SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

Superfamily is undergoing a server migration - you are now browsing on the new server. Please contact us if you experience any problems.


Chalcone isomerase family domain assignments
in
all genomes

Assignment details

(show help)

25 selected genomes have 80 significant domains in 71 proteins.

Showing genomes 1 to 25 of 65
  1 2 3   Next Last

Selaginella moellendorffii has 2 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
jgi|Selmo1|151616|estExt_Genewise1.C_320384   2.22e-43   0.0000146   11-217   1eyq A:  
jgi|Selmo1|444624|estExt_fgenesh2_pg.C_450220   4.58e-47   0.0000124   11-216   1eyq A:  
 
Weak hits:
jgi|Selmo1|110038|e_gw1.39.355.1   0.0575   0.022   142-213   1eyq A:  
jgi|Selmo1|112032|e_gw1.43.528.1   3.66e-31   0.0045   3-184   1eyq A:  
jgi|Selmo1|125981|e_gw1.81.263.1   3.92e-31   0.0035   3-184   1eyq A:  
jgi|Selmo1|136990|e_gw1.154.102.1   1.03e-25   0.0031   2-167   1eyq A:  
jgi|Selmo1|138015|e_gw1.179.52.1   0.0575   0.022   142-213   1eyq A:  
jgi|Selmo1|227414|fgenesh1_kg.C_scaffold_3000053   3.53e-34   0.00072   6-202   1eyq A:  
jgi|Selmo1|428339|fgenesh2_pg.C_scaffold_101000016   2.09e-23   0.0028   46-238   1eyq A:  
jgi|Selmo1|447240|estExt_fgenesh2_pg.C_870033   2.09e-30   0.00073   6-213   1eyq A:  
jgi|Selmo1|97953|e_gw1.20.172.1   1.7e-18   0.0035   3-120   1eyq A:  

Pinus taeda has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
PITA_000001781-RA   2.62e-37   0.0000306   9-152   1eyq A:  
 
Weak hits:
PITA_000008855-RA   0.000000000000314   0.0018   11-64   1eyq A:  
PITA_000010201-RA   2.09e-46   0.00013   5-213   1eyq A:  
PITA_000014976-RA   0.0000000222   0.0021   11-87   1eyq A:  
PITA_000015741-RA   1.7e-23   0.0013   66-226   1eyq A:  
PITA_000016700-RA   3.01e-18   0.002   62-180   1eyq A:  
PITA_000019110-RA   5.1e-29   0.00084   5-133   1eyq A:  
PITA_000019616-RA   0.000000000000432   0.001   13-107   1eyq A:  
  0.000000000106   0.00078   194-255   1eyq A:  
PITA_000019617-RA   0.0000000562   0.0049   11-76   1eyq A:  
PITA_000023160-RA   0.00000000000432   0.01   70-200   1eyq A:  
PITA_000041920-RA   2.22e-26   0.00016   2-89   1eyq A:  
PITA_000053350-RA   0.00000000209   0.0022   18-61   1eyq A:  
  0.000000366   0.0017   63-104   1eyq A:  
PITA_000056281-RA   0.000785   0.0052   87-124   1eyq A:  
PITA_000057589-RA   0.000000000706   0.0031   16-67   1eyq A:  
PITA_000074063-RA   0.00000000000000262   0.00088   132-224   1eyq A:  
PITA_000076113-RA   0.0000000051   0.0038   31-83   1eyq A:  
PITA_000076872-RA   0.0000000000000012   0.00087   6-132   1eyq A:  
PITA_000079473-RA   0.00000000126   0.0039   12-64   1eyq A:  
PITA_000087740-RA   0.0000034   0.0044   10-49   1eyq A:  

Picea abies has 3 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
MA_118809g0010   9.55e-67   0.00000225   2-204   1eyq A:  
  1.44e-65   0.00000337   220-423   1eyq A:  
MA_161192g0010   6.93e-60   0.00000267   45-255   1eyq A:  
 
Weak hits:
MA_10428490g0010   0.00536   0.019   38-145   1eyq A:  
MA_10437223g0020   1.96e-44   0.00024   23-199   1eyq A:  
MA_28336g0010   1.31e-31   0.00098   100-299   1eyq A:  
MA_398566g0010   0.00000000000000131   0.0052   3-99   1eyq A:  
MA_502949g0010   2.35e-45   0.00014   96-304   1eyq A:  

Eucalyptus grandis v201 has 3 significant domains in 3 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Eucgr.F03816.1|PACid:23585013   1.83e-82   0.000000559   9-218   1eyq A:  
Eucgr.J01152.1|PACid:23599094   3.27e-69   0.00000207   9-218   1eyq A:  
Eucgr.J01153.1|PACid:23599095   6.8e-56   0.00000649   9-168   1eyq A:  
 
Weak hits:
Eucgr.C00737.1|PACid:23570247   4.71e-43   0.0021   12-199   1eyq A:  
Eucgr.F01378.1|PACid:23582055   7.59e-56   0.00035   82-286   1eyq A:  
Eucgr.F01378.2|PACid:23582056   7.59e-56   0.00035   81-285   1eyq A:  
Eucgr.F01378.3|PACid:23582057   9.29e-46   0.00052   82-269   1eyq A:  
Eucgr.F01378.4|PACid:23582058   2.22e-41   0.0013   82-239   1eyq A:  
Eucgr.F04136.1|PACid:23585395   0.00942   0.013   70-124   1eyq A:  
Eucgr.G03138.1|PACid:23588948   3.53e-48   0.00033   4-208   1eyq A:  
Eucgr.G03138.2|PACid:23588949   3.53e-48   0.00033   4-208   1eyq A:  
Eucgr.G03138.3|PACid:23588950   7.98e-48   0.00033   2-204   1eyq A:  
Eucgr.G03138.4|PACid:23588951   4.71e-39   0.00042   4-154   1eyq A:  
Eucgr.G03138.5|PACid:23588952   5.23e-34   0.00073   4-147   1eyq A:  
Eucgr.I01736.1|PACid:23596414   0.0000000051   0.023   34-253   1eyq A:  
Eucgr.I01736.2|PACid:23596415   0.000000000000432   0.014   34-226   1eyq A:  
Eucgr.K03363.1|PACid:23605089   1.7e-29   0.0017   91-288   1eyq A:  

Theobroma cacao B97-61/B2 v1 has 3 significant domains in 3 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Tc00_g015860   1.96e-80   0.00000051   10-216   1eyq A:  
Tc00_g015870   1.57e-39   0.0000203   34-247   1eyq A:  
Tc10_g004370   3.66e-38   0.0000496   8-134   1eyq A:  
 
Weak hits:
Tc00_g015900   1.06e-21   0.00028   7-117   1eyq A:  
Tc01_g027750   3.14e-28   0.0015   93-286   1eyq A:  
Tc04_g001870   0.00000000034   0.013   40-229   1eyq A:  
Tc07_g011830   7.72e-48   0.00072   27-224   1eyq A:  
Tc08_g016040   0.017   0.016   72-129   1eyq A:  
Tc09_g005750   1.7e-46   0.0018   222-431   1eyq A:  
Tc09_g009730   0.0235   0.013   85-179   1eyq A:  
Tc10_g016290   1.83e-50   0.00019   2-203   1eyq A:  

Gossypium raimondii v221 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Gorai.013G023400.1|PACid:26788545   1.44e-83   0.000000574   41-251   1eyq A:  
 
Weak hits:
Gorai.001G019600.1|PACid:26822197   8.5e-22   0.0089   337-435   1eyq A:  
  0.000000000000222   0.0076   203-312   1eyq A:  
Gorai.001G019600.2|PACid:26822198   5.89e-42   0.0028   203-412   1eyq A:  
Gorai.001G019600.3|PACid:26822199   5.89e-42   0.0028   203-412   1eyq A:  
Gorai.001G019600.4|PACid:26822201   4.45e-27   0.0052   203-365   1eyq A:  
Gorai.001G019600.5|PACid:26822202   4.58e-27   0.0052   203-365   1eyq A:  
Gorai.001G019600.6|PACid:26822200   1.44e-30   0.0041   203-383   1eyq A:  
Gorai.001G266000.1|PACid:26821329   6.41e-18   0.009   29-214   1eyq A:  
Gorai.004G216200.1|PACid:26775165   6.8e-18   0.0035   98-245   1eyq A:  
Gorai.004G216200.2|PACid:26775166   3.27e-27   0.0014   98-295   1eyq A:  
Gorai.004G216800.1|PACid:26775145   0.0000000262   0.0095   6-110   1eyq A:  
Gorai.009G025000.1|PACid:26767007   0.0183   0.012   81-175   1eyq A:  
Gorai.009G025000.2|PACid:26767008   0.0157   0.012   81-175   1eyq A:  
Gorai.010G092800.1|PACid:26758157   2.35e-46   0.0018   220-430   1eyq A:  
Gorai.010G092800.2|PACid:26758160   7.19e-47   0.0018   75-285   1eyq A:  
Gorai.010G092800.3|PACid:26758158   2.35e-46   0.0018   220-430   1eyq A:  
Gorai.010G092800.4|PACid:26758159   1.96e-27   0.0048   220-375   1eyq A:  
Gorai.012G014600.1|PACid:26827842   1.07e-51   0.00019   4-207   1eyq A:  
Gorai.012G014600.2|PACid:26827844   1.57e-34   0.0026   4-167   1eyq A:  
Gorai.012G014600.3|PACid:26827843   3.01e-51   0.00019   2-203   1eyq A:  
Gorai.013G176000.1|PACid:26787073   4.18e-54   0.00054   74-278   1eyq A:  
Gorai.013G176000.2|PACid:26787074   4.05e-54   0.00054   73-277   1eyq A:  
Gorai.013G176000.3|PACid:26787075   5.36e-51   0.00055   74-277   1eyq A:  

Citrus clementina v165 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
clementine0.9_021165m|PACid:19283955   1.83e-82   0.000000517   6-215   1eyq A:  
 
Weak hits:
clementine0.9_011273m|PACid:19262746   6.41e-44   0.0022   208-417   1eyq A:  
clementine0.9_017952m|PACid:19263526   2.88e-26   0.0015   85-281   1eyq A:  
clementine0.9_018123m|PACid:19268455   1.57e-52   0.0008   75-279   1eyq A:  
clementine0.9_021841m|PACid:19283916   1.83e-50   0.00018   4-208   1eyq A:  
clementine0.9_022437m|PACid:19283918   4.58e-44   0.00029   12-196   1eyq A:  
clementine0.9_022453m|PACid:19283917   4.58e-44   0.00029   12-196   1eyq A:  
clementine0.9_024045m|PACid:19273003   0.0275   0.019   70-131   1eyq A:  
clementine0.9_028423m|PACid:19256030   1.57e-16   0.0059   97-291   1eyq A:  
clementine0.9_029820m|PACid:19271467   0.0523   0.014   73-115   1eyq A:  

Citrus sinensis v154 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
orange1.1g027531m|PACid:18095490   3.01e-82   0.000000531   6-215   1eyq A:  
 
Weak hits:
orange1.1g013971m|PACid:18114555   0.085   0.014   185-227   1eyq A:  
orange1.1g014720m|PACid:18126029   2.62e-44   0.0022   208-417   1eyq A:  
orange1.1g015529m|PACid:18114556   0.0772   0.014   185-227   1eyq A:  
orange1.1g016727m|PACid:18126030   4.05e-20   0.0061   208-333   1eyq A:  
orange1.1g017273m|PACid:18126032   3.53e-30   0.0041   208-370   1eyq A:  
orange1.1g017307m|PACid:18126031   3.53e-30   0.0041   208-370   1eyq A:  
orange1.1g018988m|PACid:18114557   0.0615   0.014   94-136   1eyq A:  
orange1.1g023433m|PACid:18093163   2.88e-26   0.0015   85-281   1eyq A:  
orange1.1g023649m|PACid:18103152   4.71e-52   0.00084   75-279   1eyq A:  
orange1.1g028614m|PACid:18093164   0.00000000000955   0.01   85-199   1eyq A:  
orange1.1g043688m|PACid:18113680   9.15e-17   0.0061   97-291   1eyq A:  

Thellungiella halophila v173 has 2 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Thhalv10004922m|PACid:20198690   3.53e-64   0.00000377   6-195   1eyq A:  
Thhalv10010658m|PACid:20207034   3.4e-79   0.00000144   12-223   1eyq A:  
 
Weak hits:
Thhalv10001976m|PACid:20200761   4.32e-30   0.0099   265-474   1eyq A:  
Thhalv10002023m|PACid:20200762   0.00000288   0.016   265-360   1eyq A:  
Thhalv10006140m|PACid:20190478   1.11e-28   0.0021   86-282   1eyq A:  
Thhalv10008956m|PACid:20186538   0.0353   0.021   70-124   1eyq A:  
Thhalv10011696m|PACid:20184323   2.48e-54   0.00072   91-292   1eyq A:  
Thhalv10014675m|PACid:20205543   1.14e-52   0.00022   3-208   1eyq A:  
Thhalv10014698m|PACid:20205544   3.53e-52   0.00022   2-204   1eyq A:  
Thhalv10017612m|PACid:20180351   0.0196   0.017   8-57   1eyq A:  
Thhalv10024970m|PACid:20196136   0.0109   0.029   47-159   1eyq A:  

Brassica rapa Chiifu-401 1.2 has 4 significant domains in 4 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Bra003209   5.75e-69   0.0000026   12-197   1eyq A:  
Bra007142   9.02e-81   0.00000102   13-222   1eyq A:  
Bra007145   7.98e-33   0.0000938   13-148   1eyq A:  
  6.67e-25   0.00038   164-251   1eyq A:  
Bra017728   7.45e-55   0.00000868   13-195   1eyq A:  
 
Weak hits:
Bra007732   1.1e-27   0.0024   76-273   1eyq A:  
Bra009101   3.4e-55   0.00012   2-204   1eyq A:  
Bra032697   0.0183   0.029   48-154   1eyq A:  
Bra034304   2.48e-47   0.0034   167-372   1eyq A:  
Bra036748   0.0114   0.019   70-124   1eyq A:  
Bra039362   6.41e-16   0.0016   9-61   1eyq A:  
Bra039678   5.49e-57   0.00069   80-283   1eyq A:  
Bra040435   4.84e-28   0.0029   86-282   1eyq A:  

Capsella rubella v183 has 2 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Carubv10019455m|PACid:20886020   1.83e-79   0.00000136   17-226   1eyq A:  
Carubv10027024m|PACid:20912822   3.92e-70   0.00000267   25-235   1eyq A:  
 
Weak hits:
Carubv10001966m|PACid:20910111   1.19e-55   0.00013   3-208   1eyq A:  
Carubv10009906m|PACid:20893069   3.92e-57   0.00067   87-290   1eyq A:  
Carubv10010501m|PACid:20889087   0.0471   0.019   70-124   1eyq A:  
Carubv10017808m|PACid:20888372   9.68e-26   0.0047   78-273   1eyq A:  
Carubv10023433m|PACid:20902478   1.96e-49   0.003   172-377   1eyq A:  

Arabidopsis lyrata has 2 significant domains in 2 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
jgi|Araly1|485933|fgenesh2_kg.5__1925__AT3G55120.1   3.92e-81   0.00000128   13-224   1eyq A:  
jgi|Araly1|887042|Al_scaffold_0008_3306   3.79e-61   0.0000089   6-207   1eyq A:  
 
Weak hits:
jgi|Araly1|473588|fgenesh2_kg.1__3542__AT1G34350.1   0.00693   0.017   70-125   1eyq A:  
jgi|Araly1|474480|fgenesh2_kg.1__4434__AT1G53520.1   6.93e-58   0.00061   84-287   1eyq A:  
jgi|Araly1|481490|fgenesh2_kg.4__550__AT2G26310.1   1.03e-50   0.0028   179-384   1eyq A:  
jgi|Araly1|486819|fgenesh2_kg.5__2811__AT3G63170.1   1.24e-26   0.0048   79-271   1eyq A:  
jgi|Araly1|487319|fgenesh2_kg.6__453__AT5G05270.1   1.16e-55   0.00018   3-208   1eyq A:  
jgi|Araly1|875929|Al_scaffold_0002_523   0.0000114   0.0067   19-55   1eyq A:  

Arabidopsis thaliana 10 has 3 significant domains in 3 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
AT3G55120.1   3.53e-79   0.00000134   16-224   1eyq A:  
AT5G66220.1   2.09e-53   0.000015   2-159   1eyq A:  
AT5G66230.2   2.62e-68   0.0000034   6-208   1eyq A:  
 
Weak hits:
AT1G34350.1   0.0209   0.013   70-133   1eyq A:  
AT1G53520.1   7.59e-57   0.00073   83-286   1eyq A:  
AT2G26310.1   1.57e-50   0.0028   191-396   1eyq A:  
AT2G26310.2   2.48e-40   0.0063   191-371   1eyq A:  
AT2G26310.3   5.23e-51   0.0028   63-268   1eyq A:  
AT3G63170.1   2.22e-27   0.0037   79-271   1eyq A:  
AT5G05270.1   6.93e-56   0.00018   3-208   1eyq A:  
AT5G05270.2   6.93e-56   0.00018   3-208   1eyq A:  

Carica papaya has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
evm.TU.supercontig_1855.1   1.1e-63   0.00000213   9-165   1eyq A:  
 
Weak hits:
evm.TU.contig_26638.2   1.57e-16   0.0067   69-276   1eyq A:  
evm.TU.supercontig_126.7   8.89e-48   0.0015   180-389   1eyq A:  
evm.TU.supercontig_19.63   8.5e-51   0.00013   2-206   1eyq A:  
evm.TU.supercontig_23.84   0.00523   0.01   82-175   1eyq A:  
evm.TU.supercontig_52.38   6.41e-28   0.0021   85-275   1eyq A:  
evm.TU.supercontig_77.75   3.4e-34   0.0023   3-142   1eyq A:  

Medicago truncatula has 9 significant domains in 9 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Medtr1g115820.1   1.96e-79   0.00000000253   5-214   1eyq A:  
Medtr1g115820.2   4.58e-59   0.000000039   5-165   1eyq A:  
Medtr1g115830.1   1.83e-25   0.0000264   41-152   1eyq A:  
Medtr1g115840.1   2.09e-75   0.00000015   10-217   1eyq A:  
Medtr1g115850.1   1.24e-71   0.000000218   11-217   1eyq A:  
Medtr1g115850.2   4.45e-68   0.000000241   11-224   1eyq A:  
Medtr1g115870.1   2.09e-82   0.00000055   6-217   1eyq A:  
Medtr1g115890.1   3.14e-80   0.000000637   6-217   1eyq A:  
Medtr7g027135.1   1.16e-41   0.0000241   15-139   1eyq A:  
 
Weak hits:
Medtr1g015700.1   1.12e-40   0.0016   191-401   1eyq A:  
Medtr1g015700.2   5.49e-17   0.0032   191-301   1eyq A:  
Medtr1g083990.1   0.0119   0.013   368-418   1eyq A:  
Medtr2g072510.1   3.66e-56   0.00046   74-276   1eyq A:  
Medtr3g078663.1   0.0183   0.013   74-124   1eyq A:  
Medtr3g093980.1   4.71e-53   0.00015   25-228   1eyq A:  
Medtr3g093980.2   4.84e-45   0.00029   1-176   1eyq A:  
Medtr3g093980.3   4.97e-43   0.00023   5-152   1eyq A:  
Medtr5g035770.1   0.0379   0.011   143-217   1eyq A:  
Medtr5g035770.2   0.034   0.011   111-185   1eyq A:  
Medtr5g035770.3   0.0314   0.011   104-178   1eyq A:  
Medtr5g035770.4   0.034   0.011   111-185   1eyq A:  
Medtr7g094980.1   9.81e-28   0.0017   88-280   1eyq A:  

Phaseolus vulgaris v186 has 4 significant domains in 4 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Phvulv091003077m|PACid:23538838   3.27e-84   0.000000769   47-256   1eyq A:  
Phvulv091005737m|PACid:23545849   9.94e-77   0.000000015   8-216   1eyq A:  
Phvulv091005738m|PACid:23545643   2.88e-84   0.000000942   5-215   1eyq A:  
Phvulv091023708m|PACid:23550010   4.32e-76   0.000000105   8-217   1eyq A:  
 
Weak hits:
Phvulv091002964m|PACid:23539329   0.00131   0.012   71-129   1eyq A:  
Phvulv091004776m|PACid:23535103   2.88e-54   0.00082   5-209   1eyq A:  
Phvulv091010751m|PACid:23548808   3.92e-45   0.00093   204-411   1eyq A:  
Phvulv091014031m|PACid:23533451   5.89e-28   0.0011   82-275   1eyq A:  
Phvulv091026497m|PACid:23556903   1.1e-51   0.00021   4-208   1eyq A:  

Glycine max v109 has 5 significant domains in 5 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Glyma10g43850.1|PACid:16282035   3.79e-78   0.000000104   7-216   1eyq A:  
Glyma20g38560.1|PACid:16318301   5.36e-77   0.000000016   5-213   1eyq A:  
Glyma20g38560.2|PACid:16318302   2.75e-56   0.00000019   5-162   1eyq A:  
Glyma20g38570.1|PACid:16318303   4.97e-79   0.000000112   7-216   1eyq A:  
Glyma20g38580.1|PACid:16318304   6.54e-83   0.00000109   8-217   1eyq A:  
 
Weak hits:
Glyma02g08220.1|PACid:16247382   0.000667   0.012   71-129   1eyq A:  
Glyma03g31100.1|PACid:16252914   0.00000000575   0.0093   71-146   1eyq A:  
  0.00000235   0.01   220-289   1eyq A:  
Glyma04g40030.1|PACid:16257349   6.93e-53   0.00018   4-208   1eyq A:  
Glyma06g14820.1|PACid:16262977   4.32e-54   0.00019   4-208   1eyq A:  
Glyma06g14820.2|PACid:16262978   4.45e-39   0.00077   4-185   1eyq A:  
Glyma06g14820.3|PACid:16262979   4.97e-45   0.00036   1-176   1eyq A:  
Glyma06g14820.4|PACid:16262980   1.83e-27   0.0028   10-139   1eyq A:  
Glyma09g29650.1|PACid:16276635   0.00103   0.012   71-129   1eyq A:  
Glyma09g29650.2|PACid:16276636   0.00103   0.012   71-129   1eyq A:  
Glyma09g29650.3|PACid:16276637   0.00103   0.012   71-129   1eyq A:  
Glyma13g33730.1|PACid:16292514   2.09e-58   0.00063   77-281   1eyq A:  
Glyma14g11150.1|PACid:16295142   1.19e-37   0.0018   5-174   1eyq A:  
Glyma15g39050.1|PACid:16300479   1.31e-57   0.0007   77-281   1eyq A:  
Glyma16g27300.1|PACid:16303068   0.00458   0.013   71-129   1eyq A:  
Glyma16g34230.1|PACid:16303826   0.0107   0.013   47-98   1eyq A:  
Glyma17g34430.1|PACid:16307024   4.84e-32   0.0023   46-201   1eyq A:  
Glyma19g33940.1|PACid:16313677   6.54e-28   0.0014   80-272   1eyq A:  

Cucumis sativus v122 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Cucsa.182640.1|PACid:16967497   6.93e-70   0.00000128   7-216   1eyq A:  
 
Weak hits:
Cucsa.058090.1|PACid:16954621   1.22e-53   0.0006   74-278   1eyq A:  
Cucsa.084470.1|PACid:16956537   6.93e-26   0.0015   90-284   1eyq A:  
Cucsa.084470.2|PACid:16956538   3.14e-16   0.0043   90-230   1eyq A:  
Cucsa.143940.1|PACid:16963850   3.4e-47   0.00018   38-241   1eyq A:  
Cucsa.271100.1|PACid:16973477   1.44e-44   0.0016   218-427   1eyq A:  
Cucsa.271100.5|PACid:16973481   1.31e-44   0.0016   217-426   1eyq A:  

Fragaria vesca has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
gene23367   2.35e-85   0.000000574   5-214   1eyq A:  
 
Weak hits:
gene15488   8.24e-43   0.0013   265-443   1eyq A:  
gene21346   2.62e-50   0.00011   43-245   1eyq A:  
gene27138   2.48e-46   0.00069   4-178   1eyq A:  
gene27804   1.7e-25   0.0019   97-291   1eyq A:  

Malus domestica v196 has 23 significant domains in 16 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
MDP0000198407|PACid:22673261   1.06e-82   0.000000442   9-216   1eyq A:  
  1.83e-82   0.000000453   243-449   1eyq A:  
MDP0000205890|PACid:22621272   4.58e-85   0.000000497   10-216   1eyq A:  
MDP0000237083|PACid:22650491   1.02e-78   0.000000505   153-375   1eyq A:  
  4.97e-49   0.0000124   16-147   1eyq A:  
  2.75e-20   0.00023   403-500   1eyq A:  
MDP0000274127|PACid:22675477   2.48e-83   0.000000503   258-464   1eyq A:  
  9.02e-78   0.000000492   9-231   1eyq A:  
MDP0000277280|PACid:22634601   1.7e-36   0.0000613   100-230   1eyq A:  
MDP0000308606|PACid:22636355   1.44e-47   0.0000189   10-168   1eyq A:  
  6.93e-32   0.0000865   195-282   1eyq A:  
MDP0000309104|PACid:22621686   2.35e-46   0.0000174   173-301   1eyq A:  
  0.00000114   0.0035   67-101   1eyq A:  
MDP0000381552|PACid:22674828   2.48e-46   0.0000192   135-263   1eyq A:  
  8.63e-32   0.00011   10-94   1eyq A:  
MDP0000425661|PACid:22632157   1.57e-46   0.0000163   6-135   1eyq A:  
MDP0000523477|PACid:22636354   5.75e-83   0.00000043   184-390   1eyq A:  
  6.41e-46   0.0000159   9-157   1eyq A:  
MDP0000523487|PACid:22648243   4.05e-36   0.0000499   1-109   1eyq A:  
MDP0000656707|PACid:22675476   5.23e-37   0.0000522   16-112   1eyq A:  
MDP0000682951|PACid:22640428   1.31e-33   0.0001   10-95   1eyq A:  
MDP0000682953|PACid:22640427   4.18e-83   0.000000559   10-216   1eyq A:  
  6.93e-83   0.000000448   243-449   1eyq A:  
MDP0000684169|PACid:22677340   7.32e-84   0.000000545   10-216   1eyq A:  
  9.42e-32   0.0000865   243-330   1eyq A:  
MDP0000759336|PACid:22634603   3.27e-85   0.000000605   10-216   1eyq A:  
 
Weak hits:
MDP0000129431|PACid:22646530   3.01e-44   0.00086   4-178   1eyq A:  
MDP0000134791|PACid:22657159   1.83e-50   0.00015   40-244   1eyq A:  
MDP0000138284|PACid:22655105   4.18e-20   0.0055   92-303   1eyq A:  
MDP0000144324|PACid:22632570   3.01e-38   0.0017   199-428   1eyq A:  
MDP0000181362|PACid:22646373   6.15e-23   0.00037   10-70   1eyq A:  
MDP0000183974|PACid:22650855   0.00000693   0.0051   2-114   1eyq A:  
MDP0000196869|PACid:22654919   4.45e-16   0.00076   1-53   1eyq A:  
MDP0000202312|PACid:22679111   1.15e-30   0.00011   107-186   1eyq A:  
  2.35e-19   0.00031   16-71   1eyq A:  
MDP0000215073|PACid:22682437   1.57e-32   0.00011   10-94   1eyq A:  
MDP0000233012|PACid:22650119   1.44e-50   0.00093   126-328   1eyq A:  
MDP0000244612|PACid:22671542   8.11e-20   0.005   92-303   1eyq A:  
MDP0000252589|PACid:22678182   1.44e-52   0.00013   38-242   1eyq A:  
MDP0000259468|PACid:22652981   0.0262   0.0099   70-123   1eyq A:  
MDP0000276241|PACid:22680109   0.00000000000628   0.013   245-337   1eyq A:  

Prunus persica v139 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
ppa011276m|PACid:17644259   1.57e-84   0.000000531   10-216   1eyq A:  
 
Weak hits:
ppa006153m|PACid:17656361   1.29e-45   0.0015   214-423   1eyq A:  
ppa009406m|PACid:17656695   1.27e-28   0.0014   99-293   1eyq A:  
ppa011189m|PACid:17668204   4.58e-54   0.00063   17-219   1eyq A:  
ppa011476m|PACid:17641245   1.83e-52   0.00013   4-208   1eyq A:  
ppa012580m|PACid:17650687   0.0183   0.011   70-124   1eyq A:  
ppa024681m|PACid:17669223   3.01e-19   0.0038   12-203   1eyq A:  

Linum usitatissimum v200 has 3 significant domains in 3 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
Lus10003311|PACid:23169869   5.75e-80   0.00000051   5-215   1eyq A:  
Lus10030309|PACid:23152963   9.68e-42   0.0000301   1-118   1eyq A:  
Lus10030310|PACid:23153091   2.75e-81   0.000000497   6-215   1eyq A:  
 
Weak hits:
Lus10012878|PACid:23162993   1.83e-45   0.00029   13-213   1eyq A:  
Lus10014620|PACid:23170968   0.00000000011   0.015   20-190   1eyq A:  
Lus10022045|PACid:23160244   5.75e-23   0.0028   92-285   1eyq A:  
Lus10022046|PACid:23160266   1.83e-23   0.0022   96-287   1eyq A:  
Lus10026174|PACid:23156576   9.15e-49   0.00057   81-285   1eyq A:  
Lus10030529|PACid:23140597   1.44e-42   0.00033   4-182   1eyq A:  
Lus10032083|PACid:23161174   0.00000000000000131   0.015   69-256   1eyq A:  
Lus10033680|PACid:23143316   0.0628   0.023   59-125   1eyq A:  
Lus10042591|PACid:23181874   1.7e-22   0.0029   94-286   1eyq A:  
Lus10042592|PACid:23181771   2.88e-23   0.0025   102-293   1eyq A:  

Manihot esculenta v147 has 2 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
cassava4.1_007396m|PACid:17973775   6.15e-82   0.000000517   245-453   1eyq A:  
  1.19e-80   0.00000051   8-217   1eyq A:  
 
Weak hits:
cassava4.1_008398m|PACid:17990796   0.068   0.016   177-230   1eyq A:  
cassava4.1_009486m|PACid:17970351   9.68e-31   0.0018   220-382   1eyq A:  
cassava4.1_013117m|PACid:17986350   1.96e-27   0.0012   90-289   1eyq A:  
cassava4.1_016211m|PACid:17960168   9.94e-51   0.00013   4-208   1eyq A:  
cassava4.1_028811m|PACid:17971166   1.31e-16   0.0054   76-268   1eyq A:  
cassava4.1_031966m|PACid:17973451   8.24e-56   0.00065   54-258   1eyq A:  

Populus trichocarpa v156 has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
POPTR_0010s21980.1|PACid:18241579   2.09e-86   0.00000049   8-216   1eyq A:  
 
Weak hits:
POPTR_0001s38970.1|PACid:18238281   4.32e-39   0.0018   5-179   1eyq A:  
POPTR_0002s05310.1|PACid:18244645   6.15e-28   0.00093   95-292   1eyq A:  
POPTR_0006s23620.1|PACid:18211853   6.28e-44   0.0021   220-428   1eyq A:  
POPTR_0011s10330.1|PACid:18231156   1.83e-53   0.00056   78-282   1eyq A:  
POPTR_0013s11920.1|PACid:18221091   0.0484   0.016   70-122   1eyq A:  
POPTR_0018s08450.1|PACid:18215141   4.18e-45   0.0013   220-429   1eyq A:  
POPTR_0019s08610.1|PACid:18218973   1.31e-50   0.00022   4-208   1eyq A:  
POPTR_0019s08610.2|PACid:18218974   3.53e-42   0.00029   4-153   1eyq A:  

Vitis vinifera has 1 significant domains in 1 proteins.

     

Sequence ID   Superfamily evalue   Family evalue   Region   Closest structure  
GSVIVT01032619001   4.32e-86   0.000000574   6-216   1eyq A:  
 
Weak hits:
GSVIVT01001154001   1.02e-24   0.0021   137-331   1eyq A:  
GSVIVT01014069001   5.75e-53   0.00075   80-283   1eyq A:  
GSVIVT01023270001   0.0392   0.017   73-134   1eyq A:  
GSVIVT01032392001   4.97e-19   0.0065   67-259   1eyq A:  
GSVIVT01032685001   9.42e-52   0.00013   12-217   1eyq A:  
GSVIVT01035482001   3.27e-46   0.0018   211-420   1eyq A:  

  1 2 3   Next Last
Showing genomes 1 to 25 of 65

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from individual genomes ]


Add assignments from groups of genomes

View all assignments containing a Chalcone isomerase domain in each group of genomes.

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes ]


Add assignments from individual genomes

Select additional genomes you would like to see domain assignments for, then click 'Submit'.

Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   1320 1320
No Yes Selaginella moellendorffii   2 2
No Yes Pinus taeda Loblolly pine 1 1
No Yes Picea abies Norway spruce 3 2
No Yes Eucalyptus grandis v201 Rose gum 3 3
No Yes Theobroma cacao B97-61/B2 v1 Cacao 3 3
No Yes Gossypium raimondii v221   1 1
No Yes Citrus clementina v165   1 1
No Yes Citrus sinensis v154 Sweet orange 1 1
No Yes Thellungiella halophila v173   2 2
No Yes Brassica rapa Chiifu-401 1.2 Field mustard 4 4
No Yes Capsella rubella v183   2 2
No Yes Arabidopsis lyrata Lyrate rockcress 2 2
No Yes Arabidopsis thaliana 10 Thale cress 3 3
No Yes Carica papaya Papaya 1 1
No Yes Medicago truncatula Barrel medic 9 9
No Yes Phaseolus vulgaris v186 French bean 4 4
No Yes Glycine max v109 Soybean 5 5
No Yes Cucumis sativus v122 Cucumber 1 1
No Yes Fragaria vesca Wild strawberry 1 1
No Yes Malus domestica v196 Apple 23 16
No Yes Prunus persica v139 Peach 1 1
No Yes Linum usitatissimum v200 Flax 3 3
No Yes Manihot esculenta v147 Cassava 2 1
No Yes Populus trichocarpa v156 Black cottonwood 1 1
No Yes Vitis vinifera Wine grape 1 1
No Yes Solanum lycopersicum v.2.3 Tomato 2 2
No Yes Actinidia chinensis Hongyang   3 3
No Yes Aquilegia coerulea v195   3 3
No Yes Triticum aestivum 22 Bread wheat 1 1
No Yes Brachypodium distachyon Stiff brome 2 2
No Yes Oryza barthii 22 African wild rice 6 6
No Yes Oryza meridionalis 22   2 2
No Yes Oryza glumaepatula 22   4 4
No Yes Oryza glaberrima African rice 2 2
No Yes Oryza punctata 22   3 3
No Yes Oryza nivara 22   6 6
No Yes Oryza brachyantha 22 Malo sina 1 1
No Yes Oryza sativa ssp. japonica 5.0 Japanese rice 6 6
No Yes Oryza sativa v193 Rice 4 4
No Yes Phyllostachys heterocyclavar. pubescens Kikko-chiku 2 2
No Yes Panicum virgatum v202 Switchgrass 6 6
No Yes Setaria italica v164 Foxtail millet 3 3
No Yes Zea mays subsp. mays Maize 3 3
No Yes Zea mays v181 Maize 5 5
No Yes Sorghum bicolor Sorghum 1 1
No Yes Musa balbisiana Balbis banana 1 1
No Yes Musa acuminata 22 Wild Malaysian banana 1 1
No Yes Amborella trichopoda 22   3 3
No Yes Physcomitrella patens   2 2
No Yes Theobroma cacao Matina 1-6 v0.9 Cacao 2 2
No Yes Hordeum vulgare 22 Domesticated barley 3 3
No Yes Oryza sativa ssp. Indica (Subspecies) Long-grained rice 3 3
No Yes Lotus japonicus (Early assembly)   4 4
No Yes Malus x domestica (Duplicate) Apple 23 16
No Yes Ricinus communis (Early assembly) Castor bean 1 1
No Yes Nicotiana benthamiana 0.4.4 (Early draft)   2 2
No Yes Solanum pimpinellifolium A-1.0 (Early draft) Currant tomato 2 2
No Yes Solanum lycopersicum v2.3 (Early assembly) Tomato 2 2
No Yes Arabidopsis thaliana 10 Thale cress 3 3
No Yes NCBI 2017_08 genome   209 195
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   17 17
No Yes Uniprot 2018_03 genome   724 714
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   3 3
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   20 20
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   60 60

Jump to [ Top of page · Assignment details · Add assignments from groups of genomes · Add assignments from individual genomes ]