97 408 288 10883695
Oryctolagus cuniculus 76_2 E 20588 15349 75 45 30255 1075 1305 28.1 96 533 322 14254517
Oryzias latipes 76_1 E 24674 17826 72 48 35327 1069 1191 33 97 485 323 14054746
Bombyx mori  E 21302 9434 44 38 13860 910 736 15.2 93 277 235 9933162
Monodelphis domestica 76_5 E 22310 16273 73 46 35980 1087 1300 33.1 97 530 335 14824803
Ochotona princeps 76 E 16006 11228 70 41 22937 1056 1219 21.7 95 552 323 14134437
Coprinopsis cinerea okayama7 130 v3 E 13342 6322 47 32 8840 873 649 10.1 90 462 308 6862175
Oryza sativa ssp. japonica 5.0 E 67393 33278 49 39 52253 978 811 53.4 98 445 352 10924087
Ostreococcus tauri  E 7725 4488 58 43 6339 842 562 7.5 87 387 286 6611921
Monosiga brevicollis  E 9196 6032 66 38 10583 900 654 11.8 91 598 349 10462776
Ostreococcus lucimarinus CCE9901  E 7651 4814 63 45 6729 839 582 8 88 397 286 6221913
Capsella rubella v183 E 28447 18221 64 45 26223 956 809 27.4 96 417 290 9503204
Puccinia graminis f. sp. tritici CRL 75-36-700-3  E 20566 5574 27 21 7463 799 525 9.3 89 368 280 5511871
Gossypium raimondii v221 E 77267 50418 65 44 72637 991 826 73.3 99 426 284 10504363
Solanum tuberosum  E 56218 27976 50 42 37103 940 758 39.5 97 301 253 9113680
Plasmodium falciparum 3D7  E 5385 2735 51 22 4219 664 320 6.4 84 762 327 4071405
Schizosaccharomyces pombe E 5035 3356 67 45 5024 777 590 6.5 85 470 319 5541561
Fragaria vesca  E 34809 17236 50 38 25569 962 783 26.6 96 386 299 13804426
Triticum urartu 22 E 33424 18246 55 43 26044 946 766 27.5 96 363 287 11483856
Fragilariopsis cylindrus E 27143 12412 46 30 16016 908 593 17.6 94 408 265 7262688
Cochliobolus heterostrophus  E 9633 6128 64 44 8812 891 724 9.9 90 473 329 6552184
Emiliania huxleyi CCMP1516  E 39125 20062 51 38 26052 963 617 27.1 96 340 252 13314063
Phaeodactylum tricornutumCCAP 1055/1 E 10402 6099 59 36 8206 858 597 9.6 90 461 285 6282062
Candida tanzawaensis NRRL Y-17324  v1.0 E 5895 3499 59 41 5060 792 593 6.4 84 457 312 5231631
Thalassiosira pseudonana CCMP1335 E 11776 6672 57 32 9040 887 623 10.2 90 496 277 6532268
Caenorhabditis japonica  E 25870 10981 42 37 16701 1053 826 15.9 94 325 283 11953582
Caenorhabditis brenneri  E 30705 13957 45 34 21945 931 757 23.6 96 396 296 10273355
Pristionchus pacificus  E 29639 11691 39 34 16642 901 675 18.5 95 287 248 10173301
Caenorhabditis remanei  E 31476 13851 44 33 21348 996 806 21.4 95 400 299 11183536
Trichoderma atroviride  E 11100 6786 61 42 9662 895 701 10.8 91 471 324 6882223
Capsaspora owczarzaki ATCC 30864  E 8381 5686 68 38 9926 927 745 10.7 91 623 348 9892763
Conidiobolus coronatus NRRL28638 v1.0 E 10635 6161 58 47 8249 827 622 10 90 347 283 5931893
Xenopus laevis  E 33642 25766 77 50 44083 1008 1159 43.7 98 431 279 10713205
Xenopus tropicalis 76_4.2 E 22718 17561 77 47 34966 1072 1241 32.6 97 536 324 14124695
Pan troglodytes 76_2.1.4 E 19907 13866 70 44 30121 1088 1343 27.7 96 526 330 14844514
Sorex araneus 76_1 E 13192 9364 71 41 17972 975 1056 18.4 95 526 304 12313787
Saccharomyces cerevisiae 76 E 6692 3654 55 39 5383 777 664 6.9 86 450 318 5361628
Saccharomyces bayanus MIT E 9385 3756 40 36 5237 760 636 6.9 85 320 285 4951657
Lachancea kluyveri  E 5321 3413 64 40 4954 782 642 6.3 84 497 313 5171624
Saccharomyces mikatae MIT E 9016 3778 42 36 5243 766 636 6.8 85 325 281 5031655
Saccharomyces paradoxus MIT E 8939 3653 41 36 5267 768 647 6.9 85 345 302 5111649
Cyanidioschyzon merolae E 5014 3300 66 40 4769 821 557 5.8 83 503 305 5211658
Dictyostelium purpureum  E 12410 6830 55 36 10688 867 625 12.3 92 482 319 8432520
Glycine max v109 E 55787 36697 66 46 51734 972 823 53.2 98 407 286 10783997
Cryphonectria parasitica  E 11184 6433 58 41 9111 900 702 10.1 90 464 327 6782194
Rhodnius prolixus 22 E 15441 8172 53 42 13419 1023 899 13.1 92 352 279 10853143
Yarrowia lipolytica CLIB122 E 6448 4011 62 40 5760 799 623 7.2 86 487 315 5831719
Mycosphaerella fijiensis CIRAD86  E 10313 5806 56 41 8106 866 686 9.4 89 434 314 6232026
Mycosphaerella graminicola IPO323  E 11395 6017 53 39 8413 886 704 9.5 89 430 316 6592151
Sporobolomyces roseus IAM 13481  E 5536 3557 64 36 5240 797 603 6.6 85 564 320 5261703
Kluyveromyces thermotolerans CBS 6340 E 5092 3305 65 41 4762 776 632 6.1 84 491 312 4971566
Phytophthora capsici  E 17414 9375 54 42 13746 967 761 14.2 93 381 296 12903049
Zygosaccharomyces rouxii  E 4991 3212 64 41 4681 777 629 6 83 496 315 5131559
Amphimedon queenslandica E 30327 17746 59 44 29766 1052 907 28.3 96 392 292 14514678
Solanum lycopersicum v.2.3 E 34727 18730 54 43 25836 996 826 25.9 96 344 276 10103473
Pythium iwayamai DAOM BR242034 22 E 15255 8122 53 35 12072 876 618 13.8 93 445 294 9572878
Atta cephalotes v1.1 E 18177 8155 45 34 13395 990 848 13.5 93 350 269 10683233
Schizophyllum commune  E 13181 6716 51 34 9088 881 678 10.3 90 445 298 6542122
Camponotus floridanus v3.3 E 17064 8093 47 35 14220 991 886 14.3 93 405 302 11583228
Zea mays subsp. mays  E 53764 31014 58 43 41454 963 799 43 98 344 254 11644261
Taeniopygia guttata 76_3.2.4 E 18204 12628 69 47 24785 1052 1199 23.6 96 449 301 13064209
Harpegnathos saltator v3.3 E 18564 7895 43 34 13462 995 880 13.5 93 366 296 11163133
Spizellomyces punctatus DAOM BR117  E 8804 5463 62 39 8537 896 708 9.5 90 519 324 8652402
Pogonomyrmex barbatus v1.2 E 17187 7989 46 36 13350 998 850 13.4 93 367 280 11033278
Wickerhamomyces anomalus E 6423 4035 63 45 5731 816 633 7 86 434 312 5611707
Linepithema humile v1.1 E 16177 8076 50 35 13585 989 871 13.7 93 402 283 11013260
Aspergillus niger 22 E 14068 7314 52 40 10668 889 716 12 92 440 339 6852273
Solenopsis invicta v.2.2.3 E 16522 7597 46 35 12128 929 762 13.1 92 348 264 9632979
Cochliobolus victoriae FI3 v1.0 E 12894 6665 52 39 9568 904 732 10.6 91 431 323 6922316
Babjeviella inositovora NRRL Y-12698 v1.0 E 6403 3706 58 42 5361 804 612 6.7 85 433 313 5481685
Oryza glumaepatula 22 E 46893 23894 51 40 36746 948 781 38.8 97 412 322 11814228
Tulasnella calospora AL13/4D v1.0 E 19659 8623 44 37 11960 867 628 13.8 93 340 288 6682283
Trichoderma citrinoviride v1.0 E 9397 5887 63 41 8491 902 684 9.4 89 488 322 6932153
Cochliobolus carbonum 26-R-13 v1.0 E 12857 6561 51 39 9468 907 732 10.4 90 428 326 6862307
Trichinella spiralis 22 E 16380 6120 37 35 10554 873 666 12.1 92 318 296 9962760
Pythium vexans DAOM BR484 22 E 11958 7185 60 37 11319 893 655 12.7 92 524 325 10272953
Trichoderma harzianum CBS 226.95 v1.0 E 14095 7813 55 41 11261 918 722 12.3 92 440 328 7432366
Leptosphaeria maculans 22 E 12469 5528 44 34 8032 893 694 9 89 418 319 6762242
Lepisosteus oculatus 76 E 22483 16969 75 44 36609 1082 1240 33.8 97 597 349 14964901
Anas platyrhynchos 76_1.0 E 16353 11269 69 45 22616 1041 1184 21.7 95 498 321 13174152
Magnaporthe poae ATCC 64411 22 E 11370 5290 47 33 7433 850 615 8.7 89 433 307 6282066
Metschnikowia bicuspidata NRRL YB-4993 v1.0 E 5851 3333 57 40 4814 789 591 6.1 84 437 310 5251585
Astyanax mexicanus 76 E 23698 17495 74 44 35770 1072 1203 33.4 97 532 318 14615239

Jump to [ Top of page · Model Eukaryotes · Eukaryote strains/versions · Prokaryote strains · Meta-genomics · Pseudogenes · Other ]

Prokaryotes
Genome name Dom No. of sequences No. with assignment % with assign. % total sequence coverage No. of domains assigned No. of supfam.s No. of fam.s Average Supfam. size % produced by duplication Average sequence length Average length matched No. of domain pairs No. of unique architectures
Sphingobium chlorophenolicum L-1 B 4072 2932 72 67 4179 709 539 5.9 83 330 306 4591108
Borrelia recurrentis A1 B 990 618 62 56 932 392 186 2.4 58 334 297 200433
Anaerolinea thermophila UNI-1 B 3166 2183 69 62 3277 670 432 4.9 80 343 310 4491059
Pseudoxanthomonas suwonensis 11-1 B 3070 2175 71 65 3231 726 615 4.5 78 330 303 4801104
Bacillus atrophaeus 1942 B 4186 2660 64 66 3927 761 692 5.2 81 286 296 4721127
Pseudogulbenkiania sp. NH8B B 4012 2877 72 68 4284 771 676 5.6 82 315 298 5111183
Cellulomonas fimi ATCC 484 B 3761 2695 72 63 3856 697 479 5.5 82 339 300 4771155
Nitratifractor salsuginis DSM 16511 B 2088 1421 68 63 2054 612 365 3.4 70 303 281 345812
Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 B 6797 4885 72 66 6858 739 534 9.3 89 320 294 5211376
Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 B 2392 1617 68 64 2272 563 412 4 75 303 288 312734
Mycoplasma fermentans M64 B 1049 561 53 46 791 316 165 2.5 60 314 272 159358
Bartonella clarridgeiae 73 B 1323 911 69 67 1380 512 342 2.7 63 309 299 282595
Pusillimonas sp. T7-7 B 3773 2639 70 67 3851 731 608 5.3 81 315 300 4591055
Planctomyces brasiliensis DSM 5305 B 4750 2919 61 54 4244 687 429 6.2 84 360 315 5121247
Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 B 2205 1630 74 70 2366 632 519 3.7 73 314 296 391832
Isoptericola variabilis 225 B 2881 2097 73 64 3003 636 440 4.7 79 343 303 403989
butyrate-producing bacterium SM4/1 B 1667 871 52 56 1125 384 189 2.9 66 213 226 172499
Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 B 2345 1655 71 66 2510 654 484 3.8 74 314 293 439899
Methylomonas methanica MC09 B 4494 2942 65 59 4467 786 623 5.7 82 328 298 5421308
Sinorhizobium meliloti AK83 B 6510 4480 69 67 6424 776 637 8.3 88 302 292 5161337
Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 B 2450 1677 68 66 2401 657 528 3.7 73 294 284 391850
Thermaerobacter marianensis DSM 12885 B 2327 1677 72 63 2473 660 475 3.7 73 343 302 408970
Streptococcus macedonicus ACA-DC 198 B 1994 1401 70 67 2024 563 406 3.6 72 291 276 320711
Borrelia garinii PBi B 925 584 63 58 898 388 180 2.3 57 325 297 198429
Streptococcus sp. I-G2 B 1834 1279 70 64 1862 551 411 3.4 70 315 287 325719
Geobacillus kaustophilus HTA426 B 3539 2251 64 64 3247 736 635 4.4 77 287 289 4711054
Geobacter metallireducens GS-15 B 3566 2581 72 65 4035 719 517 5.6 82 340 306 5341201
Arthrobacter arilaitensis Re117 B 3436 2312 67 63 3253 643 438 5.1 80 315 294 423959
Gloeobacter violaceus PCC 7421 B 4430 2902 66 62 4184 733 490 5.7 82 312 295 4971205
Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 B 1906 1356 71 68 1927 572 416 3.4 70 283 271 333735
Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 B 1482 1042 70 69 1521 539 309 2.8 65 297 290 289640
Shewanella piezotolerans WP3 B 4933 3039 62 60 4567 763 737 6 83 308 301 5431267
Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 B 852 651 76 72 1039 433 269 2.4 58 336 316 248466
Sphaerochaeta globus str. Buddy B 3017 2118 70 63 3070 590 361 5.2 81 334 300 398890
Streptococcus parasanguinis ATCC 15912 B 2022 1393 69 62 1979 566 422 3.5 71 314 285 329744
Asticcacaulis excentricus CB 48 B 3763 2546 68 62 3680 722 534 5.1 80 334 308 4841123
Chlamydophila pecorum E58 B 988 619 63 57 947 399 208 2.4 58 342 309 213449
Clostridium lentocellum DSM 5427 B 4182 2667 64 58 3888 701 480 5.5 82 319 290 5121141
Treponema azotonutricium ZAS-9 B 3474 2225 64 59 3293 633 370 5.2 81 335 307 4411015
Serratia sp. AS12 B 4952 3650 74 69 5375 829 989 6.5 85 318 299 5811303
Mycoplasma mycoides subsp. capri LC str. 95010 B 924 595 64 49 859 334 183 2.6 61 376 286 171371
Pseudomonas sp. TKP B 6297 4398 70 64 6523 824 793 7.9 87 328 302 5731438
Neisseria lactamica 020-06 B 1972 1322 67 63 1939 625 500 3.1 68 309 289 350779
Halanaerobium hydrogeniformans B 2295 1745 76 69 2657 640 475 4.2 76 328 299 423915
Pseudovibrio sp. FO-BEG1 B 5467 3706 68 64 5333 766 611 7 86 309 293 5091251
Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B B 2482 1644 66 61 2402 641 447 3.7 73 316 289 404856
Pseudoxanthomonas spadix BD-a59 B 3149 2185 69 65 3234 726 598 4.5 78 319 297 4711087
Desulfovibrio aespoeensis Aspo-2 B 3304 2292 69 64 3465 682 443 5.1 80 325 299 4791084
Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 B 6095 4307 71 65 6484 823 794 7.9 87 329 305 5971452
Halomonas elongata DSM 2581 B 3473 2553 74 66 3782 753 704 5 80 337 304 4861139
Acidiphilium cryptum JF-5 B 3559 2487 70 65 3636 714 532 5.1 80 332 310 4631074
Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 B 1972 1262 64 59 1811 574 355 3.2 68 326 298 321720
Ilyobacter polytropus DSM 2926 B 2880 2009 70 66 2978 650 477 4.6 78 306 290 438941
Vibrio vulnificus MO6-24/O B 4562 3067 67 63 4593 796 844 5.8 83 316 296 5571292
Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125 B 3484 2365 68 63 3590 730 681 4.9 80 321 299 5021139
Hahella chejuensis KCTC 2396 B 6773 4043 60 58 6095 834 734 7.3 86 313 303 6481551
Haemophilus ducreyi 35000HP B 1717 1069 62 63 1567 561 504 2.8 64 280 281 318668
Photobacterium profundum SS9 B 5489 3589 65 60 5238 800 845 6.5 85 316 290 5821377
Helicobacter hepaticus ATCC 51449 B 1876 1170 62 60 1656 562 339 2.9 66 298 286 300719
Marinobacter sp. BSs20148 B 3887 2653 68 66 3920 718 642 5.5 82 304 295 5051166
Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 B 4866 3549 73 67 5167 827 966 6.2 84 324 298 5581278
Helicobacter acinonychis str. Sheeba B 1619 951 59 58 1370 503 297 2.7 63 287 283 262589
Bartonella henselae str. Houston-1 B 1488 1000 67 63 1496 530 351 2.8 65 314 294 299643
Rhodanobacter denitrificans B 3824 2584 68 61 3843 760 621 5.1 80 329 299 4911173
Shewanella denitrificans OS217 B 3754 2585 69 61 3901 758 712 5.1 81 340 302 5381213
Ramlibacter tataouinensis TTB310 B 3879 2865 74 69 4251 738 577 5.8 83 322 299 4771164
Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae WSM1271 B 6264 4448 71 68 6298 787 631 8 88 307 294 5001320
Ketogulonicigenium vulgare Y25 B 3213 2322 72 69 3205 660 495 4.9 79 298 283 392949
Micromonospora sp. L5 B 6150 4226 69 62 6157 751 527 8.2 88 338 306 6051436
Rhodospirillum photometricum DSM 122 B 3281 2188 67 61 3302 667 488 5 80 330 301 4421111
Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 B 2546 1778 70 64 2610 647 458 4 75 321 293 413885
Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 B 2100 1530 73 67 2338 622 428 3.8 73 328 300 403853
Spirochaeta thermophila DSM 6192 B 2203 1587 72 63 2380 608 392 3.9 74 351 308 411891
Deinococcus maricopensis DSM 21211 B 3264 2289 70 67 3365 680 503 4.9 80 316 302 4461032
Rhodospirillum rubrum F11 B 3878 2733 70 65 4047 726 566 5.6 82 328 304 5051153
Odoribacter splanchnicus DSM 20712 B 3497 2212 63 53 3268 637 418 5.1 81 362 305 414960
Aeromonas veronii B565 B 4028 2823 70 64 4236 788 818 5.4 81 324 296 5611247
Pedobacter saltans DSM 12145 B 3792 2608 69 61 3926 683 465 5.7 83 362 321 4911104
Rahnella sp. Y9602 B 5111 3627 71 66 5274 824 964 6.4 84 318 297 5591269
Desulfobulbus propionicus DSM 2032 B 3283 2281 69 63 3690 700 481 5.3 81 344 312 5141136
Alicycliphilus denitrificans K601 B 4696 3412 73 67 4930 738 601 6.7 85 324 300 4791182
Simkania negevensis Z B 2512 1290 51 48 1820 535 298 3.4 71 317 298 290710
Eubacterium limosum KIST612 B 4571 2661 58 58 3931 680 449 5.8 83 284 284 4781055
Desulfobacca acetoxidans DSM 11109 B 2866 1910 67 62 2926 640 415 4.6 78 321 300 436965
Ruegeria sp. TM1040 B 3864 2763 72 67 4051 719 562 5.6 82 316 295 4721118
Rothia dentocariosa ATCC 17931 B 2217 1329 60 55 1873 564 351 3.3 70 321 294 315769
Idiomarina loihiensis L2TR B 2628 1921 73 66 2889 685 638 4.2 76 331 299 448992
Rickettsia australis str. Cutlack B 1261 751 60 62 1074 452 231 2.4 58 256 268 217484
Dictyoglomus turgidum DSM 6724 B 1742 1356 78 72 1982 555 381 3.6 72 328 304 348737
Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF B 2906 1938 67 62 2851 670 470 4.3 76 315 291 435975
Methylobacterium chloromethanicum CM4 B 5516 3443 62 61 5125 755 575 6.8 85 309 302 5051312
Anoxybacillus flavithermus WK1 B 2831 1865 66 64 2720 702 572 3.9 74 295 288 439957
Desulfurispirillum indicum S5 B 2571 1833 71 64 2862 648 450 4.4 77 334 300 446964
Deinococcus proteolyticus MRP B 2656 1768 67 62 2537 656 465 3.9 74 314 292 398926
Desulfotomaculum carboxydivorans CO-1-SRB B 2657 1800 68 64 2711 662 499 4.1 76 302 287 447955
Microbacterium testaceum StLB037 B 3676 2587 70 65 3628 659 437 5.5 82 330 304 4221013
Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 B 1447 1035 72 71 1441 504 316 2.9 65 279 278 254599
Rickettsia heilongjiangensis 054 B 1297 739 57 61 1056 454 229 2.3 57 250 268 211490
Krokinobacter sp. 4H-3-7-5 B 2978 1997 67 59 2939 634 403 4.6 78 341 301 405976
Zobellia galactanivorans B 4732 3044 64 60 4550 708 466 6.4 84 351 325 5161208
Rickettsia japonica YH B 971 664 68 64 975 438 228 2.2 55 305 285 210465
Helicobacter felis ATCC 49179 B 1653 1011 61 57 1473 513 304 2.9 65 308 287 269631
Bacteroides helcogenes P 36-108 B 3244 2165 67 59 3270 622 417 5.3 81 365 323 437999
Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 B 1217 739 61 61 1061 449 230 2.4 58 270 273 211483
Paludibacter propionicigenes WB4 B 3020 2056 68 61 3107 631 430 4.9 80 353 316 437998
Ethanoligenens harbinense YUAN-3 B 2701 1812 67 61 2617 625 409 4.2 76 314 287 399904
Carnobacterium sp. 17-4 B 2474 1827 74 69 2662 619 491 4.3 77 304 285 372829
Rickettsia parkeri str. Portsmouth B 1318 743 56 60 1063 452 226 2.4 57 249 267 209491
Leadbetterella byssophila DSM 17132 B 3465 2380 69 61 3481 660 459 5.3 81 349 309 4451026
Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 B 8352 5221 63 55 8267 820 604 10.1 90 373 331 7461903
Bacillus cellulosilyticus DSM 2522 B 4266 2655 62 62 3858 756 617 5.1 80 292 289 5171159
Jannaschia sp. CCS1 B 4283 2998 70 65 4234 733 526 5.8 83 310 289 4561152
Chloroflexus aggregans DSM 9485 B 3731 2646 71 63 4082 717 501 5.7 82 361 321 5231196
Rickettsia philipii str. 364D B 1344 750 56 61 1073 462 231 2.3 57 243 264 212495
Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 B 4131 2941 71 65 4100 680 486 6 83 322 296 4351105
Corynebacterium jeikeium K411 B 2120 1438 68 60 2085 570 376 3.7 73 347 305 337799
Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP B 843 622 74 66 932 422 229 2.2 55 330 297 205442
Coriobacterium glomerans PW2 B 1768 1304 74 65 1926 500 324 3.9 74 347 304 305673
Proteus mirabilis HI4320 B 3662 2484 68 63 3625 786 848 4.6 78 314 290 5141133
Thermosipho africanus TCF52B B 1954 1401 72 67 2015 595 394 3.4 70 309 288 347753
Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A B 4988 2782 56 56 3995 737 612 5.4 82 285 287 4961172
Serratia symbiotica str. 'Cinara cedri' B 672 583 87 78 936 420 386 2.2 55 338 303 240438
Geobacter bemidjiensis Bem B 4057 2851 70 66 4612 725 518 6.4 84 332 312 5501283
Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100 B 4466 2923 65 61 4311 770 649 5.6 82 330 308 5431301
Aliivibrio salmonicida LFI1238 B 3911 2467 63 58 3591 736 745 4.9 80 308 284 4911123
Dictyoglomus thermophilum H-6-12 B 1912 1429 75 71 2068 576 393 3.6 72 318 301 347769
uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 B 776 615 79 72 937 426 263 2.2 55 325 295 225433
Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 B 2028 1485 73 68 2219 596 407 3.7 73 309 289 381805
Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea) B 586 497 85 78 790 375 225 2.1 53 336 308 205381
secondary endosymbiont of Ctenarytaina eucalypti B 918 604 66 74 964 429 405 2.2 55 265 300 244444
Leptolyngbya sp. PCC 7376 B 4228 2657 63 57 4060 723 491 5.6 82 334 301 4711225
Enterococcus sp. 7L76 B 2291 1496 65 62 2147 568 451 3.8 74 285 271 323751
Lactobacillus ruminis ATCC 27782 B 1862 1235 66 65 1788 541 386 3.3 70 292 285 298677
Lactobacillus salivarius CECT 5713 B 1552 1139 73 64 1708 452 354 3.8 74 353 307 299590
Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 B 1284 902 70 67 1302 441 310 3 66 291 276 245515
Lactococcus garvieae ATCC 49156 B 1947 1319 68 64 1879 538 401 3.5 71 290 276 309694
Anabaena sp. 90 B 4511 2676 59 58 3896 726 507 5.4 81 312 304 5151203
Psychromonas sp. CNPT3 B 2580 1830 71 63 2711 686 628 4 75 331 293 433974
Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV B 3711 2158 58 53 3073 655 388 4.7 79 316 287 4151057
Campylobacter sp. 03-427 B 1695 1236 73 65 1748 566 349 3.1 68 319 285 309720
Leptospirillum ferrooxidans C2-3 B 2417 1589 66 64 2400 604 349 4 75 308 300 355845
Leuconostoc sp. C2 B 1855 1332 72 69 1889 543 382 3.5 71 296 285 306677
Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55 B 2650 1952 74 68 2871 667 553 4.3 77 308 284 410916
Serratia plymuthica AS9 B 4952 3650 74 69 5375 829 989 6.5 85 318 299 5811302
Marinitoga piezophila KA3 B 2046 1463 72 64 2129 591 378 3.6 72 335 299 363800
Marinobacter adhaerens HP15 B 4410 2970 67 63 4385 758 667 5.8 83 316 297 5231280
Marinobacter hydrocarbonoclasticus ATCC 49840 B 3784 2596 69 63 3888 744 672 5.2 81 323 298 5071182
Megasphaera elsdenii DSM 20460 B 2219 1581 71 65 2334 603 429 3.9 74 320 292 402823
Melioribacter roseus P3M B 2840 2122 75 67 3280 698 497 4.7 79 355 317 5001118
Thiomonas arsenitoxydans B 3594 2408 67 63 3547 744 580 4.8 79 316 298 4701110
butyrate-producing bacterium SS3/4 B 2977 1765 59 57 2518 596 399 4.2 76 287 278 375840
Melissococcus plutonius DAT561 B 1671 1177 70 67 1759 522 411 3.4 70 307 293 311658
Mesorhizobium opportunistum WSM2075 B 6508 4601 71 69 6507 776 625 8.4 88 303 294 4961324
Mesotoga prima MesG1.Ag.4.2 B 2574 1813 70 65 2567 588 380 4.4 77 324 301 375826
Methylomicrobium alcaliphilum B 3980 2605 65 62 4015 779 611 5.2 81 318 300 5261256
Ralstonia solanacearum B 15 1 7 6 1 1 0 1 0 188 171 02
Ruminococcus bromii B 1811 1160 64 58 1700 521 311 3.3 69 304 277 318682
Methylophaga sp. JAM1 B 3022 2037 67 65 3033 690 570 4.4 77 305 293 4341014
Saprospira grandis str. Lewin B 4251 1917 45 45 2786 644 361 4.3 77 294 293 382988
Micavibrio aeruginosavorus ARL-13 B 2432 1390 57 56 2080 592 398 3.5 72 306 299 353805
Pseudomonas sp. VLB120 B 5479 3637 66 63 5487 808 766 6.8 85 317 301 5571343
Microlunatus phosphovorus NM-1 B 5338 3704 69 62 5120 720 486 7.1 86 322 287 4811284
Modestobacter marinus B 5444 3666 67 63 5111 733 505 7 86 310 291 4881278
Muricauda ruestringensis DSM 13258 B 3432 2295 67 61 3425 666 452 5.1 81 336 305 4771080
Mycobacterium africanum GM041182 B 3830 2716 71 62 3843 661 491 5.8 83 332 290 4291080
[Ruminococcus] torques B 2788 1798 64 60 2648 593 402 4.5 78 305 286 405861
Mycobacterium canettii CIPT 140010059 B 3861 2764 72 61 3946 666 498 5.9 83 345 294 4411087
Mycobacterium chubuense NBB4 B 5843 4033 69 63 5722 712 529 8 88 328 301 5091266
Mycobacterium intracellulare ATCC 13950 B 5144 3696 72 69 5276 664 491 7.9 87 319 305 4361110
Candidatus Cardinium hertigii B 903 525 58 57 792 339 166 2.3 57 299 294 161361
Mycobacterium massiliense str. GO 06 B 2626 2290 87 76 3420 576 458 5.9 83 375 327 391884
Mycobacterium rhodesiae NBB3 B 6147 4355 71 67 6075 704 514 8.6 88 320 300 4761258
Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 B 2236 1412 63 62 2004 565 432 3.5 72 278 273 339739
Cycloclasticus sp. P1 B 2248 1664 74 69 2539 657 542 3.9 74 319 298 409885
Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 B 3471 2313 67 65 3237 683 474 4.7 79 296 291 422992
Mycoplasma bovis HB0801 B 814 520 64 53 745 299 152 2.5 60 350 289 151333
Rubrivivax gelatinosus IL144 B 4693 3340 71 65 4980 801 656 6.2 84 332 304 5411335
Ammonifex degensii KC4 B 2080 1368 66 62 2017 600 409 3.4 70 301 282 367769
Candidatus Koribacter versatilis Ellin345 B 4777 3150 66 58 4722 745 537 6.3 84 352 307 5491371
Treponema brennaborense DSM 12168 B 2531 1758 69 59 2576 601 347 4.3 77 360 305 424907
Vibrio anguillarum 775 B 3732 2496 67 63 3748 761 770 4.9 80 312 295 5381199
Streptococcus agalactiae A909 B 1996 1426 71 65 2024 568 414 3.6 72 305 279 330737
Pirellula staleyi DSM 6068 B 4717 2868 61 51 4181 719 437 5.8 83 375 315 5291268
Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946 B 2265 1592 70 64 2325 599 384 3.9 74 313 287 359823
Rhodothermus marinus DSM 4252 B 2863 2060 72 64 3095 699 520 4.4 77 358 319 4641064
Haliangium ochraceum DSM 14365 B 6719 4297 64 53 6925 784 533 8.8 89 411 343 6701748
Candidatus Sulcia muelleri DMIN B 226 199 88 83 330 187 106 1.8 43 338 317 102174
Burkholderia sp. CCGE1002 B 6889 4837 70 68 7115 830 772 8.6 88 318 307 5621481
Nitrosococcus halophilus Nc4 B 3817 2455 64 61 3632 761 621 4.8 79 309 295 4861191
cyanobacterium UCYN-A B 1199 847 71 66 1264 470 299 2.7 63 323 302 257553
Mycoplasma gallisepticum str. F B 756 478 63 47 695 312 140 2.2 55 382 284 144340
Meiothermus ruber DSM 1279 B 3014 2123 70 67 2987 672 545 4.4 78 309 293 432968
Bacillus pseudofirmus OF4 B 4335 2600 60 61 3752 747 614 5 80 277 282 5031140
Mycoplasma haemocanis str. Illinois B 1156 276 24 28 406 219 91 1.9 46 242 283 96216
Streptococcus mitis B6 B 2003 1393 70 62 1980 560 424 3.5 72 310 278 333726
Sanguibacter keddieii DSM 10542 B 3710 2640 71 61 3704 670 448 5.5 82 343 296 4361060
Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 B 6572 4561 69 63 6586 758 567 8.7 88 335 305 6121513
Acinetobacter oleivorans DR1 B 3874 2643 68 65 3842 717 616 5.4 81 310 294 4451042
Clostridium cellulovorans 743B B 4254 2883 68 63 4544 723 502 6.3 84 339 315 5511243
Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 B 2159 1552 72 68 2340 641 477 3.7 73 307 289 432883
Micromonospora aurantiaca ATCC 27029 B 6222 4230 68 61 6134 746 523 8.2 88 337 304 5921412
Mycoplasma haemofelis Ohio2 B 1524 281 18 22 414 218 91 1.9 47 232 282 101218
Aquifex aeolicus VF5 B 1526 1169 77 71 1730 577 399 3 67 315 290 318717
syncytium symbiont of Diaphorina citri B 372 334 90 78 579 284 192 2 51 365 317 157272
Acinetobacter sp. ADP1 B 3307 2295 69 65 3365 696 594 4.8 79 317 299 4331008
Streptococcus oralis Uo5 B 1905 1285 67 63 1872 566 429 3.3 70 307 286 338728
Mahella australiensis 50-1 BON B 2870 2007 70 64 2940 645 443 4.6 78 325 298 428906
Sphingopyxis alaskensis RB2256 B 3195 2279 71 66 3246 693 507 4.7 79 318 292 4291047
Mycoplasma hyopneumoniae 168 B 693 437 63 48 639 282 125 2.3 56 379 289 141302
Anaplasma phagocytophilum HZ B 1264 643 51 54 955 419 241 2.3 56 264 282 205437
Agrobacterium tumefaciens str. C58 B 5355 3909 73 69 5619 762 640 7.4 86 311 295 4881256
Mycoplasma crocodyli MP145 B 689 470 68 54 695 311 164 2.2 55 370 291 154330
Aster yellows witches'-broom phytoplasma AYWB B 693 399 58 60 587 243 124 2.4 59 255 268 134249
Aromatoleum aromaticum EbN1 B 4576 2816 62 59 4115 719 616 5.7 83 311 299 4911165
Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata) B 595 533 90 82 844 410 377 2.1 51 328 299 214409
Mycoplasma hyorhinis GDL-1 B 647 430 66 56 643 299 141 2.2 53 347 293 144316
Burkholderia xenovorans LB400 B 8702 6136 71 67 8844 825 777 10.7 91 320 306 5831545
Burkholderia thailandensis E264 B 5632 3921 70 63 5842 826 731 7.1 86 345 311 5481480
Mycoplasma leachii 99/014/6 B 905 550 61 52 801 330 181 2.4 59 332 285 167356
Fretibacterium fastidiosum B 1431 901 63 60 1247 447 236 2.8 64 301 285 216529
Parvularcula bermudensis HTCC2503 B 2685 1769 66 60 2586 654 449 4 75 324 296 389935
Methylotenera versatilis 301 B 2764 1995 72 65 3031 703 559 4.3 77 330 298 4341019
Brachyspira murdochii DSM 12563 B 2809 1759 63 55 2485 612 364 4.1 75 330 291 362849
Gallionella capsiferriformans ES-2 B 2894 1988 69 64 3159 674 521 4.7 79 329 305 4481004
Thermincola potens JR B 2949 1972 67 62 2934 667 465 4.4 77 305 285 444983
Dehalogenimonas lykanthroporepellens BL-DC-9 B 1659 1141 69 65 1703 545 314 3.1 68 295 280 310679
Brachyspira pilosicoli 95/1000 B 2299 1509 66 58 2174 594 349 3.7 73 332 295 359810
Herbaspirillum seropedicae SmR1 B 4735 3486 74 66 5173 760 658 6.8 85 342 307 5191235
Prevotella melaninogenica ATCC 25845 B 2296 1464 64 55 2120 562 356 3.8 73 367 315 342802
Bifidobacterium longum subsp. longum JDM301 B 1958 1384 71 61 1995 520 328 3.8 74 360 311 307730
Tsukamurella paurometabola DSM 20162 B 4242 2950 70 64 4172 681 487 6.1 84 321 294 4531081
Mobiluncus curtisii ATCC 43063 B 1909 1228 64 57 1748 538 324 3.2 69 336 298 294719
gamma proteobacterium HdN1 B 3763 2542 68 58 3899 706 603 5.5 82 363 311 4961190
Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 B 4469 2509 56 60 3794 768 802 4.9 80 284 302 4971130
Thiomonas intermedia K12 B 3172 2280 72 66 3353 731 569 4.6 78 324 296 4611069
Arcanobacterium haemolyticum DSM 20595 B 1731 1190 69 61 1682 530 306 3.2 68 331 294 289681
Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 B 2313 1605 69 66 2377 621 434 3.8 74 297 284 389849
Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 B 2188 1548 71 64 2309 624 444 3.7 73 328 295 384845
Ralstonia solanacearum CFBP2957 B 5019 3224 64 60 4788 804 655 6 83 322 302 5201307
Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 B 3512 2189 62 61 3171 686 513 4.6 78 302 295 4181047
Borrelia burgdorferi B31 B 1390 643 46 46 950 388 175 2.4 59 292 291 189438
Bdellovibrio bacteriovorus HD100 B 3586 2117 59 53 3042 673 421 4.5 78 326 293 4141043
Bordetella pertussis Tohama I B 3429 2725 79 73 4077 708 590 5.8 83 327 302 4441002
Bacillus halodurans C-125 B 4052 2713 67 65 3919 758 661 5.2 81 293 286 5111128
Mycoplasma pneumoniae 309 B 707 447 63 50 645 290 148 2.2 55 342 272 140314
Bradyrhizobium japonicum USDA 110 B 8317 5694 68 64 8063 806 651 10 90 317 295 5911564
Mycoplasma putrefaciens KS1 B 650 455 70 57 687 318 170 2.2 54 356 290 160329
Filifactor alocis ATCC 35896 B 1641 1050 64 56 1585 514 319 3.1 68 319 282 305636
Flavobacterium branchiophilum FL-15 B 2872 1797 63 55 2602 640 391 4.1 75 342 302 404917
Hydrogenobaculum sp. HO B 1579 1120 71 67 1641 551 332 3 66 305 286 302675
Flavobacterium columnare ATCC 49512 B 2642 1669 63 56 2415 634 391 3.8 74 339 299 392865
Flavobacterium indicum GPTSA100-9 B 2671 1724 65 57 2528 628 395 4 75 335 298 397893
Flexibacter litoralis DSM 6794 B 3878 2154 56 48 3194 664 395 4.8 79 349 304 4211075
Flexistipes sinusarabici DSM 4947 B 2261 1589 70 64 2366 599 404 3.9 75 319 292 390833
Francisella cf. novicida 3523 B 1854 1279 69 66 1840 580 436 3.2 68 315 300 339728
Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 B 1595 1097 69 69 1582 541 384 2.9 66 284 284 303638
Francisella sp. TX077308 B 1976 1344 68 65 1922 584 439 3.3 70 313 298 347737
Frankia symbiont of Datisca glomerata B 4215 2856 68 61 4067 669 432 6.1 84 329 298 4531175
Frateuria aurantia DSM 6220 B 3101 2204 71 65 3248 720 598 4.5 78 334 306 4641040
Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 B 3759 2471 66 65 3507 750 643 4.7 79 286 285 4761095
Geobacillus thermoleovorans CCB_US3_UF5 B 3881 2234 58 62 3201 734 631 4.4 77 265 287 4571044
Geobacter sulfurreducens KN400 B 3322 2424 73 66 3877 718 500 5.4 81 337 305 5241175
Glaciecola nitratireducens FR1064 B 3654 2467 68 64 3828 730 687 5.2 81 332 313 5141198
Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 B 3195 2061 65 61 2985 658 510 4.5 78 318 301 398972
Gordonia polyisoprenivorans VH2 B 5110 3622 71 64 5234 710 509 7.4 86 340 309 4811236
Granulicella mallensis MP5ACTX8 B 4815 3247 67 59 4943 735 522 6.7 85 376 331 5311284
Haemophilus parainfluenzae T3T1 B 1975 1408 71 66 2066 637 603 3.2 69 313 290 374811
Halanaerobium praevalens DSM 2228 B 2068 1557 75 68 2363 627 442 3.8 73 328 296 423846
candidate division WWE3 bacterium RAAC2_WWE3_1 B 871 526 60 54 761 323 130 2.4 58 308 273 163362
Halobacillus halophilus DSM 2266 B 4126 2517 61 63 3584 727 596 4.9 80 276 284 4811072
Streptococcus intermedius JTH08 B 1702 1267 74 66 1856 528 397 3.5 72 325 290 332693
Helicobacter bizzozeronii CIII-1 B 1971 1112 56 54 1549 524 305 3 66 279 269 265668
Helicobacter cetorum MIT 00-7128 B 1731 1009 58 51 1469 513 304 2.9 65 331 291 267630
Helicobacter cinaedi PAGU611 B 2125 1317 62 59 1828 562 329 3.3 69 299 283 299746
Dehalobacter sp. DCA B 2978 1878 63 60 2731 624 434 4.4 77 293 279 420936
Coprococcus sp. ART55/1 B 2122 1381 65 58 1982 526 315 3.8 73 308 275 301739
Spiribacter sp. UAH-SP71 B 1862 1439 77 72 2163 626 490 3.5 71 323 302 370808
Achromobacter xylosoxidans B 6388 4509 71 67 6496 790 674 8.2 88 318 300 5401318
Methylocystis sp. SC2 B 3666 2353 64 61 3376 715 519 4.7 79 303 287 4471124
Taylorella asinigenitalis MCE3 B 1524 1078 71 65 1657 576 407 2.9 65 328 301 334707
Hydrogenobacter thermophilus TK-6 B 1893 1340 71 68 1937 586 393 3.3 70 294 284 332759
Hyphomicrobium sp. MC1 B 4891 2939 60 61 4219 726 551 5.8 83 289 293 4511204
Tannerella forsythia ATCC 43037 B 3001 1680 56 55 2513 582 363 4.3 77 328 325 359869
Ignavibacterium album JCM 16511 B 3195 2196 69 61 3317 693 447 4.8 79 352 310 4841125
Ketogulonigenium vulgarum WSH-001 B 3054 2200 72 68 3091 641 474 4.8 79 311 292 375901
Polaribacter sp. MED152 B 2635 1818 69 60 2667 626 396 4.3 77 348 304 408922
Gordonia sp. KTR9 B 5154 3545 69 63 5103 693 489 7.4 86 341 311 4661192
Kitasatospora setae KM-6054 B 7566 5137 68 60 7322 758 543 9.7 90 336 298 5991525
Klebsiella oxytoca E718 B 6023 4241 70 68 6100 849 1074 7.2 86 303 292 6021376
Streptomyces cattleya NRRL 8057 = DSM 46488 B 7569 4841 64 62 7129 774 561 9.2 89 313 302 5851508
Candidatus Saccharibacteria bacterium RAAC3_TM7_1 B 920 576 63 61 822 338 154 2.4 59 278 269 174392
Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 B 2967 1954 66 58 2877 646 398 4.5 78 339 297 418967
Lactobacillus amylovorus GRL1118 B 1920 1286 67 64 1838 520 351 3.5 72 294 281 287645
Streptococcus sp. I-P16 B 1896 1326 70 64 1915 566 427 3.4 70 312 287 329742
Tistrella mobilis KA081020-065 B 5783 4192 72 67 6157 752 600 8.2 88 333 308 5271330
Bordetella bronchiseptica RB50 B 4994 3804 76 71 5453 770 640 7.1 86 326 306 4881169
Bordetella parapertussis 12822 B 4185 3261 78 72 4668 752 618 6.2 84 328 303 4711103
Bartonella quintana str. Toulouse B 1142 864 76 69 1325 508 334 2.6 62 333 303 276585
Staphylococcus aureus B 1981 1512 76 66 2375 567 482 4.2 76 360 313 387747
Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 B 4175 2747 66 66 4018 781 712 5.1 81 294 293 4911149
Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 B 4816 3156 66 56 4861 648 474 7.5 87 389 335 5051179
Mycoplasma wenyonii str. Massachusetts B 652 278 43 41 402 205 77 2 49 285 277 86207
Chlamydophila caviae GPIC B 1005 625 62 55 947 406 211 2.3 57 349 307 211453
Chlamydophila pneumoniae TW-183 B 1113 636 57 53 957 404 212 2.4 58 331 308 208452
Chlamydophila abortus S26/3 B 932 613 66 56 931 404 208 2.3 57 358 307 205450
Chlorobium chlorochromatii CaD3 B 1999 1404 70 56 2068 601 385 3.4 71 378 302 357781
Chlamydophila felis Fe/C-56 B 1013 639 63 55 960 406 216 2.4 58 351 306 213456
Chromohalobacter salexigens DSM 3043 B 3298 2423 73 67 3622 740 674 4.9 80 333 305 4851085
Myxococcus fulvus HW-1 B 7284 4446 61 55 7070 799 572 8.8 89 362 327 6701740
Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 B 2620 1703 65 66 2456 646 466 3.8 74 275 278 406889
Planctomyces limnophilus DSM 3776 B 4258 2493 59 51 3669 674 433 5.4 82 360 317 4851164
Acetohalobium arabaticum DSM 5501 B 2282 1566 69 64 2368 632 458 3.7 73 309 288 425870
Clostridium ljungdahlii DSM 13528 B 4184 2816 67 62 4107 713 498 5.8 83 310 285 4951100
Bacillus selenitireducens MLS10 B 3255 2266 70 65 3368 726 587 4.6 78 317 296 4831066
Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 B 4219 3082 73 66 4556 690 437 6.6 85 340 305 5251156
Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 B 2129 1448 68 66 2049 553 388 3.7 73 290 283 316712
Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 B 2601 1782 69 65 2675 676 492 4 75 304 287 454938
Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 B 2620 1897 72 64 2972 631 427 4.7 79 349 308 4461005
Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii CIRM-BIA1 B 2326 1592 68 63 2284 591 384 3.9 74 324 300 348853
Croceibacter atlanticus HTCC2559 B 2701 1802 67 59 2647 624 386 4.2 76 336 298 385897
Cellulomonas flavigena DSM 20109 B 3678 2520 69 61 3614 663 458 5.5 82 336 298 4661112
Candidatus Nitrospira defluvii B 4266 2545 60 60 3920 720 483 5.4 82 302 301 4761146
Leuconostoc gasicomitatum LMG 18811 B 1912 1327 69 67 1912 532 362 3.6 72 296 287 315673
Starkeya novella DSM 506 B 4431 3213 73 68 4613 720 586 6.4 84 316 297 4601155
Amycolatopsis mediterranei U32 B 9228 6733 73 66 9797 795 614 12.3 92 329 299 6801692
Olsenella uli DSM 7084 B 1739 1282 74 65 1887 524 313 3.6 72 341 299 306698
Thermosediminibacter oceani DSM 16646 B 2197 1496 68 65 2251 640 448 3.5 72 299 285 411850
Clostridium acetobutylicum ATCC 824 B 3778 2548 67 63 3700 706 513 5.2 81 310 290 5011093
Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129 B 2272 1456 64 60 2109 596 394 3.5 72 320 298 341809
Chlorobium tepidum TLS B 2245 1420 63 66 2053 608 408 3.4 70 281 293 352801
Candidatus Blochmannia floridanus B 583 518 89 80 813 393 336 2.1 52 335 301 207394
Chlamydia muridarum Nigg B 911 589 65 56 905 390 204 2.3 57 355 309 201431
Corynebacterium efficiens YS-314 B 2994 1919 64 58 2712 628 425 4.3 77 325 295 382943
Synechocystis sp. PCC 6803 B 3575 2323 65 60 3416 709 504 4.8 79 318 292 4521110
Treponema primitia ZAS-2 B 3523 2303 65 58 3354 650 391 5.2 81 344 303 4321030
Saccharophagus degradans 2-40 B 4007 2734 68 58 4230 768 629 5.5 82 364 311 5771309
Shigella dysenteriae Sd197 B 4499 2875 64 64 3995 799 980 5 80 260 261 5201149
Desulfitobacterium hafniense Y51 B 5060 3503 69 62 5055 728 532 6.9 86 319 287 5201187
Clostridium saccharolyticum WM1 B 4154 2898 70 62 4210 710 500 5.9 83 324 287 4871113
Deinococcus geothermalis DSM 11300 B 3054 2144 70 66 3077 683 519 4.5 78 317 296 432997
Meiothermus silvanus DSM 9946 B 3505 2411 69 65 3428 690 566 5 80 310 292 4361017
Butyrivibrio proteoclasticus B316 B 3811 2357 62 55 3414 634 400 5.4 81 343 304 4631027
Niastella koreensis GR20-10 B 7174 4638 65 56 7037 778 533 9 89 367 319 6161532
Brevundimonas subvibrioides ATCC 15264 B 3327 2179 65 62 3149 712 510 4.4 77 314 298 4291065
Thermobispora bispora DSM 43833 B 3546 2535 71 65 3591 679 498 5.3 81 328 297 4531068
Nitrosococcus watsonii C-113 B 2907 1945 67 62 2898 723 572 4 75 324 303 4301033
Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111 B 5497 3831 70 62 5421 726 513 7.5 87 334 299 5391274
Segniliparus rotundus DSM 44985 B 3006 1832 61 59 2637 605 430 4.4 77 315 307 370882
Arcobacter nitrofigilis DSM 7299 B 3126 2173 70 63 3184 660 410 4.8 79 316 287 411965
Desulfarculus baarsii DSM 2075 B 3277 2335 71 66 3616 680 448 5.3 81 336 310 4851113
Erwinia billingiae Eb661 B 4917 3547 72 68 5180 809 949 6.4 84 317 300 5471223
Nitrosomonas sp. Is79A3 B 3372 2057 61 57 3066 706 518 4.3 77 312 290 4331060
Moraxella catarrhalis RH4 B 1886 1185 63 66 1787 597 454 3 67 282 296 359757
'Nostoc azollae' 0708 B 3651 1915 52 60 2833 687 461 4.1 76 258 294 430999
Waddlia chondrophila WSU 86-1044 B 1956 1152 59 52 1687 551 334 3.1 67 341 303 309705
Gallibacterium anatis UMN179 B 2500 1707 68 62 2466 668 665 3.7 73 317 286 405900
Bifidobacterium bifidum S17 B 1783 1206 68 59 1771 523 308 3.4 70 348 305 309729
Candidatus Cloacamonas acidaminovorans B 1815 1184 65 57 1800 554 323 3.2 69 358 311 349730
Selenomonas sputigena ATCC 35185 B 2255 1542 68 60 2197 637 442 3.4 71 335 296 397854
Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 B 4705 3173 67 65 4568 700 497 6.5 85 313 303 4651165
Mycoplasma suis KI3806 B 794 256 32 35 372 204 81 1.8 45 259 280 89208
Nocardia cyriacigeorgica GUH-2 B 5475 3689 67 62 5362 695 499 7.7 87 327 301 4861221
Candidatus Zinderia insecticola CARI B 202 188 93 83 284 172 82 1.7 39 308 275 76162
Desulfococcus oleovorans Hxd3 B 3265 2322 71 61 3500 662 426 5.3 81 354 306 4851085
Achromobacter xylosoxidans A8 B 6815 5053 74 69 7327 791 688 9.3 89 328 304 5421321
Oceanimonas sp. GK1 B 3221 2369 74 67 3544 749 743 4.7 79 322 293 4951093
Oligotropha carboxidovorans OM4 B 3574 2389 67 63 3502 703 516 5 80 312 292 4221048
Truepera radiovictrix DSM 17093 B 2945 2134 72 68 3019 657 500 4.6 78 322 300 421965
Dechloromonas aromatica RCB B 4171 2928 70 64 4544 763 633 6 83 329 300 5061271
Marivirga tractuosa DSM 4126 B 3757 2377 63 55 3683 667 430 5.5 82 356 312 4641137
Desulfotalea psychrophila LSv54 B 3234 2048 63 59 3071 666 444 4.6 78 321 299 4761030
Deinococcus radiodurans R1 B 3167 2139 68 63 2957 683 514 4.3 77 310 287 4211030
Ornithobacterium rhinotracheale DSM 15997 B 2267 1296 57 56 1900 572 363 3.3 70 313 306 330733
Desulfovibrio alaskensis G20 B 3258 2311 71 64 3486 678 460 5.1 81 332 301 4871096
Oscillibacter valericigenes Sjm18-20 B 4721 2595 55 54 3639 647 405 5.6 82 270 263 440982
Owenweeksia hongkongensis DSM 17368 B 3485 2190 63 55 3303 663 403 5 80 349 304 4261039
Geobacillus sp. JF8 B 3586 2301 64 66 3302 739 641 4.5 78 279 289 4621052
Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 B 1629 1157 71 68 1708 558 339 3.1 67 303 288 322705
Paenibacillus mucilaginosus 3016 B 7057 4859 69 64 7332 794 667 9.2 89 328 306 6401472
Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 B 2524 1734 69 64 2592 647 450 4 75 311 288 422894
Desulfotomaculum ruminis DSM 2154 B 3796 2470 65 62 3654 701 514 5.2 81 292 277 4971114
Granulicella tundricola MP5ACTX9 B 4542 2910 64 58 4364 720 497 6.1 84 348 315 5041257
Sulfuricurvum kujiense DSM 16994 B 2798 1953 70 64 2867 624 377 4.6 78 310 286 390923
Rhodopirellula baltica SH 1 B 7325 3305 45 47 4942 707 431 7 86 315 327 5981399
Pantoea sp. At-9b B 5770 4258 74 70 6182 837 978 7.4 86 317 300 5841319
Delftia sp. Cs1-4 B 5861 4246 72 66 6272 803 654 7.8 87 339 308 5441371
Caldicellulosiruptor owensensis OL B 2147 1514 71 64 2260 623 446 3.6 72 326 296 388842
Burkholderia rhizoxinica HKI 454 B 3870 2106 54 59 3286 686 561 4.8 79 287 312 4111080
Rhodococcus equi 103S B 4512 3348 74 69 4862 686 513 7.1 86 336 311 4671164
Burkholderia gladioli BSR3 B 7411 5321 72 65 7900 843 750 9.4 89 344 310 5671528
Clostridium sticklandii DSM 519 B 2573 1824 71 65 2691 655 455 4.1 76 314 287 451957
[Ruminococcus] obeum B 3145 1976 63 58 2849 603 405 4.7 79 302 279 396895
Treponema succinifaciens DSM 2489 B 2608 1529 59 52 2218 577 317 3.8 74 323 289 377839
Paenibacillus polymyxa M1 B 5364 3625 68 63 5448 763 635 7.1 86 323 303 5511297
Bacteroides salanitronis DSM 18170 B 3641 2112 58 53 3122 600 414 5.2 81 340 313 411951
Pantoea vagans C9-1 B 4590 3217 70 69 4687 810 934 5.8 83 304 298 5451237
Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 B 6752 4231 63 52 6270 756 531 8.3 88 382 319 6391565
Enterobacteriaceae bacterium strain FGI 57 B 4323 3226 75 69 4692 831 1033 5.6 82 322 296 5671253
Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa B 1697 1182 70 63 1748 522 322 3.3 70 314 283 295640
Pseudoalteromonas sp. SM9913 B 3712 2463 66 63 3772 742 696 5.1 80 316 302 5191175
Ferrimonas balearica DSM 9799 B 3782 2633 70 62 3910 777 729 5 80 335 300 5181174
Paenibacillus terrae HPL-003 B 5525 3781 68 65 5482 765 635 7.2 86 308 292 5461286
Ehrlichia ruminantium str. Gardel B 950 626 66 57 943 427 241 2.2 55 335 289 215454
Parachlamydia acanthamoebae UV-7 B 2782 1477 53 48 2139 593 347 3.6 72 329 298 346827
Prosthecochloris aestuarii DSM 271 B 2327 1615 69 64 2329 630 420 3.7 73 323 298 383863
Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas B 1105 628 57 58 947 427 249 2.2 55 281 288 216449
Erwinia tasmaniensis Et1/99 B 3622 2486 69 63 3613 781 874 4.6 78 317 291 4991106
Ehrlichia canis str. Jake B 925 627 68 58 945 430 247 2.2 54 341 291 216446
Staphylococcus epidermidis RP62A B 2522 1618 64 64 2402 643 515 3.7 73 288 286 391830
Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 B 4472 3146 70 66 4618 821 926 5.6 82 323 303 5561240
Dehalococcoides ethenogenes 195 B 1580 1050 66 66 1542 502 286 3.1 67 278 277 281607
Spirochaeta caldaria DSM 7334 B 2789 2002 72 62 2971 636 409 4.7 79 352 302 4481015
Chlorobaculum parvum NCIB 8327 B 2043 1481 72 67 2175 629 432 3.5 71 324 299 369837
Thermovibrio ammonificans HB-1 B 1813 1220 67 63 1779 569 377 3.1 68 305 287 328737
Erythrobacter litoralis HTCC2594 B 3011 1980 66 62 2807 663 467 4.2 76 309 293 396945
Shigella boydii CDC 3083-94 B 4557 2797 61 62 3933 815 1005 4.8 79 271 273 5241186
Hippea maritima DSM 10411 B 1677 1263 75 70 1853 581 391 3.2 69 312 290 344730
Vibrio fischeri MJ11 B 4039 2694 67 61 4022 766 778 5.3 81 323 294 5261208
Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 B 4737 3405 72 64 5086 790 636 6.4 84 347 311 5391303
Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 B 1334 771 58 51 1275 400 197 3.2 69 364 322 224507
Borrelia duttonii Ly B 1305 722 55 51 1042 400 189 2.6 62 323 297 198446
Pasteurella multocida subsp. multocida str. 3480 B 2223 1566 70 65 2266 650 635 3.5 71 315 292 387860
Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 B 2466 1733 70 64 2604 649 461 4 75 334 302 412892
Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 B 3565 2373 67 62 3390 691 527 4.9 80 317 294 4251067
Intrasporangium calvum DSM 43043 B 3563 2529 71 64 3617 689 476 5.2 81 337 301 4591123
Oceanithermus profundus DSM 14977 B 2373 1665 70 65 2392 641 507 3.7 73 316 293 387856
Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 B 1881 1319 70 65 1876 540 384 3.5 71 302 281 298675
Ruminococcus albus 7 B 3872 2220 57 51 3227 624 397 5.2 81 323 288 4641024
Pelagibacterium halotolerans B2 B 3881 2749 71 67 3872 713 543 5.4 82 301 287 4261071
Phycisphaera mikurensis NBRC 102666 B 3282 2065 63 56 2937 642 374 4.6 78 349 311 4041025
Prevotella intermedia 17 B 2266 1306 58 53 1882 542 329 3.5 71 321 298 317738
Prevotella denticola F0289 B 2386 1423 60 56 2093 549 339 3.8 74 342 318 343794
Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 B 2209 1573 71 68 2349 648 488 3.6 72 304 289 423869
Marinomonas posidonica IVIA-Po-181 B 3491 2635 75 69 3902 730 642 5.3 81 329 299 4901109
Synechococcus sp. PCC 7502 B 3318 2096 63 62 3126 685 452 4.6 78 300 293 4181039
Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 B 1665 1257 75 63 1913 613 469 3.1 68 361 301 360771
Pseudomonas fulva 12-X B 4461 3200 72 66 4782 775 741 6.2 84 325 299 5371248
Polymorphum gilvum SL003B-26A1 B 4393 3059 70 64 4399 745 594 5.9 83 316 292 4821197
Comamonas testosteroni CNB-2 B 4891 3493 71 66 5049 763 639 6.6 85 321 297 4781255
Novosphingobium sp. PP1Y B 4664 3366 72 66 4787 727 566 6.6 85 332 302 4901189
Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 B 4547 3171 70 63 4752 786 738 6 83 342 308 5611301
Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 B 2162 1327 61 59 1918 521 348 3.7 73 289 279 300666
Sphaerochaeta coccoides DSM 17374 B 1822 1362 75 65 2019 526 332 3.8 74 363 318 333708
Bacteroides fragilis YCH46 B 4625 2701 58 55 4047 658 449 6.2 84 344 322 4841122
Methylobacterium populi BJ001 B 5365 3356 63 61 5028 753 572 6.7 85 310 300 4951302
Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 B 1983 1350 68 61 1951 568 365 3.4 71 321 288 345753
Chlorobium limicola DSM 245 B 2434 1678 69 64 2475 641 430 3.9 74 325 300 392890
Desulfurobacterium thermolithotrophum DSM 11699 B 1509 1129 75 68 1668 547 360 3 67 317 290 322685
Propionibacterium propionicum F0230a B 2938 1954 67 62 2782 618 393 4.5 78 321 299 378877
Providencia stuartii MRSN 2154 B 4099 2750 67 63 3945 799 870 4.9 80 294 278 5081163
Cellulophaga lytica DSM 7489 B 3284 2190 67 59 3225 652 423 4.9 80 347 305 4311016
Terriglobus saanensis SP1PR4 B 4180 2902 69 60 4290 716 483 6 83 364 314 4651172
Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP B 1266 729 58 61 1045 451 228 2.3 57 253 268 213486
Streptococcus parauberis KCTC 11537 B 1868 1400 75 68 1989 550 409 3.6 72 300 273 325708
Taylorella equigenitalis MCE9 B 1556 1112 71 65 1716 580 413 3 66 335 303 327711
Aerococcus urinae ACS-120-V-Col10a B 1726 1271 74 66 1885 519 360 3.6 72 318 287 307662
Syntrophobotulus glycolicus DSM 8271 B 3251 2151 66 61 3096 671 450 4.6 78 304 281 460973
Alteromonas sp. SN2 B 4371 2876 66 61 4325 767 727 5.6 82 327 304 5381272
Sphingobacterium sp. 21 B 5169 3546 69 61 5199 710 511 7.3 86 353 312 5031205
Marinomonas mediterranea MMB-1 B 4121 2905 70 65 4305 767 648 5.6 82 327 299 5201220
Lactobacillus acidophilus 30SC B 2059 1327 64 62 1909 527 347 3.6 72 291 281 293658
Maribacter sp. HTCC2170 B 3411 2310 68 62 3386 663 443 5.1 80 343 313 4761066
Porphyromonas asaccharolytica DSM 20707 B 1699 1156 68 56 1705 525 308 3.2 69 372 309 289696
Fluviicola taffensis DSM 16823 B 4033 2297 57 48 3383 660 395 5.1 80 345 291 4261082
Agrobacterium sp. H13-3 B 5345 3888 73 70 5554 750 626 7.4 86 308 295 4811230
Weeksella virosa DSM 16922 B 2049 1369 67 61 1977 584 365 3.4 70 327 298 335787
Alteromonas macleodii str. 'Deep ecotype' B 3965 2607 66 62 3939 749 700 5.3 81 320 302 5071192
Thermodesulfobium narugense DSM 14796 B 1807 1358 75 70 2011 588 363 3.4 71 320 298 358784
Escherichia fergusonii ATCC 35469 B 4314 3002 70 64 4402 846 1059 5.2 81 319 294 5761295
Methylocella silvestris BL2 B 3818 2610 68 64 3832 746 575 5.1 81 320 298 4701185
Rhodospirillum centenum SW B 4003 2569 64 61 3766 715 576 5.3 81 315 300 4601145
Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 B 2826 1909 68 64 2762 651 498 4.2 76 302 286 393910
Acetobacterium woodii DSM 1030 B 3473 2527 73 64 3755 676 449 5.6 82 330 291 4951082
Phenylobacterium zucineum HLK1 B 3854 2920 76 68 4281 719 550 6 83 334 301 4711150
Megamonas hypermegale B 2109 1393 66 69 1824 521 330 3.5 71 217 228 269671
Haemophilus parasuis SH0165 B 2021 1401 69 66 2028 625 587 3.2 69 296 282 370790
Vibrio splendidus LGP32 B 4432 2992 68 62 4469 777 799 5.8 83 322 295 5341281
Burkholderia phytofirmans PsJN B 7241 5167 71 68 7575 816 765 9.3 89 322 307 5601479
Eubacterium rectale M104/1 B 3206 1829 57 55 2604 622 389 4.2 76 290 281 392905
Cellulophaga algicola DSM 14237 B 4163 2578 62 56 3834 689 449 5.6 82 342 308 4711145
Thermus scotoductus SA-01 B 2458 1763 72 69 2499 631 570 4 75 299 288 399873
Isosphaera pallida ATCC 43644 B 3722 2443 66 54 3809 671 431 5.7 82 416 339 4911240
Streptococcus pasteurianus ATCC 43144 B 1869 1410 75 69 2012 562 417 3.6 72 305 281 330721
Faecalibacterium prausnitzii B 2741 1600 58 57 2319 588 367 3.9 75 290 282 356810
Methylovorus sp. MP688 B 2712 1908 70 67 2879 681 575 4.2 76 315 299 435980
Verrucosispora maris AB-18-032 B 6009 4054 67 62 5862 739 517 7.9 87 328 302 5901398
Sulfurimonas autotrophica DSM 16294 B 2158 1512 70 65 2248 603 357 3.7 73 312 291 362827
Sulfurimonas denitrificans DSM 1251 B 2096 1525 73 65 2250 602 355 3.7 73 324 290 361848
Acidiphilium multivorum AIU301 B 3948 2705 69 65 3897 720 532 5.4 82 322 304 4651107
Acidaminococcus intestini RyC-MR95 B 2401 1488 62 61 2194 568 401 3.9 74 297 292 360757
Acidithiobacillus caldus SM-1 B 3182 1894 60 58 2771 660 473 4.2 76 296 287 391920
Acidithiobacillus ferrivorans SS3 B 3093 2028 66 61 2926 660 503 4.4 77 304 283 402953
Babela massiliensis B 979 611 62 54 896 319 131 2.8 64 333 289 149361
Bacillus licheniformis DSM 13 = ATCC 14580 B 4171 2767 66 66 3961 778 685 5.1 80 291 289 5041149
Listeria innocua Clip11262 B 3043 2106 69 64 3048 681 564 4.5 78 300 278 419955
Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 B 1340 982 73 62 1438 491 316 2.9 66 354 298 285600
Acinetobacter calcoaceticus PHEA-2 B 3599 2553 71 66 3670 715 606 5.1 81 312 291 4301041
Actinoplanes missouriensis 431 B 8124 5520 68 62 7977 786 550 10.1 90 325 297 6681653
Actinoplanes sp. SE50/110 B 8247 5340 65 59 7885 794 544 9.9 90 329 301 6801696
Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K B 1871 1286 69 65 1826 544 411 3.4 70 291 273 303677
Colwellia psychrerythraea 34H B 4909 3103 63 63 4721 765 698 6.2 84 308 307 5571294
Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 B 2028 1385 68 65 1958 554 351 3.5 72 297 284 300733
Advenella kashmirensis WT001 B 3933 2880 73 73 3818 662 521 5.8 83 258 256 3491002
Mycoplasma mobile 163K B 633 438 69 55 660 309 148 2.1 53 370 295 156329
Aequorivita sublithincola DSM 14238 B 3140 2017 64 58 2932 638 385 4.6 78 332 298 412993
Myxococcus xanthus DK 1622 B 7316 4517 62 54 7284 797 570 9.1 89 380 334 6711749
Magnetospirillum magneticum AMB-1 B 4561 2936 64 60 4481 718 534 6.2 84 320 298 5351274
Methylobacillus flagellatus KT B 2753 1968 71 66 2974 685 567 4.3 77 324 298 427966
Moorella thermoacetica ATCC 39073 B 2463 1763 72 66 2581 652 460 4 75 306 281 425909
Alistipes finegoldii DSM 17242 B 3110 1860 60 54 2728 564 369 4.8 79 345 310 385862
Anaerobaculum mobile DSM 13181 B 2017 1476 73 67 2142 622 400 3.4 71 325 297 365799
Butyrivibrio fibrisolvens B 2892 1840 64 61 2526 607 369 4.2 76 276 265 385887
Arcobacter sp. L B 2848 1939 68 61 2876 648 390 4.4 77 320 285 401959
Azospirillum brasilense Sp245 B 7527 4526 60 61 6695 782 630 8.6 88 294 300 5661545
Azospirillum lipoferum 4B B 6093 4103 67 64 6208 781 665 7.9 87 325 307 5751468
Roseobacter litoralis Och 149 B 4537 3171 70 66 4560 728 567 6.3 84 310 293 4681159
Mycoplasma penetrans HF-2 B 1037 598 58 43 843 336 173 2.5 60 386 288 167388
Mesoplasma florum L1 B 680 490 72 58 736 315 165 2.3 57 360 291 164340
Mycoplasma genitalium G37 B 475 367 77 60 543 278 137 2 49 369 287 131288
Mesorhizobium loti MAFF303099 B 7272 4920 68 65 6895 786 630 8.8 89 299 289 5141386
Mycoplasma pulmonis UAB CTIP B 782 501 64 49 725 318 150 2.3 56 371 284 151343
Methylococcus capsulatus str. Bath B 2956 2008 68 61 3053 717 605 4.3 77 332 299 4621047
Geobacillus sp. GHH01 B 3459 2302 67 67 3303 736 656 4.5 78 291 291 4571026
alpha proteobacterium HIMB59 B 1493 1153 77 75 1657 508 332 3.3 69 303 296 265614
Bacillus coagulans 2-6 B 2971 1895 64 66 2741 693 578 4 75 274 285 439953
Bacillus sp. JS B 4239 2657 63 66 3965 764 698 5.2 81 286 301 4881130
Halyomorpha halys symbiont B 825 681 83 79 1076 468 460 2.3 57 316 302 262494
Nitrobacter hamburgensis X14 B 4326 2570 59 56 3695 725 525 5.1 80 306 286 4461131
Neorickettsia sennetsu str. Miyayama B 932 547 59 64 831 407 220 2 51 268 291 191414
Nitrosomonas europaea ATCC 19718 B 2461 1755 71 64 2601 666 521 3.9 74 325 292 406895
Nocardia farcinica IFM 10152 B 5934 3915 66 62 5616 708 516 7.9 87 318 299 4921243
Nitrosospira multiformis ATCC 25196 B 2805 1927 69 63 2910 696 546 4.2 76 327 302 4361014
Bacteriovorax marinus SJ B 3231 1976 61 53 2775 651 391 4.3 77 328 287 401971
Nostoc sp. PCC 7120 B 6129 3639 59 57 5592 784 552 7.1 86 321 309 5711457
Nitrosococcus oceani ATCC 19707 B 3017 2032 67 61 3035 723 583 4.2 76 329 299 4401064
Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 B 2827 1995 71 65 2959 695 566 4.3 77 317 290 433992
Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 B 3937 2805 71 65 3993 707 526 5.6 82 328 301 4591102
alpha proteobacterium HIMB5 B 1431 1062 74 71 1515 525 339 2.9 65 301 290 265616
Belliella baltica DSM 15883 B 3680 2319 63 58 3390 670 460 5.1 80 327 301 4311078
Sodalis glossinidius str. 'morsitans' B 2516 1643 65 61 2369 681 689 3.5 71 287 270 399886
Oceanobacillus iheyensis HTE831 B 3500 2367 68 66 3380 718 589 4.7 79 291 284 4591036
Shigella sonnei Ss046 B 4466 3137 70 66 4439 848 1054 5.2 81 302 282 5591249
Gluconobacter oxydans 621H B 2664 1792 67 62 2593 635 469 4.1 76 327 301 397918
Onion yellows phytoplasma OY-M B 749 489 65 61 694 250 130 2.8 64 276 256 136257
Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 B 2031 1147 56 53 1748 538 292 3.2 69 325 306 314693
Polaromonas sp. JS666 B 5453 3873 71 67 5528 771 628 7.2 86 314 294 5151281
Chlorobium luteolum DSM 273 B 2083 1495 72 65 2223 606 403 3.7 73 336 305 368821
Pelobacter carbinolicus DSM 2380 B 3304 2309 70 66 3550 697 500 5.1 80 321 305 5021098
Bifidobacterium breve ACS-071-V-Sch8b B 1826 1323 72 64 1917 518 315 3.7 73 352 312 307716
Photorhabdus luminescens subsp. laumondii TTO1 B 4683 2959 63 58 4378 801 859 5.5 82 327 301 5191211
Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 B 5619 3759 67 62 5610 814 755 6.9 85 330 307 5691356
Lactobacillus buchneri B 2377 1646 69 65 2317 567 416 4.1 76 309 291 318746
Helicobacter mustelae 12198 B 1398 985 70 63 1443 513 322 2.8 64 332 295 267627
Candidatus Riesia pediculicola USDA B 555 425 77 80 663 322 258 2.1 51 282 296 163316
Candidatus Puniceispirillum marinum IMCC1322 B 2543 1836 72 67 2659 639 460 4.2 76 324 303 380890
Zunongwangia profunda SM-A87 B 4653 2885 62 59 4237 696 475 6.1 84 319 304 4621135
Pantoea ananatis LMG 20103 B 4241 3128 74 69 4560 804 937 5.7 82 324 302 5471251
Clostridiales genomosp. BVAB3 str. UPII9-5 B 1567 1035 66 58 1534 475 276 3.2 69 343 303 281613
Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 B 2138 1426 67 59 2112 572 371 3.7 73 361 319 360792
Lactobacillus fermentum IFO 3956 B 1843 1360 74 67 1912 542 396 3.5 72 304 278 290681
Borrelia turicatae 91E135 B 818 585 72 61 893 380 176 2.4 57 351 299 188423
Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 B 2680 1382 52 59 1957 617 495 3.2 68 239 273 340790
Methylacidiphilum infernorum V4 B 2472 1386 56 62 2049 584 382 3.5 71 279 310 351796
Stenotrophomonas maltophilia K279a B 4386 2886 66 60 4286 760 642 5.6 82 327 298 5081219
Nostoc punctiforme PCC 73102 B 6689 4165 62 59 6706 804 586 8.3 88 348 328 6111598
Bordetella avium 197N B 3381 2428 72 66 3544 729 602 4.9 79 325 300 4591046
Desulfatibacillum alkenivorans AK-01 B 5252 3600 69 60 5757 738 472 7.8 87 359 315 6171425
Cellvibrio japonicus Ueda107 B 3750 2529 67 60 3974 746 644 5.3 81 366 324 5791261
Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 B 2710 1908 70 63 2923 685 449 4.3 77 350 314 4241014
Rhizobium etli CIAT 652 B 6056 4216 70 67 6043 777 634 7.8 87 304 291 5031317
Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel B 1275 776 61 54 1130 437 251 2.6 61 316 280 220483
Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1 B 2707 1809 67 62 2663 632 413 4.2 76 317 295 387917
Sphingobium japonicum UT26S B 4394 2775 63 62 4000 723 537 5.5 82 302 295 4591122
Borrelia hermsii DAH B 877 614 70 61 924 381 183 2.4 59 345 299 188429
Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 B 2089 1210 58 56 1816 532 347 3.4 71 323 310 321717
Mycoplasma arthritidis 158L3-1 B 631 389 62 46 578 281 128 2.1 51 383 284 138297
Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 B 5896 4129 70 66 5967 801 706 7.4 87 322 304 5191352
Candidatus Phytoplasma mali B 479 325 68 62 505 236 111 2.1 53 318 292 127236
Geobacter lovleyi SZ B 3685 2586 70 64 4053 708 483 5.7 83 331 302 5301185
Dehalobacter sp. CF B 2980 1882 63 60 2736 626 434 4.4 77 295 280 423933
butyrate-producing bacterium SSC/2 B 2767 1775 64 61 2591 596 396 4.3 77 293 281 384861
Rivularia sp. PCC 7116 B 6644 4091 62 58 6410 798 564 8 88 342 321 6291579
Bacteroides uniformis B 11 6 55 39 7 6 0 1.2 14 285 204 17
Actinomyces sp. F0330 B 3019 1899 63 56 2602 594 374 4.4 77 322 285 344915
Weissella koreensis KACC 15510 B 1357 950 70 66 1410 471 297 3 67 300 282 261545
Terriglobus roseus DSM 18391 B 4245 2856 67 60 4325 707 477 6.1 84 360 320 4781189
Arthrobacter sp. Rue61a B 4575 3309 72 66 4650 688 487 6.8 85 330 300 4541171
Bacillus sp. 1NLA3E B 4410 2875 65 64 4139 764 631 5.4 82 291 287 5071175
Thermodesulfobacterium sp. OPB45 B 1596 1187 74 68 1758 582 356 3 67 318 292 344735
Chloroflexus sp. MS-G B 3777 2692 71 64 4041 713 496 5.7 82 349 313 5111204
Spirochaeta africana DSM 8902 B 2782 1911 69 58 2904 638 386 4.6 78 367 311 4361030
Nostoc sp. PCC 7524 B 5449 3358 62 57 5200 785 547 6.6 85 336 312 5831414
Pseudanabaena sp. PCC 7367 B 3854 2447 63 58 3696 712 468 5.2 81 328 301 4491176
Ilumatobacter coccineus B 4291 3115 73 62 4414 703 436 6.3 84 348 297 4871172
candidate division SR1 bacterium RAAC1_SR1_1 B 1059 553 52 44 822 349 125 2.4 58 336 284 170402
Enterobacter sp. R4-368 B 4827 3373 70 66 4943 821 1013 6 83 309 294 5691266
Candidatus Saccharimonas aalborgensis B 1034 602 58 55 868 353 152 2.5 59 294 277 176417
Turneriella parva DSM 21527 B 4139 2491 60 53 3486 702 393 5 80 324 284 4401119
Roseburia hominis A2-183 B 3362 2125 63 58 3074 637 417 4.8 79 314 288 426975
Solibacillus silvestris StLB046 B 3823 2523 66 65 3547 714 571 5 80 285 279 4531039
Carnobacterium sp. WN1359 B 2275 1633 72 68 2366 593 441 4 75 300 284 356768
Corynebacterium pseudotuberculosis 316 B 2106 1358 64 62 1960 569 380 3.4 71 313 301 332774
Tetragenococcus halophilus NBRC 12172 B 2555 1814 71 67 2546 603 461 4.2 76 287 273 360803
Corynebacterium resistens DSM 45100 B 2171 1458 67 59 2101 576 370 3.6 73 350 308 331808
Corynebacterium ulcerans 0102 B 2349 1475 63 58 2110 590 387 3.6 72 320 297 339800
Corynebacterium variabile DSM 44702 B 3039 2030 67 61 2898 609 410 4.8 79 329 301 373917
Cronobacter sakazakii ES15 B 3916 2794 71 66 4109 807 970 5.1 80 318 295 5471205
Cupriavidus necator N-1 B 7832 5675 72 70 8063 803 717 10 90 312 300 5311438
Cyclobacterium marinum DSM 745 B 5000 3223 64 58 4721 715 470 6.6 85 357 320 4941253
Dechlorosoma suillum PS B 3443 2446 71 65 3792 713 576 5.3 81 332 303 4781115
Deinococcus gobiensis I-0 B 4326 2614 60 60 3642 712 518 5.1 80 286 282 4571104
Desulfitobacterium dehalogenans ATCC 51507 B 4011 2639 66 62 3855 707 510 5.5 82 302 284 4791094
Geitlerinema sp. PCC 7407 B 3815 2464 65 60 3902 725 519 5.4 81 341 318 4761229
Desulfomonile tiedjei DSM 6799 B 5494 3472 63 61 5519 722 481 7.6 87 326 315 5651373
Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 B 4505 2870 64 61 4292 724 528 5.9 83 299 287 5171179
Desulfosporosinus orientis DSM 765 B 5242 3576 68 64 5422 735 538 7.4 86 312 294 5461250
Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay B 3725 2498 67 63 3858 704 474 5.5 82 318 300 5161176
Eggerthella sp. YY7918 B 2680 1870 70 61 2790 561 354 5 80 341 297 373829
Enterobacter aerogenes KCTC 2190 B 4912 3551 72 68 5163 844 1055 6.1 84 312 295 5801284
Enterobacter asburiae LF7a B 4612 3353 73 68 4895 826 1026 5.9 83 318 296 5711255
Enterobacter cloacae subsp. dissolvens SDM B 4542 3369 74 68 4959 830 1022 6 83 321 295 5681272
Enterococcus faecalis 62 B 3075 1957 64 60 2824 634 539 4.5 78 295 277 398881
Enterococcus faecium Aus0004 B 2932 1845 63 59 2616 586 491 4.5 78 292 273 356819
Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 B 9107 6134 67 64 8874 786 608 11.3 91 315 300 6491685
Enterococcus hirae ATCC 9790 B 2755 1617 59 58 2289 586 473 3.9 74 275 273 347789
Erwinia sp. Ejp617 B 3672 2390 65 62 3458 779 853 4.4 77 302 287 4821097
Ruminococcus sp. B 3240 1927 59 60 2685 616 386 4.4 77 261 262 374914
Actinoplanes sp. N902-109 B 8212 5528 67 63 8522 781 550 10.9 91 336 313 7001668
Escherichia blattae DSM 4481 B 3904 2771 71 67 4058 798 961 5.1 80 312 294 5411182
Microcoleus sp. PCC 7113 B 6441 3875 60 58 6210 795 557 7.8 87 336 322 5841620
Hydrogenobaculum sp. SN B 1575 1114 71 67 1633 551 331 3 66 304 287 301672
Sphingomonas sp. MM-1 B 4361 2989 69 63 4236 720 556 5.9 83 316 290 4501138
Streptomyces bingchenggensis BCW-1 B 10022 7068 71 65 10733 780 610 13.8 93 343 316 6841807
Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A B 1010 649 64 58 1012 429 193 2.4 58 346 312 227482
Fervidobacterium pennivorans DSM 9078 B 1947 1446 74 66 2093 595 407 3.5 72 336 299 355785
beta proteobacterium CB B 2112 1494 71 70 2199 642 489 3.4 71 299 294 372832
Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 B 3085 1829 59 49 2653 598 348 4.4 77 376 313 417956
Acidovorax citrulli AAC00-1 B 4709 3140 67 60 4620 776 615 6 83 337 303 5111252
Pectobacterium sp. SCC3193 B 4705 3179 68 65 4595 823 922 5.6 82 311 297 5621260
Streptococcus thermophilus LMD-9 B 1711 1121 66 67 1622 528 397 3.1 67 278 284 307651
Clostridium thermocellum ATCC 27405 B 3173 2073 65 59 3212 670 471 4.8 79 334 300 5191078
Pseudomonas mendocina ymp B 4594 3260 71 65 4921 789 756 6.2 84 328 301 5631310
Streptococcus pyogenes str. Manfredo B 1745 1190 68 65 1712 545 394 3.1 68 293 279 311672
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365 B 1708 1107 65 66 1598 506 325 3.2 68 278 282 275605
Lactobacillus brevis ATCC 367 B 2218 1514 68 64 2093 556 406 3.8 73 293 276 301705
Magnetococcus marinus MC-1 B 3716 2450 66 56 4022 698 485 5.8 83 365 313 5091202
Hyphomonas neptunium ATCC 15444 B 3505 2449 70 65 3459 702 496 4.9 80 318 295 4191068
Anaeromyxobacter sp. Fw109-5 B 4466 3113 70 60 4779 753 531 6.3 84 353 306 5601389
Arthrobacter aurescens TC1 B 4588 3247 71 64 4569 692 481 6.6 85 332 301 4521159
Kineococcus radiotolerans SRS30216 B 4681 3164 68 63 4478 687 467 6.5 85 318 296 4531148
Mycobacterium avium 104 B 5120 3539 69 66 4983 659 490 7.6 87 315 301 4291101
Thauera sp. MZ1T B 3978 2765 70 62 4169 772 653 5.4 81 340 302 5181239
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 B 4639 3040 66 64 4417 833 1028 5.3 81 294 288 5481241
Gloeocapsa sp. PCC 7428 B 5011 3349 67 64 5104 776 561 6.6 85 323 310 5451362
Agrobacterium vitis S4 B 5389 3939 73 66 5726 762 613 7.5 87 332 300 5001311
Halothermothrix orenii H 168 B 2342 1676 72 66 2498 635 467 3.9 75 317 293 417891
Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 B 2666 1724 65 60 2539 651 455 3.9 74 312 292 409892
Streptococcus uberis 0140J B 1762 1327 75 70 1927 560 410 3.4 71 304 285 328708
Dickeya dadantii Ech703 B 3970 3040 77 71 4522 775 898 5.8 83 334 309 5501214
Desulfovibrio magneticus RS-1 B 4700 2974 63 59 4694 717 459 6.5 85 327 305 5221302
Persephonella marina EX-H1 B 2051 1418 69 65 2084 626 401 3.3 70 304 286 361823
Lactobacillus rhamnosus Lc 705 B 2957 1907 64 62 2675 593 437 4.5 78 291 280 349813
Staphylococcus carnosus subsp. carnosus TM300 B 2461 1756 71 67 2489 662 530 3.8 73 297 280 386865
Wolbachia sp. wRi B 1150 708 62 56 1067 437 250 2.4 59 325 296 223484
Beutenbergia cavernae DSM 12333 B 4197 3184 76 66 4453 675 451 6.6 85 342 296 4531083
Hirschia baltica ATCC 49814 B 3187 2232 70 64 3194 697 506 4.6 78 330 300 4401050
Chitinophaga pinensis DSM 2588 B 7192 4702 65 57 7321 774 523 9.5 89 373 323 6261529
Geobacter daltonii FRC-32 B 3798 2693 71 65 4280 711 492 6 83 339 311 5371222
Streptococcus sanguinis SK36 B 2270 1547 68 62 2204 598 454 3.7 73 310 282 361798
Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 B 2446 1608 66 58 2321 617 362 3.8 73 333 296 365831
Herminiimonas arsenicoxydans B 3294 2214 67 64 3255 710 584 4.6 78 304 290 4351047
Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica) B 976 792 81 76 1234 498 357 2.5 60 313 293 285543
Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703 B 1632 1172 72 62 1713 496 307 3.5 71 369 317 292683
Yersinia pestis Pestoides F B 4068 2830 70 64 4147 810 934 5.1 80 317 293 5291227
Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA B 937 766 82 77 1186 494 353 2.4 58 309 290 273525
Rhodopseudomonas palustris BisA53 B 4878 3218 66 60 4659 758 581 6.1 84 322 294 4981277
Burkholderia cenocepacia HI2424 B 6919 5034 73 68 7307 825 746 8.9 89 324 305 5561447
Mycobacterium ulcerans Agy99 B 4241 2831 67 60 4097 656 493 6.2 84 332 299 4271071
Haemophilus somnus 129PT B 1798 1281 71 65 1942 594 573 3.3 69 328 298 348760
Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 B 2865 2092 73 65 3160 734 600 4.3 77 344 305 4811096
Candidatus Carsonella ruddii PV B 182 150 82 79 202 136 58 1.5 33 274 264 45129
Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 B 5279 3595 68 60 5690 767 522 7.4 87 374 330 6271461
Thermotoga lettingae TMO B 2040 1601 78 71 2289 604 422 3.8 74 328 298 370786
Citrobacter koseri ATCC BAA-895 B 5006 3200 64 66 4711 827 1049 5.7 82 289 300 5721267
Genome sequence of Rhizobium sp. strain IRBG74 B 5478 3813 70 69 5458 751 626 7.3 86 297 295 4831217
Bordetella petrii DSM 12804 B 5027 3687 73 68 5242 752 646 7 86 317 292 4871171
Clostridium phytofermentans ISDg B 3902 2784 71 62 4082 695 482 5.9 83 338 292 4921133
Sorangium cellulosum 'So ce 56' B 9380 5875 63 52 9286 835 562 11.1 91 401 332 7732072
Salinispora arenicola CNS-205 B 4917 3394 69 63 4946 726 484 6.8 85 337 309 5091267
Bacillus weihenstephanensis KBAB4 B 5653 3483 62 61 4921 786 677 6.3 84 281 280 5031195
Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 B 6041 3539 59 58 5047 805 846 6.3 84 286 284 5591344
Solitalea canadensis DSM 3403 B 4310 2776 64 56 4119 712 490 5.8 83 350 306 4961164
Alkaliphilus oremlandii OhILAs B 2836 1934 68 62 2875 641 436 4.5 78 309 282 426944
Gemmatimonas aurantiaca T-27 B 3935 2709 69 60 4042 735 473 5.5 82 361 312 4821221
Nautilia profundicola AmH B 1730 1245 72 66 1765 558 328 3.2 68 300 275 294709
Desulfomicrobium baculatum DSM 4028 B 3436 2464 72 65 3912 695 457 5.6 82 342 309 5111151
Arthrobacter chlorophenolicus A6 B 4590 3014 66 62 4237 697 479 6.1 84 321 301 4641151
Methylobacterium nodulans ORS 2060 B 8308 4669 56 59 6741 792 641 8.5 88 284 297 5481430
Mycoplasma hominis ATCC 23114 B 523 361 69 54 550 261 123 2.1 53 373 292 136275
Streptococcus mutans NN2025 B 1893 1383 73 68 1988 564 406 3.5 72 303 284 336736
Coraliomargarita akajimensis DSM 45221 B 3120 2017 65 57 3020 666 421 4.5 78 359 318 4481013
Robiginitalea biformata HTCC2501 B 3205 2120 66 61 3125 657 432 4.8 79 336 309 4311024
Rhodobacter capsulatus SB 1003 B 3642 2515 69 64 3661 709 536 5.2 81 320 298 4581113
Thermoanaerobacter italicus Ab9 B 2270 1613 71 67 2412 649 481 3.7 73 308 289 433893
Bacillus megaterium DSM 319 B 5100 3230 63 65 4612 774 674 6 83 272 280 5061172
Rothia mucilaginosa DY-18 B 1904 1133 60 48 1644 549 338 3 67 383 309 309742
Xanthomonas albilineans GPE PC73 B 3208 2179 68 64 3442 703 596 4.9 80 350 328 4881093
Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 B 2489 1734 70 67 2533 646 511 3.9 74 301 288 394835
Thermomonospora curvata DSM 43183 B 4890 3309 68 62 4675 726 505 6.4 84 321 296 5041227
Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 B 2710 1938 72 67 2866 671 554 4.3 77 305 285 414927
Blattabacterium sp. (Blattella germanica) str. Bge B 590 499 85 78 814 385 233 2.1 53 343 316 215386
Cronobacter turicensis z3032 B 4452 2961 67 65 4321 815 978 5.3 81 302 295 5551238
Rickettsia massiliae MTU5 B 980 706 72 63 1026 441 230 2.3 57 326 283 215483
Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith' B 1343 723 54 61 1037 460 229 2.3 56 237 267 215491
Desulfovibrio piezophilus B 3353 2313 69 65 3588 677 447 5.3 81 323 305 4921092
Shewanella sediminis HAW-EB3 B 4497 3237 72 64 4828 761 752 6.3 84 339 300 5511268
Bacillus pumilus SAFR-032 B 3679 2436 66 66 3556 739 636 4.8 79 291 292 4771063
Brucella suis ATCC 23445 B 3240 2128 66 68 3055 683 548 4.5 78 285 294 394983
Rickettsia canadensis str. McKiel B 1089 633 58 63 941 431 219 2.2 54 264 288 208445
Rickettsia bellii OSU 85-389 B 1475 872 59 58 1214 471 244 2.6 61 276 270 222526
Exiguobacterium sp. MH3 B 3203 2147 67 65 3042 688 524 4.4 77 289 279 429953
Arcobacter butzleri RM4018 B 2259 1599 71 63 2313 607 376 3.8 74 321 284 348820
Frankia sp. EAN1pec B 7191 5033 70 61 7081 722 494 9.8 90 347 301 5451470
Dinoroseobacter shibae DFL 12 B 4192 2890 69 63 4142 740 558 5.6 82 315 290 4641172
Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 B 2051 1395 68 62 2020 570 435 3.5 72 313 285 352750
Shewanella pealeana ATCC 700345 B 4241 2959 70 62 4401 761 748 5.8 83 338 299 5341244
Bartonella tribocorum CIP 105476 B 2087 1247 60 55 1806 546 361 3.3 70 308 285 312674
Chloroflexus aurantiacus J-10-fl B 3853 2787 72 64 4284 726 496 5.9 83 365 322 5341245
Campylobacter concisus 13826 B 1989 1203 60 57 1685 544 320 3.1 68 296 280 279705
Petrotoga mobilis SJ95 B 1898 1421 75 69 2086 602 400 3.5 71 338 310 375762
Brucella canis ATCC 23365 B 3249 2154 66 68 3105 684 555 4.5 78 287 296 403983
Rickettsia akari str. Hartford B 1257 717 57 62 1026 447 229 2.3 56 247 267 206481
Azorhizobium caulinodans ORS 571 B 4717 3506 74 67 5060 746 580 6.8 85 340 305 5061261
Burkholderia multivorans ATCC 17616 B 6111 4345 71 66 6340 818 729 7.8 87 323 301 5351388
Roseiflexus castenholzii DSM 13941 B 4330 3106 72 62 4589 722 497 6.4 84 361 313 5361277
Lactobacillus helveticus DPC 4571 B 1610 1085 67 61 1589 494 329 3.2 69 317 289 277594
Kribbella flavida DSM 17836 B 6943 5124 74 65 7174 747 549 9.6 90 325 289 5871392
Xenorhabdus bovienii SS-2004 B 4256 2340 55 60 3619 761 796 4.8 79 282 310 4831112
Streptococcus gallolyticus UCN34 B 2223 1604 72 66 2272 590 429 3.9 74 305 279 349773
Streptomyces scabiei 87.22 B 8746 5873 67 62 8505 786 596 10.8 91 334 306 6771692
Mycobacterium tuberculosis B 3994 2814 70 61 3984 669 498 6 83 335 290 4441106
Geodermatophilus obscurus DSM 43160 B 4810 3255 68 64 4600 725 517 6.3 84 311 294 4881256
Streptobacillus moniliformis DSM 12112 B 1442 947 66 60 1463 466 279 3.1 68 338 308 268572
Shewanella violacea DSS12 B 4346 2721 63 60 4087 777 735 5.3 81 311 299 5431235
Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894 B 3443 2303 67 59 3269 648 440 5 80 336 297 4251021
Gardnerella vaginalis 409-05 B 1263 838 66 57 1253 444 255 2.8 65 362 313 240552
Aminobacterium colombiense DSM 12261 B 1876 1331 71 66 1972 553 359 3.6 72 318 297 344711
Pectobacterium wasabiae WPP163 B 4437 3068 69 65 4454 824 922 5.4 81 320 302 5571241
Deferribacter desulfuricans SSM1 B 2374 1699 72 64 2555 638 428 4 75 326 292 419919
Thermocrinis albus DSM 14484 B 1593 1189 75 71 1726 583 388 3 66 301 285 311724
Spirosoma linguale DSM 74 B 6938 4432 64 57 6634 756 520 8.8 89 354 318 5791492
Bifidobacterium dentium Bd1 B 2127 1486 70 61 2122 520 323 4.1 75 355 311 300737
Erwinia pyrifoliae Ep1/96 B 3697 2438 66 61 3516 781 854 4.5 78 310 286 4861112
Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 B 2255 1496 66 64 2178 613 589 3.6 72 296 287 382815
Thioalkalivibrio sp. K90mix B 2855 1955 68 64 2864 693 533 4.1 76 311 288 417990
Prevotella ruminicola 23 B 2763 1926 70 58 2870 590 386 4.9 79 386 324 402937
Sphaerobacter thermophilus DSM 20745 B 3485 2499 72 67 3563 688 466 5.2 81 327 304 4241051
Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 B 3849 2488 65 62 3541 692 532 5.1 80 311 299 4431064
Delftia acidovorans SPH-1 B 6040 4215 70 64 6264 800 656 7.8 87 335 306 5401374
Serratia proteamaculans 568 B 4942 3689 75 68 5348 844 995 6.3 84 322 295 5791299
Sphingobium sp. SYK-6 B 4062 2741 67 63 3887 701 512 5.5 82 317 295 4421089
Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 B 3507 2507 71 68 3333 612 415 5.4 82 270 256 386969
Corynebacterium urealyticum DSM 7109 B 2021 1359 67 59 1952 561 371 3.5 71 350 306 320779
Leptothrix cholodnii SP-6 B 4363 3224 74 65 4867 791 641 6.2 84 344 305 5251324
Xylella fastidiosa M23 B 2201 1371 62 61 2090 631 492 3.3 70 309 305 389824
Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350 B 7136 4925 69 62 7350 763 564 9.6 90 351 316 6181543
Caulobacter sp. K31 B 5438 3791 70 64 5408 756 597 7.2 86 317 293 5071266
Exiguobacterium sibiricum 255-15 B 3015 2064 68 65 2955 690 529 4.3 77 294 279 424952
Methylobacterium sp. 4-46 B 6692 4315 64 63 6343 787 638 8.1 88 313 307 5481443
Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C B 2157 1468 68 63 2180 619 415 3.5 72 309 285 400831
Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 B 6431 4141 64 64 6089 779 609 7.8 87 304 301 5201398
Leuconostoc citreum KM20 B 1820 1306 72 68 1887 532 368 3.5 72 307 290 304675
Lysinibacillus sphaericus C3-41 B 4771 2899 61 61 4042 750 576 5.4 81 269 269 4811145
Acaryochloris marina MBIC11017 B 8383 4347 52 55 6445 786 560 8.2 88 276 295 5691505
Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 B 2239 1605 72 68 2385 649 485 3.7 73 304 287 422873
Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)' B 3725 2376 64 56 3432 675 392 5.1 80 328 290 4231121
Microcystis aeruginosa NIES-843 B 6312 2914 46 52 4098 714 499 5.7 83 250 279 4831150
Azoarcus sp. KH32C B 5188 3828 74 67 5846 784 674 7.5 87 341 310 5681419
Shewanella woodyi ATCC 51908 B 4880 3318 68 60 4988 805 773 6.2 84 344 303 6051384
Thiocystis violascens DSM 198 B 4330 2849 66 59 4335 762 630 5.7 82 329 293 5271289
Caulobacter segnis ATCC 21756 B 4139 3000 72 67 4321 700 561 6.2 84 325 302 4531132
Sideroxydans lithotrophicus ES-1 B 2980 2036 68 64 3082 714 550 4.3 77 307 289 4891057
Lactobacillus johnsonii FI9785 B 1735 1177 68 63 1698 498 327 3.4 71 302 283 272608
Kyrpidia tusciae DSM 2912 B 3150 2154 68 65 3103 698 500 4.4 78 303 288 4431014
Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 B 2832 2100 74 69 3062 647 433 4.7 79 331 308 415928
Propionibacterium acnes SK137 B 2352 1585 67 64 2257 589 395 3.8 74 313 298 360849
Gordonia bronchialis DSM 43247 B 4696 3199 68 62 4546 697 484 6.5 85 325 297 4611183
Erwinia amylovora ATCC 49946 B 3565 2343 66 63 3448 793 865 4.3 77 310 295 5031113
Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIMB 11163 B 1884 1355 72 65 1991 603 434 3.3 70 335 304 344792
Salinibacter ruber M8 B 3257 2058 63 59 3158 665 422 4.7 79 340 318 4181065
Acidaminococcus fermentans DSM 20731 B 2026 1414 70 63 2147 573 404 3.7 73 332 298 370767
Veillonella parvula DSM 2008 B 1844 1286 70 63 1902 581 410 3.3 69 335 301 344752
Edwardsiella tarda EIB202 B 3591 2380 66 65 3539 781 855 4.5 78 301 296 5141142
Conexibacter woesei DSM 14684 B 5914 4476 76 66 6222 738 479 8.4 88 336 292 5261300
Denitrovibrio acetiphilus DSM 12809 B 2964 2146 72 65 3218 657 437 4.9 80 327 294 4541003
Sebaldella termitidis ATCC 33386 B 4150 2491 60 54 3499 672 478 5.2 81 309 276 419945
Legionella longbeachae NSW150 B 3470 2138 62 55 3107 692 533 4.5 78 337 299 4251036
Halothiobacillus neapolitanus c2 B 2357 1690 72 66 2540 693 514 3.7 73 323 296 423956
Streptosporangium roseum DSM 43021 B 8975 6384 71 64 9102 786 603 11.6 91 329 298 6561640
Klebsiella variicola At-22 B 5057 3850 76 71 5614 833 1058 6.7 85 316 296 5821311
Halothece sp. PCC 7418 B 3708 2427 65 61 3571 720 500 5 80 319 295 4781125
Vibrio sp. Ex25 B 4518 3100 69 63 4628 804 845 5.8 83 320 295 5621314
Citrobacter rodentium ICC168 B 4909 3268 67 62 4718 860 1050 5.5 82 312 292 5731307
Lactobacillus crispatus ST1 B 2021 1328 66 62 1902 514 334 3.7 73 297 279 287659
Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 B 609 389 64 49 578 281 122 2.1 51 376 286 140300
Mycobacterium abscessus ATCC 19977 B 4942 3322 67 63 4713 669 491 7 86 317 298 4361111
Thermoanaerobacter sp. X514 B 2345 1690 72 68 2504 664 489 3.8 73 302 286 435906
Finegoldia magna ATCC 29328 B 1812 1198 66 57 1757 546 324 3.2 69 329 283 309694
Opitutus terrae PB90-1 B 4612 3114 68 60 4959 733 476 6.8 85 380 336 5761369
Heliobacterium modesticaldum Ice1 B 2999 1792 60 61 2711 670 472 4 75 294 298 464972
Shewanella halifaxensis HAW-EB4 B 4278 2982 70 62 4485 771 753 5.8 83 338 302 5381261
Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 B 1915 1380 72 66 1997 586 438 3.4 71 324 297 346739
Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 B 3784 2620 69 65 3832 729 530 5.3 81 319 301 4681138
Mycobacterium marinum M B 5452 3933 72 62 5809 695 531 8.4 88 365 312 5011266
Burkholderia phymatum STM815 B 7496 5288 71 67 7817 828 764 9.4 89 324 310 5811545
Brucella abortus S19 B 3000 2175 72 70 3145 685 545 4.6 78 303 294 401993
Thermotoga sp. RQ2 B 1819 1422 78 71 2072 597 495 3.5 71 324 297 378775
Treponema pallidum subsp. pallidum SS14 B 2001 1284 64 57 1982 427 194 4.6 78 348 308 221487
Elusimicrobium minutum Pei191 B 1529 1029 67 59 1500 512 288 2.9 66 323 285 284632
Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1 B 1721 1242 72 68 1854 587 378 3.2 68 305 289 331755
Kocuria rhizophila DC2201 B 2357 1681 71 64 2426 599 405 4.1 75 337 305 365876
Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 B 1730 1316 76 70 1966 593 378 3.3 70 327 299 364780
Anaplasma centrale str. Israel B 923 629 68 56 967 440 249 2.2 54 366 299 224459
Thermotoga naphthophila RKU-10 B 1768 1376 78 72 2010 590 484 3.4 71 318 295 371761
Allochromatium vinosum DSM 180 B 3220 2289 71 64 3629 734 592 4.9 80 342 308 5001176
Stackebrandtia nassauensis DSM 44728 B 6379 4412 69 62 6233 737 498 8.5 88 324 290 5231333
uncultured Sulfuricurvum sp. RIFRC-1 B 2359 1696 72 66 2493 616 358 4 75 310 286 373852
Azospirillum sp. B510 B 6309 4515 72 63 6809 765 662 8.9 89 352 310 5741473
Campylobacter hominis ATCC BAA-381 B 1687 1015 60 60 1478 520 303 2.8 65 285 283 280637
Polaromonas naphthalenivorans CJ2 B 4929 3265 66 60 4694 770 616 6.1 84 320 290 4891263
Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 B 5020 3573 71 64 5316 730 544 7.3 86 315 286 5671259
Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97 B 1731 1158 67 64 1630 548 332 3 66 293 278 287681
Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 B 4321 2776 64 61 4154 814 935 5.1 80 315 301 5321223
Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2 B 3949 2782 70 62 3974 665 496 6 83 334 292 4501099
Enterobacter sp. 638 B 4240 3093 73 67 4502 807 1011 5.6 82 320 293 5451207
Pelotomaculum thermopropionicum SI B 2919 1965 67 64 2874 652 462 4.4 77 297 283 444971
Bacillus cereus 03BB102 B 5606 3360 60 61 4691 777 678 6 83 270 277 5061174
Anaplasma marginale str. Florida B 940 635 68 55 972 442 248 2.2 55 364 298 224467
Cyanothece sp. PCC 8802 B 4444 2774 62 61 4065 755 526 5.4 81 305 296 5081241
Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 B 4562 3058 67 61 4701 765 613 6.1 84 338 307 5501303
Exiguobacterium sp. AT1b B 3020 2052 68 65 2962 698 529 4.2 76 296 284 434960
Neisseria meningitidis alpha14 B 1872 1262 67 64 1854 621 505 3 67 301 287 349779
Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' B 4228 3003 71 68 4425 839 1061 5.3 81 310 295 5661252
Streptococcus suis P1/7 B 1824 1330 73 67 1897 561 426 3.4 70 311 285 323719
Leptotrichia buccalis C-1013-b B 2220 1415 64 58 2006 568 379 3.5 72 309 283 329751
Laribacter hongkongensis HLHK9 B 3235 2007 62 63 2991 692 587 4.3 77 286 291 432996
Edwardsiella ictaluri 93-146 B 3735 2251 60 62 3318 781 859 4.2 76 283 291 5051105
Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT B 875 582 67 58 895 391 202 2.3 56 351 307 202434
Atopobium parvulum DSM 20469 B 1353 995 74 66 1505 487 282 3.1 68 339 303 290616
Streptococcus equi subsp. equi 4047 B 2000 1354 68 62 1932 539 394 3.6 72 302 278 335698
Runella slithyformis DSM 19594 B 5774 3693 64 58 5422 738 504 7.3 86 348 316 5461359
Neorickettsia risticii str. Illinois B 892 549 62 62 827 405 215 2 51 283 285 188414
Acidovorax ebreus TPSY B 3479 2506 72 66 3678 729 603 5 80 325 299 4551099
Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774 B 2356 1647 70 62 2457 619 410 4 75 339 299 412926
Rickettsia peacockii str. Rustic B 947 686 72 65 995 436 227 2.3 56 312 281 207458
Agrobacterium radiobacter K84 B 6684 5071 76 71 7199 772 647 9.3 89 316 295 5091328
Clostridium cellulolyticum H10 B 3390 2256 67 61 3607 678 478 5.3 81 345 318 5061079
Pseudomonas putida F1 B 5249 3724 71 65 5679 815 774 7 86 335 308 5591365
Francisella novicida U112 B 1719 1228 71 65 1785 578 422 3.1 68 331 301 337711
Desulfotomaculum reducens MI-1 B 3276 2188 67 62 3225 671 485 4.8 79 305 281 4791041
Pediococcus pentosaceus ATCC 25745 B 1752 1225 70 65 1788 530 392 3.4 70 305 285 306663
Shewanella sp. MR-4 B 3924 2788 71 63 4187 781 775 5.4 81 342 303 5351267
Parabacteroides distasonis ATCC 8503 B 3849 2603 68 58 3879 648 446 6 83 375 321 4691068
Synechococcus sp. CC9311 B 2892 1617 56 61 2264 636 418 3.6 72 261 287 343872
Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 B 3590 2337 65 62 3389 709 499 4.8 79 293 279 4831065
Nocardioides sp. JS614 B 4909 3470 71 64 4932 732 487 6.7 85 326 294 4791254
Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 B 2945 1855 63 55 2626 618 374 4.2 76 326 286 370935
Syntrophobacter fumaroxidans MPOB B 4064 2770 68 62 4200 716 478 5.9 83 336 304 5181243
Alkaliphilus metalliredigens QYMF B 4625 2806 61 58 4159 727 539 5.7 83 294 282 5121166
Mesorhizobium sp. BNC1 B 4543 3222 71 66 4626 733 573 6.3 84 321 298 4831201
Azoarcus sp. BH72 B 3989 2909 73 66 4378 767 651 5.7 82 333 302 5151256
Bacteroides vulgatus ATCC 8482 B 4066 2582 64 57 3933 622 446 6.3 84 374 334 4561047
Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1 B 2077 1530 74 69 2254 639 500 3.5 72 321 299 380829
Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris DP4 B 3091 2149 70 63 3349 666 446 5 80 338 307 4681078
Burkholderia ambifaria AMMD B 6610 4808 73 68 7079 825 754 8.6 88 331 309 5711454
Thermotoga petrophila RKU-1 B 1785 1395 78 72 2046 589 489 3.5 71 322 297 380761
Psychromonas ingrahamii 37 B 3545 2474 70 63 3774 762 704 5 80 332 302 5211163
Prochlorococcus marinus str. MIT 9515 B 1905 1163 61 67 1638 554 349 3 66 263 290 289679
Marinomonas sp. MWYL1 B 4439 3314 75 67 4942 763 682 6.5 85 335 303 5311230
Dehalococcoides sp. BAV1 B 1371 989 72 69 1449 504 292 2.9 65 292 278 274600
Clostridium novyi NT B 2315 1565 68 62 2371 642 425 3.7 73 317 292 414881
Lactobacillus gasseri ATCC 33323 B 1755 1167 66 61 1693 499 336 3.4 71 317 290 269612
Methylibium petroleiphilum PM1 B 4449 2960 67 61 4279 765 608 5.6 82 318 293 4681228
Vibrio cholerae O395 B 3875 2573 66 63 3883 779 801 5 80 312 296 5501223
Clostridium kluyveri DSM 555 B 3913 2494 64 61 3619 688 471 5.3 81 289 276 4861073
Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 B 7143 5196 73 68 7396 781 652 9.5 89 312 294 5351381
Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338 B 7197 5040 70 66 7334 759 575 9.7 90 322 302 5611447
Neisseria meningitidis FAM18 B 1917 1299 68 64 1903 620 502 3.1 67 305 288 351779
Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1 B 4246 3089 73 67 4513 822 921 5.5 82 329 303 5491230
Deinococcus deserti VCD115 B 3459 2472 71 68 3559 683 516 5.2 81 313 297 4351064
Brucella melitensis ATCC 23457 B 3135 2111 67 69 3054 686 540 4.5 78 288 294 396985
Geobacter sp. M21 B 4080 2835 69 65 4590 733 514 6.3 84 335 311 5611297
Anaerococcus prevotii DSM 20548 B 1806 1269 70 63 1877 566 350 3.3 70 326 293 337712
Candidatus Sulcia muelleri SMDSEM B 242 218 90 82 363 197 103 1.8 46 343 314 112187
Thermotoga neapolitana DSM 4359 B 1937 1450 75 70 2107 596 487 3.5 72 313 294 368780
Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem B 169 125 74 73 170 118 31 1.4 31 258 253 40111
Geobacillus sp. WCH70 B 3168 1984 63 61 2854 721 598 4 75 293 284 443994
Capnocytophaga ochracea DSM 7271 B 2171 1367 63 57 2026 569 352 3.6 72 345 313 344766
Eggerthella lenta DSM 2243 B 3070 2066 67 58 3015 597 364 5.1 80 342 294 373879
Saccharomonospora viridis DSM 43017 B 3828 2669 70 65 3840 689 491 5.6 82 325 302 4591093
Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 B 4059 2834 70 61 3985 670 497 5.9 83 331 288 4411110
Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 B 3049 2056 67 62 2916 648 509 4.5 78 323 298 401937
Sinorhizobium fredii NGR234 B 6362 4474 70 66 6448 768 643 8.4 88 311 293 5021366
Streptococcus pneumoniae P1031 B 2073 1374 66 66 1967 558 436 3.5 72 282 279 337735
Macrococcus caseolyticus JCSC5402 B 2053 1492 73 67 2184 610 480 3.6 72 313 288 384780
Methylotenera mobilis JLW8 B 2338 1723 74 68 2626 662 534 4 75 324 297 415920
Helicobacter pylori B38 B 1382 929 67 60 1354 513 300 2.6 62 323 289 262598
Brucella microti CCM 4915 B 3282 2206 67 69 3204 690 558 4.6 78 293 300 410996
Actinosynnema mirum DSM 43827 B 6916 4739 69 62 7117 781 549 9.1 89 346 311 6311519
Shewanella baltica OS185 B 4394 2980 68 60 4457 794 775 5.6 82 336 300 5501292
Frankia alni ACN14a B 6700 4277 64 61 6065 708 503 8.6 88 322 305 5311420
Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 B 2013 1520 76 68 2239 646 629 3.5 71 324 292 392838
Nitratiruptor sp. SB155-2 B 1843 1379 75 67 2021 601 363 3.4 70 319 287 337780
Parvibaculum lavamentivorans DS-1 B 3636 2646 73 66 3746 689 524 5.4 82 323 293 4351055
Arthrobacter sp. FB24 B 4523 3206 71 65 4567 701 507 6.5 85 333 305 4801170
Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 B 4025 2939 73 66 4308 833 958 5.2 81 322 292 5581260
Salinispora tropica CNB-440 B 4536 3195 70 64 4549 687 471 6.6 85 335 302 4931217
Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 B 2780 1817 65 63 2705 664 548 4.1 75 294 284 399877
Brucella ovis ATCC 25840 B 2889 2004 69 68 2896 675 529 4.3 77 298 294 392967
Acinetobacter baumannii ATCC 17978 B 3367 2474 73 67 3470 701 541 5 80 284 258 4131025
Burkholderia mallei SAVP1 B 5184 3271 63 65 4743 782 688 6.1 84 292 302 5081305
Marinobacter aquaeolei VT8 B 4272 2904 68 59 4249 758 665 5.6 82 333 291 5181238
Lactobacillus casei ATCC 334 B 2764 1781 64 62 2501 587 427 4.3 77 289 279 342771
Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 B 2682 1839 69 63 2701 644 462 4.2 76 316 289 416888
Shewanella loihica PV-4 B 3859 2765 72 64 4216 764 744 5.5 82 340 304 5441227
Gramella forsetii KT0803 B 3584 2267 63 60 3321 664 424 5 80 319 301 4341028
Sulfurovum sp. NBC37-1 B 2438 1689 69 62 2467 628 371 3.9 75 315 283 372909
Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 B 3445 2257 66 65 3243 730 631 4.4 77 291 290 4491037
Psychrobacter sp. PRwf-1 B 2385 1713 72 62 2524 658 527 3.8 74 347 301 398929
Roseburia intestinalis B 3461 2092 60 58 3048 640 405 4.8 79 303 289 436989
Chlorobium phaeovibrioides DSM 265 B 1753 1316 75 67 1952 597 384 3.3 69 340 303 359774
Flavobacterium johnsoniae UW101 B 5017 3264 65 57 4814 723 492 6.7 85 353 309 5101254
Burkholderia pseudomallei 1106a B 7174 4039 56 62 6046 824 739 7.3 86 290 318 5481465
Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 B 4131 2929 71 66 4215 734 584 5.7 83 320 296 4761165
Mycobacterium sp. JLS B 5739 4197 73 66 5846 705 532 8.3 88 325 294 4921274
Candidatus Solibacter usitatus Ellin6076 B 7826 5274 67 57 8080 799 592 10.1 90 383 326 7301756
Bradyrhizobium sp. ORS 278 B 6716 4558 68 64 6496 790 632 8.2 88 316 298 5541435
Paracoccus denitrificans PD1222 B 5077 3571 70 66 5046 752 614 6.7 85 311 293 4831234
Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 B 5979 4196 70 63 5922 722 535 8.2 88 330 297 5221303
Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044 B 5262 3811 72 70 5550 827 1064 6.7 85 308 297 5871332
Variovorax paradoxus S110 B 6279 4631 74 68 6677 807 666 8.3 88 327 302 5451382
Rickettsia africae ESF-5 B 1041 701 67 63 1018 452 229 2.3 56 298 278 213481
Dyadobacter fermentans DSM 18053 B 5719 3854 67 59 5767 742 494 7.8 87 364 318 5411351
Kosmotoga olearia TBF 19.5.1 B 2118 1547 73 67 2198 568 383 3.9 74 318 291 345765
Brevibacillus brevis NBRC 100599 B 5947 3860 65 63 5808 784 641 7.4 87 307 300 5871331
Kytococcus sedentarius DSM 20547 B 2554 1758 69 62 2477 603 362 4.1 76 322 291 365887
Corynebacterium kroppenstedtii DSM 44385 B 2018 1378 68 61 2000 569 386 3.5 72 350 313 343822
Desulfohalobium retbaense DSM 5692 B 2526 1779 70 66 2723 631 419 4.3 77 325 303 440957
Acidobacterium capsulatum ATCC 51196 B 3377 2234 66 61 3422 694 480 4.9 80 352 322 4721105
Bacillus anthracis str. A0248 B 5292 3161 60 62 4382 771 666 5.7 82 268 276 4911135
Teredinibacter turnerae T7901 B 4254 2757 65 61 4460 767 664 5.8 83 351 328 5851334
Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771 B 4068 2456 60 57 3659 702 478 5.2 81 300 281 5111094
Micrococcus luteus NCTC 2665 B 2236 1548 69 63 2236 580 384 3.9 74 331 302 346841
Chloroflexus sp. Y-400-fl B 4159 2778 67 62 4254 727 493 5.9 83 343 321 5341236
Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) B 2148 1195 56 57 1726 558 487 3.1 68 270 275 309674
Rhodococcus erythropolis PR4 B 6437 4512 70 66 6426 728 546 8.8 89 325 304 5021289
Cryptobacterium curtum DSM 15641 B 1357 1005 74 64 1514 497 310 3 67 347 301 290633
Nakamurella multipartita DSM 44233 B 5240 3514 67 59 4981 737 501 6.8 85 335 297 5161294
Jonesia denitrificans DSM 20603 B 2511 1707 68 63 2470 635 405 3.9 74 327 303 377880
Burkholderia glumae BGR1 B 5773 4001 69 63 5919 804 715 7.4 86 339 309 5391398
Ralstonia pickettii 12D B 5361 3430 64 62 5022 778 659 6.5 85 308 297 4961252
Shewanella putrefaciens CN-32 B 3972 2755 69 62 4136 778 747 5.3 81 333 297 5301233
Alcanivorax borkumensis SK2 B 2755 2032 74 66 3027 696 599 4.3 77 330 295 4351033
Xanthobacter autotrophicus Py2 B 5035 3433 68 62 5017 740 576 6.8 85 325 298 4971251
Pseudomonas stutzeri A1501 B 4127 2930 71 65 4377 768 730 5.7 82 329 300 5381279
Clostridium perfringens ATCC 13124 B 2876 1875 65 62 2845 662 462 4.3 77 313 295 449961
Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 B 2774 1945 70 66 2840 672 556 4.2 76 298 281 408917
Sphingomonas wittichii RW1 B 5345 4041 76 67 5629 723 552 7.8 87 336 299 4741230
Ralstonia eutropha H16 B 6626 4916 74 69 7118 810 717 8.8 89 326 305 5471417
Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen B 2504 1734 69 62 2622 625 407 4.2 76 323 290 428914
Sinorhizobium medicae WSM419 B 6213 4378 70 68 6393 771 639 8.3 88 312 302 5351351
Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 B 2045 1232 60 61 1827 580 432 3.1 68 294 295 338738
Bacillus amyloliquefaciens FZB42 B 3693 2547 69 68 3878 742 669 5.2 81 311 306 4731099
Shewanella amazonensis SB2B B 3645 2684 74 65 4086 757 756 5.4 81 346 306 5421229
Orientia tsutsugamushi str. Boryong B 1182 655 55 52 935 387 179 2.4 59 292 273 189406
Thermotoga thermarum DSM 5069 B 1945 1450 75 70 2105 598 443 3.5 72 318 297 365769
Roseobacter denitrificans OCh 114 B 4129 2862 69 66 4115 723 571 5.7 82 312 297 4511138
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 B 2003 1411 70 68 2018 551 379 3.7 73 303 290 314697
Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14 B 5892 4178 71 65 6253 846 850 7.4 86 330 302 5741447
Legionella pneumophila str. Corby B 3204 1997 62 57 2861 689 540 4.2 76 323 293 4101003
Maricaulis maris MCS10 B 3063 2148 70 63 3127 696 500 4.5 78 329 295 4231033
Thermosipho melanesiensis BI429 B 1879 1334 71 65 1909 584 391 3.3 69 310 286 339751
Burkholderia vietnamiensis G4 B 7617 4747 62 59 6801 829 729 8.2 88 314 296 5491478
Bacillus thuringiensis str. Al Hakam B 4798 3266 68 63 4614 771 673 6 83 304 283 5001171
Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 B 3078 2178 71 65 3032 614 395 4.9 80 327 300 385924
Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 B 4119 3033 74 66 4569 807 846 5.7 82 335 299 5811316
Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40 B 1719 1211 70 65 1719 564 347 3 67 310 284 307715
Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 B 3785 2277 60 52 3467 689 423 5 80 351 302 4591098
Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 B 2434 1638 67 64 2262 568 450 4 75 284 272 330760
Sulfurihydrogenibium azorense Az-Fu1 B 1723 1237 72 69 1841 578 373 3.2 69 299 287 333740
Caulobacter crescentus NA1000 B 3818 2646 69 65 3826 724 566 5.3 81 319 300 4531145
Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 B 1964 1454 74 68 2077 598 363 3.5 71 325 297 341800
Rhodococcus opacus B4 B 8197 5773 70 68 8408 733 570 11.5 91 324 311 5361430
Desulfovibrio salexigens DSM 2638 B 3807 2672 70 63 4071 700 475 5.8 83 332 299 5111194
Brachybacterium faecium DSM 4810 B 3068 2245 73 65 3182 619 434 5.1 81 349 312 404976
Paenibacillus sp. JDR-2 B 6213 4558 73 64 6774 791 655 8.6 88 339 298 5931348
Dickeya zeae Ech1591 B 4163 3046 73 66 4391 805 900 5.5 82 326 295 5411214
Brachyspira hyodysenteriae WA1 B 2642 1740 66 58 2489 613 349 4.1 75 331 290 366852
Photorhabdus asymbiotica B 4417 2695 61 58 4022 795 851 5.1 80 319 305 5111203
Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 B 2219 1483 67 65 2163 644 612 3.4 70 297 291 390851
Tolumonas auensis DSM 9187 B 3130 2324 74 67 3489 727 738 4.8 79 327 297 4921069
Eubacterium eligens ATCC 27750 B 2765 1733 63 58 2497 645 404 3.9 74 310 285 401904
Mycoplasma conjunctivae HRC/581 B 692 420 61 47 625 282 125 2.2 55 371 285 148302
Streptococcus salivarius 57.I B 1996 1362 68 63 1993 558 424 3.6 72 314 288 330727
Desulfobacterium autotrophicum HRM2 B 4943 3351 68 62 5130 727 504 7.1 86 337 307 5881388
Pedobacter heparinus DSM 2366 B 4252 2986 70 60 4483 676 480 6.6 85 375 321 4801143
Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 B 1109 731 66 68 1097 441 277 2.5 60 287 295 238501
Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418 B 1634 1147 70 67 1695 555 400 3.1 67 309 295 320670
Halorhodospira halophila SL1 B 2407 1796 75 67 2690 694 554 3.9 74 339 302 419980
Pelobacter propionicus DSM 2379 B 3804 2551 67 62 3921 698 474 5.6 82 326 299 5191155
Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 B 6717 4792 71 68 6727 725 553 9.3 89 315 302 5001281
Geobacter uraniireducens Rf4 B 4358 3121 72 64 4904 739 499 6.6 85 341 303 5671316
Dichelobacter nodosus VCS1703A B 1280 946 74 65 1390 529 357 2.6 62 326 288 289616
Nitrosomonas eutropha C91 B 2551 1742 68 64 2557 661 524 3.9 74 310 289 402909
Fervidobacterium nodosum Rt17-B1 B 1750 1301 74 65 1891 581 388 3.3 69 334 293 348742
Granulibacter bethesdensis CGDNIH1 B 2433 1721 71 64 2506 648 476 3.9 74 339 308 396924
Buchnera aphidicola BCc B 362 331 91 83 545 290 207 1.9 47 330 300 154271
Acidothermus cellulolyticus 11B B 2157 1607 75 68 2370 638 417 3.7 73 338 309 402915
Rhodococcus jostii RHA1 B 9145 6126 67 66 8912 749 585 11.9 92 316 310 5391478
Shigella flexneri 5 str. 8401 B 4114 2912 71 67 4150 813 998 5.1 80 299 281 5461200
Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes B 3159 2276 72 65 3327 607 379 5.5 82 339 308 415926
Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 B 2650 1787 67 61 2633 639 418 4.1 76 331 300 403904
Shewanella frigidimarina NCIMB 400 B 4029 2851 71 64 4295 762 737 5.6 82 336 302 5391244
Clostridium difficile 630 B 3758 2500 67 61 3745 690 493 5.4 82 310 284 4661042
Campylobacter curvus 525.92 B 1934 1269 66 64 1797 551 329 3.3 69 294 286 306720
Ochrobactrum anthropi ATCC 49188 B 4799 3414 71 66 4827 744 606 6.5 85 314 293 4551168
Acidovorax sp. JS42 B 4155 2781 67 61 4000 735 600 5.4 82 322 294 4661152
Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 B 4436 3012 68 63 4360 807 822 5.4 81 310 286 5501266
Mycoplasma agalactiae PG2 B 742 472 64 52 685 295 150 2.3 57 344 284 148324
Lactobacillus reuteri DSM 20016 B 1900 1337 70 66 1885 550 389 3.4 71 298 280 308693
Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 B 3084 2036 66 64 2929 669 504 4.4 77 303 294 427928
Slackia heliotrinireducens DSM 20476 B 2766 1855 67 58 2618 593 351 4.4 77 327 285 365856
Catenulispora acidiphila DSM 44928 B 8913 6183 69 61 8988 785 581 11.4 91 346 304 6641714
Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 B 3512 2119 60 56 3021 664 482 4.5 78 307 285 4521002
Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bl-04 B 1567 1122 72 63 1625 491 303 3.3 70 354 310 279657
Methylobacterium extorquens AM1 B 6205 3487 56 56 5245 756 583 6.9 86 299 299 5081340
Kangiella koreensis DSM 16069 B 2632 1829 69 63 2755 691 595 4 75 324 294 443985
Campylobacter lari RM2100 B 1544 1094 71 64 1576 543 314 2.9 66 316 284 297682
Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124 B 2094 1450 69 66 2059 566 422 3.6 73 291 276 340721
Bartonella grahamii as4aup B 1768 1164 66 60 1710 539 362 3.2 68 323 294 305664
Lactobacillus plantarum JDM1 B 2947 2055 70 64 2868 606 448 4.7 79 303 279 356829
Thermomicrobium roseum DSM 5159 B 2854 1895 66 66 2712 662 458 4.1 76 304 304 384945
Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1 B 4473 3041 68 61 4603 761 528 6 83 337 303 5511341
Eubacterium rectale ATCC 33656 B 3621 2027 56 55 2888 649 409 4.4 78 286 281 415968
Desulfotomaculum kuznetsovii DSM 6115 B 3398 2197 65 61 3225 665 463 4.8 79 298 282 4591017
Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 B 2909 1993 69 64 3044 696 582 4.4 77 321 302 4491016
Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 B 3283 2280 69 64 3326 729 581 4.6 78 306 281 4471095
Pseudomonas fluorescens SBW25 B 5921 4249 72 66 6358 821 780 7.7 87 333 305 5641399
Listeria monocytogenes serotype 4b str. CLIP 80459 B 2766 2044 74 67 2994 674 565 4.4 77 311 284 417937
Flavobacteriaceae bacterium 3519-10 B 2534 1617 64 59 2334 614 397 3.8 74 329 304 367862
Azotobacter vinelandii DJ B 5050 3333 66 67 4972 801 744 6.2 84 303 309 5411287
Mycobacterium leprae Br4923 B 1604 1128 70 67 1715 535 381 3.2 69 336 318 311700
Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 B 2551 1658 65 59 2343 597 404 3.9 75 324 292 347851
Roseiflexus sp. RS-1 B 4517 3127 69 60 4631 719 500 6.4 84 363 315 5451285
Verminephrobacter eiseniae EF01-2 B 4947 3627 73 67 5093 726 585 7 86 335 306 4721146
Thermovirga lienii DSM 17291 B 1875 1363 73 67 2047 587 382 3.5 71 323 300 359763
Bartonella bacilliformis KC583 B 1283 870 68 67 1324 494 333 2.7 63 302 298 270577
Janthinobacterium sp. Marseille B 3697 2624 71 63 3863 724 613 5.3 81 330 293 4471098
Corynebacterium glutamicum R B 3077 2028 66 62 2880 623 430 4.6 78 313 296 379938
Haemophilus influenzae PittEE B 1612 1213 75 71 1760 581 558 3 67 298 280 335722
Mycobacterium gilvum PYR-GCK B 5579 3904 70 63 5492 710 517 7.7 87 328 295 5011249
Trichodesmium erythraeum IMS101 B 4451 2775 62 58 4360 704 494 6.2 84 347 323 5361279
Actinobacillus succinogenes 130Z B 2079 1599 77 70 2382 650 655 3.7 73 326 298 414863
Oenococcus oeni PSU-1 B 1691 1189 70 70 1688 499 329 3.4 70 289 287 271617
Psychrobacter sp. G B 2614 1813 69 64 2696 685 537 3.9 75 328 301 415989
Pseudomonas sp. UW4 B 5423 3974 73 67 5913 827 785 7.1 86 331 304 5801393
Serratia sp. ATCC 39006 B 4414 3255 74 70 4790 790 911 6.1 84 320 303 5641250
Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 B 2522 1805 72 67 2713 672 507 4 75 310 290 452939
Clostridium sp. BNL1100 B 3920 2574 66 61 4038 704 486 5.7 83 343 317 5281153
Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis B 617 530 86 77 824 405 321 2 51 329 294 202401
Nitrobacter winogradskyi Nb-255 B 3122 2014 65 60 2907 679 496 4.3 77 305 284 405992
Clostridium clariflavum DSM 19732 B 3892 2420 62 56 3698 696 485 5.3 81 332 299 5481127
Wolinella succinogenes DSM 1740 B 2043 1495 73 66 2210 581 354 3.8 74 323 289 349789
Bacillus clausii KSM-K16 B 4096 2881 70 67 4136 758 638 5.5 82 300 285 4821119
Vibrio furnissii NCTC 11218 B 4455 3182 71 66 4741 804 840 5.9 83 315 291 5501312
Thermodesulfatator indicus DSM 15286 B 2195 1572 72 67 2342 637 416 3.7 73 317 295 398882
Collimonas fungivorans Ter331 B 4432 3204 72 65 4772 781 664 6.1 84 345 311 5071263
Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 B 4427 3006 68 61 4455 782 669 5.7 82 341 309 5491301
Corallococcus coralloides DSM 2259 B 8033 5081 63 55 8153 815 597 10 90 383 335 7241885
Mycoplasma synoviae 53 B 659 436 66 52 635 294 136 2.2 54 358 282 145311
Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 B 812 514 63 50 755 323 173 2.3 57 365 286 164344
Eubacterium siraeum B 2343 1368 58 55 2000 542 317 3.7 73 306 286 334751
Pandoraea sp. RB-44 B 4781 3487 73 68 5037 765 676 6.6 85 320 299 4881243
Syntrophus aciditrophicus SB B 3166 1954 62 62 2974 659 428 4.5 78 297 298 4531007
Nostoc sp. PCC 7107 B 5237 3233 62 60 5005 775 541 6.5 85 325 314 5591375
Sulfurospirillum barnesii SES-3 B 2491 1714 69 63 2497 619 396 4 75 313 288 391867
Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 B 2684 1715 64 62 2428 641 512 3.8 74 287 278 388843
Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 B 2513 1783 71 68 2518 632 517 4 75 285 274 385829
Bacteroides sp. CF50 B 2306 1622 70 61 2401 583 366 4.1 76 357 308 378861
Pseudomonas entomophila L48 B 5134 3627 71 65 5571 811 765 6.9 85 339 313 5761378
Blastococcus saxobsidens DD2 B 4817 3160 66 62 4400 699 486 6.3 84 304 289 4651188
Pseudoalteromonas atlantica T6c B 4281 3090 72 64 4623 777 731 5.9 83 348 310 5521281
Psychrobacter cryohalolentis K5 B 2511 1814 72 64 2687 678 533 4 75 341 300 411984
Borrelia afzelii PKo B 1253 630 50 51 949 395 182 2.4 58 285 291 200447
Borrelia bissettii DN127 B 1463 644 44 46 958 393 177 2.4 59 278 291 196437
Synechococcus sp. PCC 6312 B 3545 2135 60 59 3074 696 465 4.4 77 296 289 4251041
Phaeobacter gallaeciensis 2.10 B 3723 2803 75 68 4111 715 560 5.7 83 325 296 4621124
Borrelia crocidurae str. Achema B 1470 819 56 54 1124 396 187 2.8 65 278 271 193447
Pseudomonas protegens Pf-5 B 6108 4361 71 66 6604 826 800 8 87 338 310 5981443
Brachyspira intermedia PWS/A B 2872 1813 63 57 2579 624 370 4.1 76 323 290 372883
Cupriavidus metallidurans CH34 B 6474 4380 68 64 6333 791 691 8 88 313 298 5091369
Streptomyces sp. SirexAA-E B 6357 4479 70 64 6464 752 560 8.6 88 337 304 6011448
Brucella pinnipedialis B2/94 B 3324 2198 66 68 3178 689 553 4.6 78 288 296 406999
Burkholderia sp. RPE64 B 6498 4507 69 70 6593 809 726 8.1 88 304 307 5291388
Calothrix sp. PCC 7507 B 5950 3612 61 59 5316 781 560 6.8 85 312 303 5721415
Rickettsia conorii str. Malish 7 B 1374 778 57 60 1098 460 229 2.4 58 248 261 213506
Acidovorax sp. KKS102 B 4742 3399 72 66 5026 768 632 6.5 85 324 298 5021256
Rickettsia felis URRWXCal2 B 1512 947 63 58 1318 476 250 2.8 64 292 269 238543
Psychrobacter arcticus 273-4 B 2120 1512 71 63 2237 643 495 3.5 71 335 298 374875
Ralstonia eutropha JMP134 B 6446 4795 74 69 6999 794 696 8.8 89 328 305 5391389
Rickettsia typhi str. Wilmington B 837 615 73 66 925 420 223 2.2 55 333 300 203434
Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 B 3140 2346 75 71 3338 666 458 5 80 314 298 410976
Rhodoferax ferrireducens T118 B 4417 3194 72 66 4768 767 625 6.2 84 335 303 5201270
Streptomyces avermitilis MA-4680 B 7676 5230 68 61 7727 774 574 10 90 341 306 6161605
Salmonella bongori NCTC 12419 B 3863 2830 73 66 4186 814 1006 5.1 81 329 298 5551205
Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A B 2318 1543 67 61 2282 623 443 3.7 73 319 292 393833
Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270 B 4119 3015 73 64 4477 712 504 6.3 84 363 318 5341232
Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 B 3337 2268 68 64 3238 692 505 4.7 79 310 291 4491029
Fibrella aestuarina B 5627 3536 63 56 5295 739 516 7.2 86 363 320 5301350
Streptomyces coelicolor A3(2) B 8152 5502 67 61 7923 776 600 10.2 90 326 297 6461606
Ruegeria pomeroyi DSS-3 B 4278 3183 74 68 4655 725 568 6.4 84 322 296 4651148
Caldisericum exile AZM16c01 B 1581 1108 70 66 1633 531 291 3.1 67 305 285 315653
Shewanella oneidensis MR-1 B 4214 2856 68 61 4283 795 752 5.4 81 331 299 5431270
Synechococcus elongatus PCC 7942 B 2662 1786 67 64 2588 677 470 3.8 74 304 292 405955
Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan B 1491 968 65 58 1438 505 298 2.8 65 318 284 284604
Thermus thermophilus HB27 B 2210 1645 74 70 2335 634 579 3.7 73 303 285 395841
Tropheryma whipplei TW08/27 B 783 577 74 68 896 391 233 2.3 56 332 308 206433
Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B B 3053 2087 68 61 3177 666 443 4.8 79 360 320 4401067
Candidatus Methylomirabilis oxyfera B 3065 1843 60 64 2733 662 450 4.1 76 270 288 421958
Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA B 1211 650 54 62 953 432 236 2.2 55 233 267 208463
Candidatus Moranella endobia PCIT B 406 359 88 80 598 310 275 1.9 48 340 308 173293
Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V B 1390 777 56 58 1110 453 231 2.5 59 259 269 214497
Candidatus Tremblaya princeps PCIT B 121 110 91 88 151 105 47 1.4 30 252 243 3599
Thiomicrospira crunogena XCL-2 B 2196 1617 74 66 2488 665 513 3.7 73 330 298 422918
Treponema denticola ATCC 35405 B 2767 1559 56 54 2241 580 297 3.9 74 313 300 335816
Clostridium tetani E88 B 2439 1667 68 60 2505 618 439 4.1 75 334 294 416875
Thermobifida fusca YX B 3087 2163 70 64 3132 657 465 4.8 79 332 304 440992
Thermosynechococcus elongatus BP-1 B 2476 1669 67 64 2465 661 443 3.7 73 313 297 402938
Thermotoga maritima MSB8 B 1858 1414 76 71 2057 596 487 3.5 71 315 294 379765
Thermosynechococcus sp. NK55 B 2231 1565 70 65 2314 647 439 3.6 72 319 297 391903
Capnocytophaga canimorsus Cc5 B 2404 1371 57 55 2004 590 359 3.4 71 315 302 348791
[Cellvibrio] gilvus ATCC 13127 B 3164 2182 69 61 3178 671 432 4.7 79 338 300 4571042
Thermoanaerobacter tengcongensis MB4 B 2588 1772 68 65 2631 646 491 4.1 75 301 287 420908
Streptomyces violaceusniger Tu 4113 B 8985 6240 69 64 9745 775 598 12.6 92 353 323 6361670
Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 B 646 395 61 44 590 281 122 2.1 52 404 290 142299
Rickettsia slovaca 13-B B 1112 682 61 62 990 445 229 2.2 55 272 277 208467
Streptomyces sp. PAMC26508 B 7073 4593 65 62 6644 760 564 8.7 89 317 304 6141523
Anabaena variabilis ATCC 29413 B 5710 3594 63 59 5547 783 564 7.1 86 339 317 5781458
Chromobacterium violaceum ATCC 12472 B 4405 3019 69 64 4478 780 687 5.7 83 317 297 5301240
Thermus sp. CCB_US3_UF1 B 2279 1682 74 70 2421 641 558 3.8 74 312 294 401855
Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 B 4831 3142 65 62 4666 795 854 5.9 83 309 295 5481309
Chlamydia psittaci 01DC11 B 975 628 64 55 947 408 208 2.3 57 358 305 207455
Methanothermobacter marburgensis str. Marburg A 1757 1210 69 65 1709 524 330 3.3 69 282 265 290694
Staphylothermus hellenicus DSM 12710 A 1599 1018 64 60 1336 442 216 3 67 286 272 197568
Natrinema sp. J7-2 A 4302 2126 49 54 2916 618 339 4.7 79 251 275 346905
Methanococcus voltae A3 A 1717 1123 65 60 1520 487 282 3.1 68 299 276 236631
methanocaldococcus infernus ME A 1441 1049 73 68 1426 484 309 2.9 66 283 265 246602
Methanocella arvoryzae MRE50 A 3089 1910 62 58 2672 588 331 4.5 78 290 272 355882
Thermococcus sp. 4557 A 2133 1350 63 59 1830 523 353 3.5 71 286 268 271685
Methanosphaerula palustris E1-9c A 2655 1788 67 66 2880 594 305 4.8 79 308 300 370907
Methanothermus fervidus DSM 2088 A 1283 957 75 68 1336 465 292 2.9 65 299 275 240578
Thermococcus barophilus MP A 2265 1464 65 62 1964 517 375 3.8 74 279 266 270705
Desulfurococcus mucosus DSM 2162 A 1345 904 67 63 1185 415 197 2.9 65 292 272 178510
Archaeoglobus veneficus SNP6 A 2090 1402 67 64 1910 546 336 3.5 71 270 259 300739
Desulfurococcus kamchatkensis 1221n A 1471 919 62 62 1230 427 210 2.9 65 272 271 191535
Methanosarcina barkeri str. Fusaro A 3625 2350 65 60 3472 619 366 5.6 82 311 289 3881023
Methanotorris igneus Kol 5 A 1772 1218 69 64 1658 511 321 3.2 69 286 268 271654
Cenarchaeum symbiosum A A 2014 1035 51 54 1613 480 237 3.4 70 308 326 258631
Thermoproteus uzoniensis 768-20 A 2186 1389 64 63 1805 489 277 3.7 73 268 267 234660
Halogeometricum borinquense DSM 11551 A 3898 2281 59 57 3197 639 361 5 80 290 283 384971
Metallosphaera cuprina Ar-4 A 2029 1286 63 66 1718 489 279 3.5 72 265 274 232644
Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 A 1535 1044 68 60 1501 475 280 3.2 68 322 284 258620
Methanospirillum hungatei JF-1 A 3131 2090 67 59 3168 591 298 5.4 81 324 285 357959
Methanococcoides burtonii DSM 6242 A 2273 1470 65 59 2095 557 313 3.8 73 302 274 307776
Methanosarcina acetivorans C2A A 4540 2728 60 56 4040 645 379 6.3 84 312 290 4041094
Methanopyrus kandleri AV19 A 1687 1061 63 56 1438 473 258 3 67 297 267 231605
Methanosarcina mazei Go1 A 3368 2130 63 58 3007 618 360 4.9 79 303 276 359953
Nanoarchaeum equitans Kin4-M A 540 348 64 56 466 228 82 2 51 280 241 90258
Natronomonas pharaonis DSM 2160 A 2820 1716 61 59 2503 588 325 4.3 77 292 281 335840
Picrophilus torridus DSM 9790 A 1537 1128 73 68 1528 491 284 3.1 68 307 285 241596
Pyrococcus abyssi GE5 A 1780 1299 73 66 1757 508 389 3.5 71 303 273 253662
Pyrobaculum aerophilum str. IM2 A 2602 1469 56 57 1883 503 276 3.7 73 252 257 238680
Pyrococcus horikoshii OT3 A 1950 1247 64 62 1697 503 377 3.4 70 281 271 250656
Aciduliprofundum sp. MAR08-339 A 1525 1046 69 65 1509 507 284 3 66 296 280 272614
Haloarcula hispanica ATCC 33960 A 3859 2326 60 59 3323 641 359 5.2 81 289 284 381972
Haloferax mediterranei ATCC 33500 A 3863 2291 59 58 3203 643 368 5 80 285 279 372948
halophilic archaeon DL31 A 3476 2012 58 56 2761 579 317 4.8 79 289 281 328833
Halopiger xanaduensis SH-6 A 4221 2488 59 58 3505 628 362 5.6 82 292 288 363969
Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 A 2149 1371 64 60 1785 496 269 3.6 72 282 267 231658
Methanococcus aeolicus Nankai-3 A 1490 1071 72 66 1478 481 289 3.1 67 295 269 243619
Methanococcus vannielii SB A 1678 1184 71 65 1626 516 327 3.2 68 292 267 259662
Thermococcus gammatolerans EJ3 A 2156 1388 64 59 1879 526 373 3.6 72 295 270 260712
Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514 A 2299 1427 62 61 1838 493 275 3.7 73 266 260 233657
Hyperthermus butylicus DSM 5456 A 1603 1078 67 62 1379 455 222 3 67 281 258 186591
Ignicoccus hospitalis KIN4/I A 1434 936 65 62 1220 431 221 2.8 65 278 263 185546
Methanocella paludicola SANAE A 3004 1902 63 61 2718 574 308 4.7 79 285 276 346850
Methanocaldococcus sp. FS406-22 A 1816 1197 66 62 1624 509 320 3.2 69 283 264 254645
Nitrosopumilus maritimus SCM1 A 1796 1167 65 62 1637 502 249 3.3 69 275 261 234637
Caldivirga maquilingensis IC-167 A 1963 1346 69 64 1777 493 270 3.6 72 306 285 232633
Archaeoglobus profundus DSM 5631 A 1823 1141 63 63 1597 521 312 3.1 67 263 265 301650
Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 A 1603 1130 70 64 1495 451 238 3.3 70 296 268 207585
Thermoproteus neutrophilus V24Sta A 1966 1231 63 61 1589 468 249 3.4 71 269 262 213605
Halobacterium salinarum R1 A 2749 1622 59 57 2229 553 293 4 75 282 273 308762
Aciduliprofundum boonei T469 A 1544 1072 69 64 1545 504 293 3.1 67 303 282 272629
Haloterrigena turkmenica DSM 5511 A 5113 3039 59 60 4305 639 369 6.7 85 288 291 3931052
Methanobrevibacter ruminantium M1 A 2217 1356 61 55 2033 511 306 4 75 344 308 279744
Desulfurococcus fermentans DSM 16532 A 1421 934 66 63 1236 428 211 2.9 65 285 271 186535
Fervidicoccus fontis Kam940 A 1385 914 66 64 1216 411 213 3 66 275 267 184512
Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1 A 3013 1917 64 59 2756 601 320 4.6 78 303 282 350892
Methanocella conradii HZ254 A 2455 1553 63 61 2148 539 305 4 75 285 272 308758
Methanoculleus bourgensis MS2 A 2618 1641 63 61 2376 582 316 4.1 76 292 282 358852
Methanosaeta harundinacea 6Ac A 2371 1579 67 59 2196 580 318 3.8 74 310 275 335821
Methanosalsum zhilinae DSM 4017 A 1976 1349 68 62 1937 560 336 3.5 71 310 280 315757
Methanothermococcus okinawensis IH1 A 1595 1091 68 64 1493 496 306 3 67 287 267 244640
Methanobrevibacter sp. AbM4 A 1671 1140 68 62 1579 502 295 3.1 68 301 273 264646
Methanocaldococcus vulcanius M7 A 1742 1139 65 62 1573 505 320 3.1 68 285 269 266642
Haloferax volcanii DS2 A 4015 2410 60 59 3357 638 370 5.3 81 283 279 362948
Methanohalophilus mahii DSM 5219 A 1987 1378 69 63 1980 556 322 3.6 72 297 272 309763
Natrialba magadii ATCC 43099 A 4212 2406 57 56 3369 617 348 5.5 82 292 288 364977
Ferroglobus placidus DSM 10642 A 2480 1629 66 62 2154 567 356 3.8 74 268 254 318785
Acidilobus saccharovorans 345-15 A 1499 1022 68 65 1345 440 221 3.1 67 300 284 205547
Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 A 2420 1668 69 65 2280 569 375 4 75 277 263 314797
Aeropyrum pernix K1 A 1700 1134 67 62 1462 469 250 3.1 68 289 269 206614
Methanohalobium evestigatum Z-7303 A 2254 1439 64 59 2087 577 327 3.6 72 296 274 308789
Thermosphaera aggregans DSM 11486 A 1387 891 64 61 1165 416 205 2.8 64 286 270 174512
Halalkalicoccus jeotgali B3 A 3873 2257 58 60 3096 628 356 4.9 80 267 275 346915
Complete genome sequence of Methanobacterium sp. Mb1 A 2021 1357 67 64 1905 529 328 3.6 72 278 267 300741
Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 A 2224 1485 67 65 1971 519 306 3.8 74 284 276 242675
Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 A 1974 1155 59 59 1555 502 242 3.1 68 248 248 224629
Sulfolobus solfataricus P2 A 2978 1852 62 60 2407 533 328 4.5 78 282 273 255725
Sulfolobus tokodaii str. 7 A 2826 1697 60 60 2215 524 310 4.2 76 269 266 260729
Thermoplasma acidophilum DSM 1728 A 1484 1095 74 69 1503 487 285 3.1 68 306 287 244570
Thermococcus kodakarensis KOD1 A 2306 1459 63 60 1974 536 389 3.7 73 277 263 285713
Thermoplasma volcanium GSS1 A 1501 1095 73 68 1479 486 288 3 67 300 280 233570
Metallosphaera sedula DSM 5348 A 2256 1503 67 64 2002 513 297 3.9 74 284 274 256690
Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 A 2900 1777 61 62 2338 530 326 4.4 77 271 273 258723
Thermococcus sibiricus MM 739 A 2035 1331 65 64 1794 509 365 3.5 72 273 266 265678
Staphylothermus marinus F1 A 1573 1008 64 60 1339 446 217 3 67 289 272 201581
Methanococcus maripaludis C5 A 1822 1218 67 62 1643 509 318 3.2 69 282 263 246653
Methanosaeta thermophila PT A 1696 1182 70 64 1663 512 297 3.2 69 303 279 283669
Thermoplasmatales archaeon BRNA1 A 1523 1006 66 61 1395 469 236 3 66 291 269 241582
Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 A 1793 1129 63 58 1621 500 289 3.2 69 310 286 272656
Haloquadratum walsbyi DSM 16790 A 2643 1595 60 56 2218 570 292 3.9 74 298 276 314792
Methanoculleus marisnigri JR1 A 2490 1636 66 63 2312 598 316 3.9 74 289 276 341834
Candidatus Caldiarchaeum subterraneum A 1730 1253 72 67 1661 486 259 3.4 71 295 272 222628
Thermofilum pendens Hrk 5 A 1878 1213 65 59 1568 449 211 3.5 71 290 267 203586
Pyrobaculum islandicum DSM 4184 A 1978 1283 65 64 1660 464 249 3.6 72 267 264 221617
Methanocaldococcus fervens AG86 A 1581 1084 69 65 1473 498 324 3 66 281 265 240616
Halorhabdus utahensis DSM 12940 A 2998 1820 61 56 2625 597 324 4.4 77 304 281 358894
Methanoregula boonei 6A8 A 2452 1619 66 62 2402 584 303 4.1 76 297 280 330852
Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 A 3560 2042 57 55 2864 603 328 4.7 79 290 280 336896
Thermoproteus tenax Kra 1 A 2049 1324 65 65 1740 480 268 3.6 72 270 270 229638
Halomicrobium mukohataei DSM 12286 A 3349 1993 60 59 2812 610 336 4.6 78 286 282 361898
Methanocorpusculum labreanum Z A 1741 1199 69 63 1653 525 263 3.1 68 300 275 285671
Thermococcus onnurineus NA1 A 1975 1301 66 62 1738 509 359 3.4 71 281 263 253675
Ignisphaera aggregans DSM 17230 A 1930 1183 61 58 1502 458 244 3.3 70 278 265 201616
Pyrobaculum sp. 1860 A 2824 1552 55 55 1988 498 272 4 75 260 260 236681
Methanosaeta concilii GP6 A 2850 1764 62 57 2441 584 320 4.2 76 295 274 346831
Pyrobaculum oguniense TE7 A 2835 1569 55 57 2020 506 281 4 75 252 259 244696
Pyrococcus furiosus COM1 A 2064 1415 69 66 1924 534 402 3.6 72 277 267 277691
Vulcanisaeta moutnovskia 768-28 A 2320 1438 62 61 1906 495 269 3.9 74 288 281 250645
Halobacterium sp. NRC-1 A 2622 1596 61 59 2192 549 290 4 75 281 272 305757
Pyrococcus sp. ST04 A 1748 1248 71 65 1715 515 386 3.3 70 297 272 270654
Pyrococcus yayanosii CH1 A 1865 1209 65 63 1641 495 356 3.3 70 275 265 253639
Pyrolobus fumarii 1A A 1967 1182 60 57 1531 462 236 3.3 70 273 261 207619
Haloarcula marismortui ATCC 43049 A 4243 2428 57 57 3493 639 355 5.5 82 284 283 3781019
Thermofilum sp. 1910b A 1896 1214 64 61 1579 460 214 3.4 71 276 264 214613
Methanobacterium sp. AL-21 A 2493 1604 64 62 2328 551 334 4.2 76 287 277 327801
Vulcanisaeta distributa DSM 14429 A 2493 1513 61 59 1984 507 277 3.9 74 284 278 252678
Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H A 1873 1249 67 62 1748 523 336 3.3 70 281 262 296715
Methanoplanus petrolearius DSM 11571 A 2785 1709 61 57 2433 576 305 4.2 76 297 278 332835
Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 A 1771 1177 66 62 1614 499 322 3.2 69 284 264 267646
Acidianus hospitalis W1 A 2329 1442 62 61 1897 503 284 3.8 73 266 262 245680
Thermogladius cellulolyticus 1633 A 1413 952 67 63 1254 423 209 3 66 290 271 181531

Jump to [ Top of page · Model Eukaryotes · Model Prokaryotes · Prokaryote strains · Meta-genomics · Pseudogenes · Other ]

Eukaryote strains/versions
Genome name Dom No. of sequences No. with assignment % with assign. % total sequence coverage No. of domains assigned No. of supfam.s No. of fam.s Average Supfam. size % produced by duplication Average sequence length Average length matched No. of domain pairs No. of unique architectures
Plasmodium falciparum Dd2  E 5139 2010 39 21 3083 567 252 5.4 82 592 321 3071102
Plasmodium falciparum HB3  E 5462 2666 49 22 4061 645 304 6.3 84 693 319 3841365
Saccharomyces cerevisiae RM11-1a  E 5381 3372 63 41 4896 754 640 6.5 85 474 307 5011549
Saccharomyces cerevisiae SGD E 6717 3668 55 39 5404 778 666 6.9 86 450 319 5361632
Histoplasma capsulatum G186AR E 9233 4628 50 35 6727 864 647 7.8 87 452 317 6171999
Histoplasma capsulatum H143 E 9532 4475 47 35 6309 847 597 7.4 87 405 300 5981953
Histoplasma capsulatum H88 E 9428 4584 49 35 6672 864 640 7.7 87 445 318 6231998
Ascaris suum Victoria/Ghent  E 18449 8414 46 38 13322 953 776 14 93 328 276 9833136
Caenorhabditis elegans WormBase WS218  E 24761 13167 53 39 22808 944 787 24.2 96 440 320 9763270
Cryptococcus neoformans JEC21  E 5882 3730 63 38 5401 783 541 6.9 86 535 317 5171683
Drosophila melanogaster FlyBase 5.12 E 22307 14598 65 37 30012 985 895 30.5 97 608 345 10423448
Hordeum vulgare 22 E 62236 35699 57 42 48165 946 759 50.9 98 352 259 8483964
Aspergillus fumigatus A1163  E 9929 6090 61 41 8803 893 713 9.9 90 484 327 6732187
Neospora caninum Nc-Liverpool 6.2 E 7082 3658 52 19 5772 711 381 8.1 88 853 316 4991725
Saccharomyces cerevisiae AWRI1631 E 4747 2468 52 39 3412 683 532 5 80 376 285 3901237
Saccharomyces cerevisiae AWRI796 E 6295 3229 51 41 4351 739 589 5.9 83 331 267 4241487
Saccharomyces cerevisiae CBS7960 E 5333 2840 53 40 3955 711 578 5.6 82 388 289 4281373
Saccharomyces cerevisiae CLIB215 E 5051 2674 53 39 3666 700 562 5.2 81 381 282 4121298
Saccharomyces cerevisiae CLIB324 E 3733 1865 50 42 2500 618 437 4 75 320 269 2981010
Saccharomyces cerevisiae CLIB382 E 937 312 33 39 384 219 102 1.8 43 177 207 49242
Saccharomyces cerevisiae FL100 E 3909 1961 50 41 2650 614 461 4.3 77 331 271 3111033
Saccharomyces cerevisiae FostersB E 6240 3186 51 41 4252 730 601 5.8 83 332 265 4031420
Saccharomyces cerevisiae FostersO E 6239 3101 50 41 4092 721 581 5.7 82 312 257 3851427
Saccharomyces cerevisiae JAY291 E 6143 3412 56 39 4965 765 649 6.5 85 442 309 5211574
Saccharomyces cerevisiae LalvinQA23 E 6293 3285 52 41 4481 732 608 6.1 84 350 274 4311484
Saccharomyces cerevisiae M22 E 2548 1159 45 41 1511 485 318 3.1 68 281 257 197687
Coccidioides immitis H538.4  E 10593 4647 44 36 6428 841 609 7.6 87 356 293 5761926
Coccidioides immitis RMSCC 2394  E 10408 4766 46 36 6875 858 658 8 88 403 316 6211975
Coccidioides immitis RMSCC 3703  E 10463 4666 45 36 6361 833 588 7.6 87 351 285 5601945
Coccidioides posadasii str. Silveira  E 10228 4771 47 36 6895 860 656 8 88 409 317 6091967
Paracoccidioides brasiliensis Pb01  E 9136 4288 47 33 6243 853 615 7.3 86 442 315 5991990
Paracoccidioides brasiliensis Pb03  E 7876 4220 54 35 6151 848 613 7.3 86 477 315 6171962
Candida albicans WO-1  E 5931 3626 61 39 5170 791 591 6.5 85 478 307 5131648
Schizosaccharomyces pombe 972h-  E 5025 3342 67 45 5006 771 586 6.5 85 470 319 5501553
Saccharomyces cerevisiae PW5 E 5523 3041 55 40 4388 741 613 5.9 83 423 307 4761459
Saccharomyces cerevisiae RM11-1a E 6284 3473 55 39 5038 763 643 6.6 85 434 306 5091585
Saccharomyces cerevisiae Sigma1278b E 6419 3539 55 39 5191 770 652 6.7 85 445 313 5231601
Saccharomyces cerevisiae T7 E 6293 3501 56 39 5091 769 653 6.6 85 446 309 5191589
Saccharomyces cerevisiae T73 E 3324 1594 48 41 2105 543 388 3.9 74 316 269 257887
Saccharomyces cerevisiae UC5 E 5599 3045 54 39 4399 741 608 5.9 83 422 303 4721451
Saccharomyces cerevisiae VL3 E 6322 3289 52 41 4516 741 612 6.1 84 354 278 4411500
Saccharomyces cerevisiae W303 E 6440 3513 55 39 5112 768 656 6.7 85 431 309 5141596
Saccharomyces cerevisiae Vin13 E 6321 3312 52 41 4469 740 596 6 83 348 271 4411495
Saccharomyces cerevisiae YJM269 E 5396 2935 54 40 4133 731 597 5.7 82 401 293 4481388
Saccharomyces cerevisiae Y10 E 2656 1254 47 41 1633 509 329 3.2 69 296 255 207755
Saccharomyces cerevisiae YJM789 E 6378 3532 55 39 5179 769 655 6.7 85 446 313 5201597
Saccharomyces cerevisiae YPS163 E 3152 1521 48 41 1979 546 370 3.6 72 308 264 226846
Trypanosoma brucei Lister 427 v4.1 E 8529 4276 50 30 6118 677 385 9 89 529 316 4551612
Xenopus (Silurana) tropicalis v7.1 (annotation v7.2) E 38731 28559 74 47 52224 1175 1408 44.4 98 478 306 17465396
Batrachochytrium dendrobatidis JEL423  E 8818 4550 52 33 6696 806 590 8.3 88 470 304 6531944
Batrachochytrium dendrobatidis JAM81  E 8732 4667 53 36 6808 865 643 7.9 87 450 306 6681942
Ajellomyces dermatitidis ER-3  E 9522 4746 50 35 6802 870 653 7.8 87 449 314 6092002
Cryptococcus neoformans B-3501A  E 6578 4184 64 37 6030 827 593 7.3 86 542 316 5621836
Cryptococcus neoformans var. grubii H99  E 6967 4109 59 36 5899 828 588 7.1 86 512 313 5641808
Oryza sativa ssp. Indica E 49710 23194 47 39 34371 1074 950 32 97 377 312 18194927
Anopheles gambiae VectorBase AgamP3.6  E 14324 9414 66 40 17297 981 879 17.6 94 527 320 10323227
Saccharomyces cerevisiae YJM789  E 5863 3613 62 40 5279 776 662 6.8 85 484 313 5241621
Theobroma cacao Matina 1-6 v0.9 E 34996 19649 56 44 28934 960 814 30.1 97 413 322 10733712

Jump to [ Top of page · Model Eukaryotes · Model Prokaryotes · Eukaryote strains/versions · Meta-genomics · Pseudogenes · Other ]

Prokaryote strains
Genome name Dom No. of sequences No. with assignment % with assign. % total sequence coverage No. of domains assigned No. of supfam.s No. of fam.s Average Supfam. size % produced by duplication Average sequence length Average length matched No. of domain pairs No. of unique architectures
Mycoplasma parvum str. Indiana B 581 266 46 44 382 205 80 1.9 46 287 278 88211
Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 B 1527 1104 72 63 1590 484 303 3.3 70 356 309 270644
Cyanothece sp. PCC 8801 B 4367 2764 63 61 4043 755 527 5.4 81 308 296 5031237
Streptococcus intermedius C270 B 1778 1264 71 64 1842 537 402 3.4 71 315 286 323700
Listeria monocytogenes HCC23 B 2974 2050 69 66 2979 685 567 4.3 77 295 280 417958
Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 B 4183 2731 65 65 3957 699 521 5.7 82 303 301 4741116
Escherichia coli IAI39 B 4725 3345 71 66 4797 847 1077 5.7 82 312 290 5841289
Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 B 1534 1112 72 65 1565 516 331 3 67 316 281 284669
Streptococcus pyogenes A20 B 1828 1209 66 64 1740 547 396 3.2 69 287 278 316676
Synechococcus sp. JA-2-3B'a(2-13) B 2862 1769 62 60 2543 673 456 3.8 74 302 295 394959
Gardnerella vaginalis ATCC 14019 B 1365 923 68 59 1366 456 268 3 67 355 309 251577
Mycobacterium tuberculosis EAI5 B 3902 2685 69 62 3779 666 494 5.7 82 323 291 4331081
Hydrogenobacter thermophilus TK-6 B 1893 1340 71 68 1937 586 393 3.3 70 294 284 332759
Mycobacterium sp. JDM601 B 4346 3019 69 64 4266 653 474 6.5 85 322 296 4301061
Bacillus amyloliquefaciens IT-45 B 3860 2541 66 67 3849 752 673 5.1 80 300 303 4791109
Alteromonas macleodii str. 'Balearic Sea AD45' B 3966 2743 69 63 4196 751 722 5.6 82 341 312 5391246
Pseudomonas aeruginosa DK2 B 5883 4117 70 65 6123 840 843 7.3 86 320 298 5701427
Pseudomonas aeruginosa M18 B 5684 4113 72 66 6151 846 843 7.3 86 329 302 5741430
Pseudomonas aeruginosa NCGM2.S1 B 6268 4237 68 64 6290 847 847 7.4 87 317 299 5771441
Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 B 1192 740 62 65 1116 445 281 2.5 60 282 293 239502
Alteromonas macleodii str. 'Ionian Sea U8' B 3795 2644 70 65 4081 753 721 5.4 82 332 311 5341230
Enterobacter cloacae SCF1 B 4399 3275 74 68 4804 826 1036 5.8 83 323 295 5781269
Cyanothece sp. PCC 7822 B 6642 3732 56 55 5811 792 564 7.3 86 324 315 6331519
Pseudomonas fluorescens A506 B 5334 3760 70 65 5602 813 769 6.9 85 330 302 5501351
Pseudomonas fluorescens F113 B 5862 4282 73 65 6375 832 783 7.7 87 337 301 5931453
Pseudomonas putida ND6 B 6391 3882 61 63 5858 823 782 7.1 86 295 304 5731397
Serratia sp. AS13 B 4951 3646 74 69 5371 829 989 6.5 85 318 299 5811303
Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970 B 614 392 64 49 581 280 122 2.1 52 372 284 140299
Shigella flexneri 2002017 B 4703 3029 64 63 4244 826 1013 5.1 81 279 276 5481225
Pseudomonas putida BIRD-1 B 4960 3602 73 66 5446 803 766 6.8 85 334 304 5551327
Pseudomonas putida DOT-T1E B 5721 3902 68 65 5861 811 764 7.2 86 318 301 5581390
Pseudomonas putida S16 B 5218 3689 71 66 5554 812 756 6.8 85 324 302 5641364
Chlamydia pecorum PV3056/3 B 921 621 67 57 947 400 209 2.4 58 367 310 211449
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836 B 4357 3093 71 66 4508 837 1048 5.4 81 312 292 5521254
Streptococcus agalactiae 2-22 B 1548 1209 78 72 1722 536 385 3.2 69 305 280 314667
Pseudomonas stutzeri ATCC 17588 = LMG 11199 B 4217 2892 69 65 4324 767 729 5.6 82 316 300 5311237
Acinetobacter baumannii BJAB07104 B 3861 2530 66 63 3675 718 614 5.1 80 303 291 4481045
Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 B 4300 2986 69 65 4455 773 740 5.8 83 321 298 5351249
Octadecabacter arcticus 238 B 4683 3108 66 60 4283 708 525 6 83 304 277 4431082
Geobacter sulfurreducens PCA B 3430 2475 72 65 3961 721 501 5.5 82 336 304 5311191
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. 24249 B 4342 3054 70 66 4470 831 1038 5.4 81 315 293 5541247
Coxiella burnetii CbuG_Q212 B 1864 1114 60 63 1663 570 426 2.9 66 278 295 324686
Helicobacter pylori HPAG1 B 1539 967 63 57 1388 512 301 2.7 63 318 287 264606
Leisingera methylohalidivorans DSM 14336 B 4530 2975 66 66 4329 730 552 5.9 83 289 289 4611153
Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 B 1438 1021 71 67 1489 539 385 2.8 64 312 296 303638
Helicobacter pylori G27 B 1504 956 64 58 1372 510 302 2.7 63 318 289 262601
Pseudomonas stutzeri DSM 10701 B 3815 2688 70 66 4020 756 726 5.3 81 319 298 5131177
Escherichia coli S88 B 4823 3273 68 64 4773 853 1085 5.6 82 311 294 5891306
Staphylococcus pseudintermedius ED99 B 2356 1650 70 67 2376 652 526 3.6 73 300 287 391838
Klebsiella pneumoniae 342 B 5766 4036 70 69 5856 840 1064 7 86 298 295 5931337
Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E B 728 630 87 78 1003 443 319 2.3 56 336 303 244473
Ralstonia solanacearum CMR15 B 5023 3218 64 60 4774 788 649 6.1 83 323 303 5161281
Dickeya dadantii 3937 B 4549 3142 69 66 4553 810 908 5.6 82 311 298 5511236
Burkholderia sp. CCGE1003 B 5988 4404 74 69 6498 800 742 8.1 88 334 312 5501430
Pseudomonas stutzeri DSM 4166 B 4301 2995 70 65 4499 768 732 5.9 83 321 298 5371257
Helicobacter pylori PeCan4 B 1563 954 61 57 1380 508 301 2.7 63 310 290 263600
Taylorella asinigenitalis 14/45 B 1415 1046 74 66 1621 568 409 2.9 65 337 302 332695
Leptospirillum ferriphilum ML-04 B 2471 1502 61 62 2239 578 338 3.9 74 292 300 347807
Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 B 4422 2901 66 63 4244 813 966 5.2 81 303 292 5461234
Mycoplasma haemofelis str. Langford 1 B 1545 287 19 22 422 219 94 1.9 48 235 280 99221
Enterococcus faecium NRRL B-2354 B 2639 1701 64 62 2427 582 486 4.2 76 285 276 350797
Clostridium botulinum BKT015925 B 2994 1843 62 58 2711 656 429 4.1 76 302 286 429934
Rickettsia typhi str. TH1527 B 838 618 74 66 927 422 223 2.2 54 332 297 203436
Haemophilus influenzae 86-028NP B 1792 1282 72 66 1881 597 583 3.2 68 308 286 357752
Streptococcus salivarius JIM8777 B 1979 1354 68 61 1987 568 427 3.5 71 326 292 337742
Haemophilus influenzae Rd KW20 B 1610 1251 78 71 1853 599 595 3.1 68 316 289 356738
Rahnella aquatilis HX2 B 5082 3659 72 67 5295 830 964 6.4 84 318 295 5651284
Propionibacterium acnes C1 B 2359 1590 67 64 2265 591 393 3.8 74 310 297 365854
Helicobacter pylori 26695 B 1469 949 65 57 1366 510 304 2.7 63 329 290 265601
Helicobacter pylori J99 B 1488 958 64 56 1381 509 304 2.7 63 332 291 262606
Mycoplasma gallisepticum WI01_2001.043-13-2P B 746 463 62 46 670 308 136 2.2 54 374 278 143334
Mycoplasma hyopneumoniae 7448 B 657 429 65 48 633 280 128 2.3 56 399 293 142301
Ralstonia solanacearum Po82 B 5016 3219 64 59 4755 795 658 6 83 327 301 5151337
Escherichia coli JJ1886 B 5049 3369 67 64 4876 854 1080 5.7 82 304 291 5851311
Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 B 3343 2275 68 63 3553 670 433 5.3 81 331 305 4831118
Paenibacillus polymyxa SC2 B 6032 3613 60 62 5385 764 628 7 86 289 300 5551288
Listeria monocytogenes EGD-e B 2867 2075 72 67 3029 681 569 4.4 78 305 282 416944
Amycolatopsis orientalis HCCB10007 B 8113 5732 71 64 8337 786 607 10.6 91 331 301 6261543
Candidatus Blochmannia vafer str. BVAF B 587 519 88 80 810 390 330 2.1 52 334 301 206395
Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172 B 2870 1871 65 63 2772 673 557 4.1 76 291 282 408897
Lactobacillus amylovorus GRL 1112 B 2121 1293 61 60 1845 516 348 3.6 72 287 282 285635
Geobacillus sp. Y412MC52 B 3459 2274 66 65 3271 743 653 4.4 77 294 291 4721054
Bacillus subtilis BSn5 B 4145 2687 65 66 3925 774 704 5.1 80 287 293 4881136
Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 B 1924 1318 69 60 1922 518 316 3.7 73 355 308 310729
Gordonibacter pamelaeae 7-10-1-b B 2021 1268 63 59 1726 447 236 3.9 74 292 274 218591
Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD B 1064 646 61 56 1004 428 194 2.3 57 338 311 224481
Variovorax paradoxus EPS B 5952 4305 72 66 6258 814 656 7.7 87 335 305 5481374
Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 B 2838 2026 71 64 3015 695 513 4.3 77 350 315 4471046
Alicycliphilus denitrificans BC B 4542 3242 71 67 4706 734 603 6.4 84 321 301 4771162
Prevotella dentalis DSM 3688 B 2544 1625 64 54 2414 558 363 4.3 77 382 325 360849
Staphylococcus aureus 04-02981 B 2648 1783 67 64 2659 662 549 4 75 297 284 397875
Francisella tularensis subsp. holarctica LVS B 1754 1211 69 66 1754 559 400 3.1 68 296 281 315687
Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 B 2109 1515 72 67 2125 555 447 3.8 74 296 276 326737
Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 B 3257 2169 67 62 3215 698 491 4.6 78 308 288 4701041
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 B 4633 3011 65 64 4386 832 1032 5.3 81 293 289 5411233
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 B 4632 3066 66 65 4473 829 1032 5.4 81 298 292 5451242
Shewanella baltica OS223 B 4436 2935 66 60 4403 792 771 5.6 82 334 302 5531291
Anaeromyxobacter sp. K B 4457 3079 69 61 4664 758 532 6.2 84 342 303 5561343
Rickettsia canadensis str. CA410 B 1016 632 62 64 939 432 220 2.2 54 280 289 206446
Rickettsia massiliae str. AZT80 B 1207 713 59 62 1032 451 225 2.3 56 259 271 214482
Mycobacterium canettii CIPT 140070010 B 3941 2775 70 61 3957 666 493 5.9 83 339 294 4411083
Ehrlichia muris AS145 B 904 623 69 62 932 419 236 2.2 55 320 287 207446
Bifidobacterium longum subsp. longum F8 B 1681 1118 67 60 1610 463 283 3.5 71 336 306 262638
Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III B 3038 2030 67 63 2847 592 439 4.8 79 297 281 360819
Bordetella parapertussis 18323 B 3377 2697 80 74 4050 707 585 5.7 83 325 302 441994
Frankia sp. EuI1c B 7083 5267 74 65 7480 726 503 10.3 90 356 310 5491440
Mycoplasma bovis PG45 B 765 516 67 54 742 297 150 2.5 60 362 289 150329
Anaplasma marginale str. Dawn B 794 521 66 62 787 382 210 2.1 51 309 293 183395
Lactobacillus reuteri TD1 B 1945 1318 68 61 1853 542 389 3.4 71 315 282 289679
Bifidobacterium bifidum PRL2010 B 1706 1210 71 60 1780 527 308 3.4 70 361 305 314727
Alteromonas macleodii str. 'Ionian Sea U7' B 3856 2650 69 64 4084 754 717 5.4 82 331 310 5331230
Thermoanaerobacter sp. X513 B 2331 1661 71 68 2477 662 492 3.7 73 303 289 436902
Mycoplasma suis str. Illinois B 845 273 32 35 392 200 81 2 49 260 279 88208
Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 B 1893 1253 66 63 1813 535 386 3.4 70 295 280 329684
Borrelia burgdorferi ZS7 B 1239 611 49 49 922 386 175 2.4 58 297 297 192427
Campylobacter jejuni RM1221 B 1838 1172 64 61 1656 565 344 2.9 66 293 282 299718
Acinetobacter baumannii AB307-0294 B 3451 2388 69 65 3478 708 605 4.9 80 312 294 4351022
Bacillus cereus AH187 B 5783 3420 59 60 4757 780 674 6.1 84 269 275 5121180
Cyanothece sp. PCC 7424 B 5710 3273 57 57 4900 776 560 6.3 84 310 306 5571390
Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 B 6360 3720 58 56 6153 770 539 8 87 335 321 5701592
Oligotropha carboxidovorans OM5 B 3629 2427 67 63 3557 711 525 5 80 312 292 4261067
Escherichia coli IAI1 B 4345 3074 71 66 4533 848 1073 5.3 81 316 296 5841284
Thermus thermophilus JL-18 B 2402 1746 73 69 2468 646 583 3.8 74 300 283 405856
Escherichia coli UMN026 B 5010 3393 68 63 4930 864 1092 5.7 82 312 291 5911338
Bifidobacterium longum subsp. longum BBMN68 B 1804 1286 71 63 1877 509 323 3.7 73 353 310 307707
Rickettsia prowazekii str. Chernikova B 845 622 74 66 932 422 228 2.2 55 330 296 205442
Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F' B 3180 2260 71 63 3502 678 445 5.2 81 349 308 4701130
Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 B 900 592 66 58 907 393 204 2.3 57 347 306 201437
Rickettsia prowazekii str. Dachau B 839 617 74 67 921 420 226 2.2 54 325 295 201438
Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 B 6415 4693 73 69 6697 765 630 8.8 89 309 292 5021320
Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 B 4647 3160 68 64 4583 852 1083 5.4 81 309 290 5741277
Helicobacter pylori Rif2 B 1591 967 61 56 1385 513 305 2.7 63 309 287 264606
Bacillus cereus AH820 B 5810 3432 59 61 4787 785 680 6.1 84 268 276 5071187
Acinetobacter baumannii ZW85-1 B 3584 2487 69 65 3625 711 623 5.1 80 314 295 4471044
Acinetobacter baumannii AB0057 B 3801 2483 65 63 3588 715 612 5 80 303 291 4341033
Helicobacter pylori P12 B 1578 963 61 55 1383 511 303 2.7 63 318 287 265607
Buchnera aphidicola str. 5A (Acyrthosiphon pisum) B 555 492 89 81 805 392 347 2.1 51 330 303 216375
Escherichia coli ED1a B 4911 3193 65 63 4654 839 1065 5.5 82 304 293 5771272
Rickettsia prowazekii str. GvV257 B 829 612 74 67 920 420 229 2.2 54 329 297 204435
Rickettsia prowazekii str. Katsinyian B 844 621 74 66 931 422 228 2.2 55 329 296 205442
Lactobacillus casei BD-II B 3199 1937 61 61 2718 593 435 4.6 78 276 278 349798
Lactobacillus casei LC2W B 3164 1935 61 62 2722 592 436 4.6 78 275 279 348795
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus 2038 B 1792 1265 71 67 1784 509 330 3.5 71 285 271 280635
Enterococcus mundtii QU 25 B 3221 1880 58 55 2688 601 500 4.5 78 292 274 370835
Pseudomonas aeruginosa SCV20265 B 6299 4236 67 64 6301 849 845 7.4 87 315 300 5771444
Lactobacillus fermentum CECT 5716 B 1051 800 76 67 1221 366 265 3.3 70 377 331 234433
Lactobacillus helveticus H10 B 1978 1269 64 62 1836 512 342 3.6 72 294 283 290648
Lactobacillus johnsonii DPC 6026 B 1772 1222 69 62 1754 503 333 3.5 71 323 289 278622
Lactobacillus reuteri SD2112 B 2300 1533 67 62 2096 551 397 3.8 74 291 271 308712
Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787 B 3778 2389 63 60 3437 717 556 4.8 79 294 278 4691124
Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 B 2886 1835 64 63 2588 589 441 4.4 77 287 285 348790
Lactobacillus rhamnosus LOCK908 B 2924 1838 63 62 2592 592 441 4.4 77 290 286 346793
Cylindrospermum stagnale PCC 7417 B 6229 3594 58 56 5493 783 551 7 86 324 314 5841478
Bordetella bronchiseptica 253 B 4781 3705 77 72 5315 760 634 7 86 329 306 4901157
Roseburia intestinalis XB6B4 B 3610 2133 59 58 3120 650 408 4.8 79 298 292 4451003
Lactobacillus reuteri I5007 B 2054 1401 68 64 1957 543 391 3.6 72 294 274 296682
Yersinia pestis D106004 B 3781 2805 74 65 4157 777 897 5.4 81 340 299 5251192
Achromobacter xylosoxidans NBRC 15126 = ATCC 27061 B 6065 4390 72 68 6349 788 675 8.1 88 324 303 5391310
Rickettsia rickettsii  str. Hlp#2 B 1308 734 56 61 1052 460 230 2.3 56 244 266 211492
Lactobacillus rhamnosus GG B 2913 1838 63 61 2581 588 438 4.4 77 292 283 349794
Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 B 2817 1989 71 65 2797 609 397 4.6 78 327 301 389901
Gloeobacter kilaueensis Gloeobacter sp. JS B 4507 2803 62 60 4109 723 503 5.7 82 315 302 4861201
Candidatus Kinetoplastibacterium galatii TCC219 B 727 633 87 78 1001 447 327 2.2 55 336 301 248472
Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 B 1748 1292 74 67 1928 599 429 3.2 69 334 304 352786
Chlamydia trachomatis L2b/LST B 898 592 66 58 907 393 204 2.3 57 348 306 201437
Lactococcus garvieae Lg2 B 1968 1329 68 64 1887 540 403 3.5 71 289 275 310698
Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 B 2769 1754 63 63 2381 566 450 4.2 76 262 260 328772
Bacteroides xylanisolvens XB1A B 4405 2749 62 55 4107 624 439 6.6 85 364 323 4541088
Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 B 2510 1676 67 65 2307 569 450 4.1 75 278 269 332765
Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 B 2408 1566 65 63 2220 574 453 3.9 74 290 280 331760
Legionella pneumophila subsp. pneumophila ATCC 43290 B 2926 1928 66 58 2763 675 546 4.1 76 340 298 410972
Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 B 1709 1269 74 68 1869 595 427 3.1 68 330 301 343769
Legionella pneumophila subsp. pneumophila B 3221 2081 65 57 2961 697 551 4.2 76 327 290 4251018
Chlamydia trachomatis L3/404/LN B 895 591 66 58 906 393 204 2.3 57 349 306 201437
Chlamydia trachomatis RC-J/953 B 920 583 63 58 897 392 202 2.3 56 337 307 202436
Streptomyces albus J1074 B 5832 4062 70 64 6000 749 546 8 88 339 310 5581391
Listeria monocytogenes serotype 4b str. LL195 B 2838 2023 71 67 2972 672 559 4.4 77 305 285 415952
Wolbachia endosymbiont of Drosophila simulans wNo B 1040 695 67 59 1043 439 250 2.4 58 336 295 224485
Chlamydia trachomatis RC-Fs852 B 954 598 63 58 923 397 204 2.3 57 334 308 202436
Escherichia coli BL21(DE3) B 4192 3008 72 67 4443 837 1059 5.3 81 315 296 5671255
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 B 1937 1390 72 69 1999 551 382 3.6 72 302 291 319689
Lactobacillus brevis KB290 B 2582 1680 65 62 2290 565 412 4.1 75 287 275 308752
Listeria monocytogenes 07PF0776 B 2797 2025 72 68 2965 673 564 4.4 77 302 282 412931
Nocardiopsis alba ATCC BAA-2165 B 5508 3468 63 61 4864 725 502 6.7 85 304 294 4971215
Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 B 898 592 66 58 907 393 204 2.3 57 348 306 201437
Bacillus thuringiensis YBT-1518 B 6738 3834 57 59 5265 784 677 6.7 85 264 272 5041196
Nocardia brasiliensis ATCC 700358 B 8414 5947 71 65 8411 758 559 11.1 91 327 300 5481452
Listeria monocytogenes 10403S B 2814 2053 73 67 3005 681 568 4.4 77 306 283 414941
Listeria monocytogenes Finland 1998 B 2762 2046 74 68 2992 677 568 4.4 77 308 283 412939
Listeria monocytogenes FSL R2-561 B 2910 2087 72 66 3034 680 566 4.5 78 302 280 413944
Mycoplasma hyopneumoniae 168-L B 683 431 63 48 633 281 125 2.3 56 380 289 141300
Listeria monocytogenes J0161 B 2955 2088 71 66 3043 680 567 4.5 78 301 282 416947
Listeria monocytogenes M7 B 2977 2055 69 66 2985 685 567 4.4 77 295 280 417958
Listeria monocytogenes L99 B 2925 2051 70 66 2991 686 567 4.4 77 301 282 418960
Haemophilus parasuis ZJ0906 B 2211 1454 66 64 2103 626 583 3.4 70 285 275 368791
Bacillus subtilis subsp. natto BEST195 B 4381 2682 61 65 3784 757 688 5 80 264 278 4781120
Enterococcus faecalis str. Symbioflor 1 B 2733 1815 66 62 2644 623 531 4.2 76 302 282 393851
Eubacterium siraeum V10Sc8a B 2202 1334 61 56 1961 540 320 3.6 72 313 288 333754
Streptococcus mutans LJ23 B 1921 1391 72 68 2012 566 414 3.6 72 300 283 339736
Sinorhizobium meliloti 2011 B 4942 3624 73 69 5225 754 605 6.9 86 313 295 4851238
Chlamydia psittaci VS225 B 1116 655 59 54 954 404 207 2.4 58 311 288 198461
Methylophaga sp. JAM7 B 2691 1779 66 63 2645 672 546 3.9 75 311 294 412945
Chlamydia trachomatis L1/115 B 897 592 66 58 907 393 204 2.3 57 348 306 201437
Chlamydia trachomatis L1/440/LN B 892 586 66 58 900 393 204 2.3 56 348 307 201435
Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 B 898 592 66 58 907 393 204 2.3 57 348 306 201437
Chlamydia psittaci 84/55 B 1127 653 58 54 960 407 200 2.4 58 310 289 200463
Mycobacterium bovis BCG str. Mexico B 3951 2774 70 61 3956 665 496 5.9 83 333 292 4501100
Enterobacter cloacae subsp. cloacae ENHKU01 B 4338 3180 73 67 4651 820 1020 5.7 82 320 294 5521230
Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 B 3057 1968 64 60 2769 632 436 4.4 77 312 293 377944
Chlamydia pecorum P787 B 925 622 67 57 950 400 209 2.4 58 367 309 214450
Brucella ceti TE28753-12 B 2376 1877 79 73 2613 631 475 4.1 76 297 275 355888
Mycobacterium intracellulare MOTT-02 B 5149 3725 72 69 5308 666 493 8 87 319 304 4391115
Mycobacterium intracellulare MOTT-64 B 5249 3785 72 69 5376 661 492 8.1 88 318 303 4401112
Helicobacter pylori BM012A B 1571 979 62 56 1413 511 303 2.8 64 317 286 265605
Helicobacter pylori UM066 B 1580 936 59 56 1348 501 292 2.7 63 306 290 257587
Riemerella anatipestifer RA-GD B 1985 1234 62 58 1760 571 352 3.1 68 315 295 314706
Mycobacterium sp. MOTT36Y B 5128 3748 73 68 5378 672 487 8 88 329 306 4481144
Streptococcus pyogenes M1 476 B 1571 1135 72 65 1665 519 392 3.2 69 326 292 318653
Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 B 4156 2853 69 61 4018 668 497 6 83 323 288 4431104
Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 B 3590 2654 74 63 3809 636 487 6 83 354 299 4371044
Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 B 3944 2802 71 61 3956 669 497 5.9 83 335 290 4411098
Listeria monocytogenes EGD sequence B 2848 2068 73 68 3017 681 569 4.4 77 302 281 412944
Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 B 3996 2816 70 61 3973 669 498 5.9 83 335 290 4411101
Listeria monocytogenes serotype 1/2b str. SLCC2755 B 2940 2097 71 66 3059 679 571 4.5 78 305 282 418951
Mycoplasma hyorhinis SK76 B 753 495 66 54 708 299 142 2.4 58 333 272 147329
Mycobacterium tuberculosis str. Beijing/NITR203 B 4110 2818 69 62 3950 666 496 5.9 83 315 285 4361095
Mycoplasma gallisepticum NY01_2001.047-5-1P B 760 466 61 45 672 308 136 2.2 54 377 277 143335
Mycobacterium tuberculosis KZN 605 B 4001 2809 70 61 3954 667 496 5.9 83 333 289 4361093
Enterobacter aerogenes EA1509E B 5499 3688 67 66 5361 855 1060 6.3 84 298 295 5911346
Mycobacterium tuberculosis RGTB327 B 3691 2389 65 61 3162 613 427 5.2 81 275 262 362959
Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 B 4181 2846 68 63 4300 775 658 5.5 82 338 313 5391269
Chlamydia psittaci NJ1 B 1052 631 60 54 946 407 212 2.3 57 333 302 205454
Desulfitobacterium dichloroeliminans LMG P-21439 B 3340 2217 66 61 3211 686 486 4.7 79 309 284 4441020
Mycobacterium tuberculosis RGTB423 B 3622 2324 64 60 2997 606 414 4.9 80 266 251 326932
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 B 4712 3201 68 64 4637 844 1056 5.5 82 304 287 5611274
Streptococcus suis JS14 B 2066 1414 68 65 2008 571 429 3.5 72 296 280 331746
Vibrio alginolyticus NBRC 15630 = ATCC 17749 B 4698 3184 68 64 4733 800 836 5.9 83 313 294 5541304
Synechocystis sp. PCC 6803 substr. GT-I B 3169 2147 68 62 3197 696 495 4.6 78 326 297 4441065
Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 B 4474 2654 59 58 3916 745 629 5.3 81 306 299 5081212
Mycobacterium yongonense 05-1390 B 5390 3712 69 66 5309 670 496 7.9 87 316 304 4501147
Clostridium saccharolyticum Clostridium cf. saccharolyticum K10 B 3043 1774 58 58 2530 594 384 4.3 77 281 278 374873
Borrelia afzelii PKo B 1253 630 50 51 949 395 182 2.4 58 285 291 200447
Mycobacterium bovis BCG str. Korea 1168P B 4139 2800 68 61 3990 666 497 6 83 325 292 4481104
Mycobacterium tuberculosis UT205 B 3794 2688 71 63 3829 663 495 5.8 83 329 295 4391091
Alteromonas macleodii str. 'Black Sea 11' B 3772 2655 70 64 4094 746 716 5.5 82 344 312 5431223
Aeromonas hydrophila ML09-119 B 4434 3121 70 65 4657 811 844 5.7 83 320 295 5801310
Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 B 2679 1794 67 64 2664 669 551 4 75 296 284 398874
Amycolatopsis mediterranei S699 B 9222 6730 73 66 9793 795 614 12.3 92 329 299 6781691
Mycoplasma genitalium M2321 B 499 354 71 59 524 270 131 1.9 48 342 284 128279
Klebsiella pneumoniae JM45 B 5141 3608 70 69 5247 814 1022 6.4 84 300 293 5681261
Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 B 3849 2488 65 62 3541 692 532 5.1 80 311 299 4431064
Streptococcus pneumoniae INV200 B 1929 1346 70 66 1945 564 432 3.4 71 299 284 345732
Chlamydia trachomatis RC-L2s46 B 925 584 63 58 897 392 202 2.3 56 335 307 201435
Streptococcus pneumoniae ST556 B 2148 1425 66 65 2027 570 435 3.6 72 281 275 339735
Helicobacter pylori OK310 B 1493 956 64 57 1374 507 300 2.7 63 322 288 262606
Corynebacterium argentoratense DSM 44202 B 1875 1244 66 63 1836 562 367 3.3 69 322 304 324748
Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 B 2280 1494 66 65 2153 624 591 3.5 71 281 279 379818
Chthonomonas calidirosea T49 B 2809 1951 69 61 2933 652 422 4.5 78 363 321 444989
Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum sequencing B 4006 2652 66 66 4026 756 678 5.3 81 306 304 4771135
Hyphomicrobium denitrificans 1NES1 B 3842 2280 59 59 3333 688 497 4.8 79 291 291 4151062
Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA252 B 2650 1784 67 65 2680 663 553 4 75 297 287 401870
Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 B 2604 1811 70 65 2696 667 548 4 75 306 285 400874
Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 B 2321 1373 59 57 1897 563 325 3.4 70 291 281 295757
Riemerella anatipestifer RA-CH-2 B 2044 1274 62 58 1823 577 354 3.2 68 317 297 321721
Pandoraea pnomenusa 3kgm B 4800 3480 72 68 5030 763 680 6.6 85 322 300 4881243
Mycoplasma bovis Hubei-1 B 801 522 65 53 748 299 151 2.5 60 353 287 151336
Bdellovibrio exovorus JSS B 2618 1622 62 57 2323 617 377 3.8 73 313 286 353870
Listeria monocytogenes serotype 1/2c str. SLCC2372 B 2990 2105 70 66 3065 681 571 4.5 78 300 281 416953
Mycoplasma gallisepticum str. R(high) B 766 464 61 44 673 309 137 2.2 54 388 282 142339
Bacillus megaterium QM B1551 B 5612 3448 61 64 4874 776 683 6.3 84 267 279 5171197
Mycobacterium canettii CIPT 140060008 B 3981 2801 70 62 3974 669 498 5.9 83 333 291 4421090
Escherichia coli O103:H2 str. 12009 B 5117 3364 66 61 4821 864 1091 5.6 82 305 285 5771305
Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT B 880 581 66 58 893 388 200 2.3 57 350 307 201431
Streptococcus suis SS12 B 2079 1394 67 64 1977 566 431 3.5 71 294 281 328738
Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A B 2275 1442 63 65 2041 573 435 3.6 72 267 273 338742
Candidatus Nasuia deltocephalinicola str. NAS-ALF B 137 114 83 76 148 107 32 1.4 28 250 228 31104
Propionibacterium acnes KPA171202 B 2297 1593 69 63 2290 593 398 3.9 74 332 303 371867
Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C B 4346 3025 70 61 4590 749 530 6.1 84 349 304 5401339
Candidatus Sulcia muelleri CARI B 246 223 91 83 378 202 106 1.9 47 340 311 117191
Anaplasma marginale str. St. Maries B 948 636 67 55 975 443 248 2.2 55 360 297 227468
Alteromonas macleodii str. 'English Channel 615' B 3560 2364 66 63 3450 701 642 4.9 80 303 289 4431106
Mycoplasma gallisepticum NC95_13295-2-2P B 754 466 62 46 673 308 136 2.2 54 377 278 143334
Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 B 2767 1757 63 64 2606 662 546 3.9 75 282 284 396867
Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 B 2590 1756 68 65 2537 666 550 3.8 74 296 284 397865
Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10 B 4350 3196 73 66 4557 654 489 7 86 338 304 4371114
Listeria monocytogenes J1-220 B 2985 2079 70 66 3037 682 568 4.5 78 300 282 418953
Escherichia coli KO11FL B 4653 3166 68 63 4637 861 1093 5.4 81 314 292 5871307
Bacillus anthracis str. Sterne B 4955 3174 64 63 4416 771 666 5.7 83 281 276 4901135
Brucella abortus bv. 1 str. 9-941 B 3084 2073 67 69 3017 682 539 4.4 77 288 296 397966
Mycoplasma hyorhinis MCLD B 778 472 61 54 679 299 139 2.3 56 307 275 144324
Burkholderia cenocepacia AU 1054 B 6477 4755 73 69 6922 822 737 8.4 88 325 304 5591435
Mycoplasma genitalium M2288 B 506 364 72 60 538 275 136 2 49 342 287 129286
Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 B 2591 1777 69 65 2635 658 539 4 75 296 283 392866
Lactobacillus casei str. Zhang B 2847 1822 64 64 2589 590 435 4.4 77 287 285 345779
Stenotrophomonas maltophilia JV3 B 4063 2757 68 61 4140 758 635 5.5 82 332 301 5071202
Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 B 2110 1422 67 61 2034 572 381 3.6 72 324 295 333793
Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047 B 5518 3641 66 64 5250 837 1031 6.3 84 296 287 5741320
Bacillus anthracis str. Ames B 5039 3136 62 63 4357 769 664 5.7 82 273 276 4891118
Bacillus cereus ATCC 14579 B 5231 3261 62 62 4545 776 673 5.9 83 277 275 4881148
Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 B 3085 1829 59 49 2653 598 348 4.4 77 376 313 417956
Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) B 546 483 88 80 772 380 331 2 51 326 296 201368
Burkholderia mallei ATCC 23344 B 5022 3404 68 65 4940 783 705 6.3 84 312 301 5081282
Burkholderia lata B 7716 5626 73 67 8101 826 755 9.8 90 326 302 5611474
Mycoplasma pneumoniae FH B 629 411 65 54 598 280 142 2.1 53 333 275 136298
Bifidobacterium longum NCC2705 B 1728 1245 72 61 1822 513 319 3.6 72 371 314 308708
Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 B 2840 1893 67 64 2814 686 498 4.1 76 299 286 467968
Azotobacter vinelandii CA B 5048 3332 66 67 4969 801 744 6.2 84 303 309 5401286
Streptomyces davawensis JCM 4913 B 8616 5953 69 62 8567 789 599 10.9 91 332 300 6961689
Staphylococcus lugdunensis N920143 B 2425 1685 69 67 2447 644 506 3.8 74 299 289 387826
Pseudomonas stutzeri RCH2 B 4264 2951 69 65 4452 768 746 5.8 83 321 299 5401254
Mycoplasma gallisepticum NC08_2008.031-4-3P B 739 460 62 46 666 306 135 2.2 54 373 279 143332
Francisella cf. novicida Fx1 B 1818 1247 69 65 1798 577 428 3.1 68 315 299 331715