SUPERFAMILY 1.75 HMM library and genome assignments server

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SRF-like superfamily domain assignments
in
Uniprot 2018_03 genome

Assignment details

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Showing sequences 1 to 3000 of 20190
  1 2 3 4 5 6 7   Next Last

Uniprot 2018_03 genome has 20244 significant domains in 20190 proteins.

     

Sequence ID   Evalue   Region   Family  
A0A010Q9K9   2.62e-23   54-136   SRF-like  
A0A010R8U8   5.89e-29   2-81   SRF-like  
A0A014N445   4.06e-23   56-137   SRF-like  
A0A014N6L5   0.0000000131   54-101   SRF-like  
A0A014PI94   0.00000157   12-62   SRF-like  
A0A014QRL3   0.00000249   11-62   SRF-like  
A0A015I5M7   2.75e-30   2-86   SRF-like  
A0A015J6X2   6.28e-23   60-143   SRF-like  
A0A015LDD1   6.67e-23   63-146   SRF-like  
A0A015MES3   6.28e-23   60-143   SRF-like  
A0A016S3F3   0.00000196   5-52   SRF-like  
A0A016S3Z0   0.00000222   5-52   SRF-like  
A0A016S4B0   0.00000209   5-52   SRF-like  
A0A016S4L6   0.00000000654   43-73   SRF-like  
A0A016U7B6   6.93e-26   31-85   SRF-like  
A0A016U7J8   5.76e-26   26-80   SRF-like  
A0A017S896   1.7e-23   52-135   SRF-like  
A0A017SQL3   1.09e-28   2-79   SRF-like  
A0A022PSB5   7.98e-34   2-92   SRF-like  
A0A022PT45   2.22e-29   2-60   SRF-like  
A0A022PUG2   9.68e-29   3-74   SRF-like  
A0A022PUQ0   4.84e-32   3-77   SRF-like  
A0A022PV32   4.71e-23   2-94   SRF-like  
A0A022PXD6   4.45e-21   8-79   SRF-like  
A0A022PXS4   2.88e-26   75-149   SRF-like  
A0A022Q0G9   1.31e-23   7-79   SRF-like  
A0A022Q211   4.84e-18   2-97   SRF-like  
A0A022Q213   1.7e-36   2-96   SRF-like  
A0A022Q2B6   4.71e-33   2-75   SRF-like  
A0A022Q336   1.31e-23   7-79   SRF-like  
A0A022Q3C1   2.09e-29   3-65   SRF-like  
A0A022Q436   4.32e-27   1-74   SRF-like  
A0A022Q439   4.97e-33   2-75   SRF-like  
A0A022Q4W9   1.83e-16   2-80   SRF-like  
A0A022Q561   5.23e-33   2-75   SRF-like  
A0A022Q636   1.7e-36   2-96   SRF-like  
A0A022Q6A1   4.19e-33   2-75   SRF-like  
A0A022Q6P0   3.27e-34   2-86   SRF-like  
A0A022Q6V4   3.79e-21   1-70   SRF-like  
A0A022Q6V9   5.1e-25   2-92   SRF-like  
A0A022Q828   4.32e-24   3-81   SRF-like  
A0A022Q9U6   4.19e-22   3-80   SRF-like  
A0A022QAR9   1.02e-31   3-82   SRF-like  
A0A022QB92   6.8e-26   16-86   SRF-like  
A0A022QBJ0   8.63e-20   6-72   SRF-like  
A0A022QCZ8   1.83e-31   2-78   SRF-like  
A0A022QGX2   1.14e-16   1-80   SRF-like  
A0A022QHG1   6.67e-33   18-92   SRF-like  
A0A022QID2   1.83e-25   1-64   SRF-like  
A0A022QJL0   6.67e-33   18-92   SRF-like  
A0A022QKF0   3.79e-18   1-74   SRF-like  
A0A022QKT1   5.23e-25   1-74   SRF-like  
A0A022QKY3   0.000000000000706   2-94   SRF-like  
A0A022QPZ9   5.65e-18   5-101   SRF-like  
A0A022QT10   1.31e-27   2-88   SRF-like  
A0A022QUI5   5.49e-31   3-76   SRF-like  
A0A022QWM1   4.45e-16   3-94   SRF-like  
A0A022QWR8   1.57e-34   2-90   SRF-like  
A0A022QWZ7   1.57e-24   3-86   SRF-like  
A0A022QX80   2.49e-18   1-73   SRF-like  
A0A022QXX6   6.28e-28   2-75   SRF-like  
A0A022QXX8   1.7e-34   2-76   SRF-like  
A0A022QY53   8.89e-29   2-61   SRF-like  
A0A022QZQ2   5.49e-34   3-83   SRF-like  
A0A022QZQ3   6.02e-27   1-63   SRF-like  
A0A022QZQ8   9.68e-18   12-69   SRF-like  
A0A022R0M2   2.62e-27   2-76   SRF-like  
A0A022R0M9   4.19e-28   2-77   SRF-like  
A0A022R0V1   5.1e-24   14-86   SRF-like  
A0A022R0Z2   5.36e-17   1-74   SRF-like  
A0A022R1J4   6.54e-26   2-70   SRF-like  
A0A022R1L0   8.24e-35   2-75   SRF-like  
A0A022R232   5.62e-28   1-60   SRF-like  
A0A022R2T5   2.09e-16   24-79   SRF-like  
A0A022R3T5   2.75e-28   2-76   SRF-like  
A0A022R3T8   1.44e-28   2-77   SRF-like  
A0A022R5G8   1.28e-24   40-133   SRF-like  
A0A022R6G6   1.06e-24   2-95   SRF-like  
A0A022R851   6.15e-34   2-81   SRF-like  
A0A022RAW7   9.03e-28   2-77   SRF-like  
A0A022RB35   8.63e-26   15-95   SRF-like  
A0A022RBA8   1.44e-27   7-78   SRF-like  
A0A022RBI0   4.71e-28   2-74   SRF-like  
A0A022RBL4   4.19e-26   2-61   SRF-like  
A0A022RBY5   1.83e-23   19-89   SRF-like  
A0A022RDN8   4.19e-24   14-86   SRF-like  
A0A022REW6   5.76e-19   2-99   SRF-like  
A0A022RF71   4.45e-27   47-120   SRF-like  
A0A022RF76   4.84e-30   2-75   SRF-like  
A0A022RFE6   6.15e-32   2-89   SRF-like  
A0A022RFX2   4.19e-24   17-86   SRF-like  
A0A022RIX0   3.92e-27   16-86   SRF-like  
A0A022RJB0   1.06e-24   2-96   SRF-like  
A0A022RJG5   1.11e-29   3-61   SRF-like  
A0A022RJK6   6.02e-27   1-71   SRF-like  
A0A022RJL0   1.14e-26   1-71   SRF-like  
A0A022RK64   2.88e-27   1-71   SRF-like  
A0A022RKW5   3.53e-27   17-87   SRF-like  
A0A022RL00   6.54e-17   1-54   SRF-like  
A0A022RM40   1.29e-18   1-73   SRF-like  
A0A022RN39   6.54e-27   1-71   SRF-like  
A0A022RN47   3.92e-25   1-71   SRF-like  
A0A022RNQ2   1.83e-34   2-91   SRF-like  
A0A022RQR6   1.57e-16   3-101   SRF-like  
A0A022RR17   1.09e-27   7-79   SRF-like  
A0A022RS11   4.32e-30   23-81   SRF-like  
A0A022RSF8   4.71e-33   2-77   SRF-like  
A0A022RSS8   2.88e-32   2-74   SRF-like  
A0A022RTQ0   1.07e-26   2-60   SRF-like  
A0A022RTW6   0.0000000000000353   2-93   SRF-like  
A0A022RU25   1.7e-17   2-81   SRF-like  
A0A022RW05   0.00000000549   1-26   SRF-like  
A0A022RW95   1.44e-31   2-78   SRF-like  
A0A022RWG1   4.84e-21   8-79   SRF-like  
A0A022RXZ0   3.27e-32   2-93   SRF-like  
A0A022S1J2   1.29e-23   7-79   SRF-like  
A0A022VRZ7   1.44e-23   54-138   SRF-like  
A0A022W0E4   1.96e-28   2-82   SRF-like  
A0A022XIA0   1.44e-23   54-138   SRF-like  
A0A022XRP4   1.96e-28   2-82   SRF-like  
A0A023FAL5   3.53e-30   2-89   SRF-like  
A0A023GVC4   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVC5   7.46e-39   2-95   SRF-like  
A0A023GVC6   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVC7   4.32e-38   2-93   SRF-like  
A0A023GVC8   2.62e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVC9   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVD0   2.62e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVD1   5.36e-39   2-95   SRF-like  
A0A023GVD2   2.49e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVD3   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVD4   1.03e-37   2-94   SRF-like  
A0A023GVD5   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVD6   4.32e-38   2-93   SRF-like  
A0A023GVD7   3.27e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVD8   1.31e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVD9   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVE1   3.27e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVE2   2.49e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVE3   4.32e-38   2-93   SRF-like  
A0A023GVE4   3.27e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVE5   2.62e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVE6   2.62e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVE7   9.55e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVE8   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVE9   5.36e-39   2-95   SRF-like  
A0A023GVF0   2.62e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVF1   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVF2   4.32e-38   2-93   SRF-like  
A0A023GVF3   7.46e-39   2-95   SRF-like  
A0A023GVF4   5.36e-39   2-95   SRF-like  
A0A023GVF5   5.23e-39   2-95   SRF-like  
A0A023GVF6   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVF7   1.96e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVF8   2.62e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVF9   8.76e-39   2-95   SRF-like  
A0A023GVG0   8.5e-39   2-95   SRF-like  
A0A023GVG1   2.49e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVG2   2.62e-38   2-94   SRF-like  
A0A023GVG3   1.57e-38   2-95   SRF-like  
A0A023GVG4   1.96e-38   2-95   SRF-like  
A0A023INE7   1.96e-22   1-65   SRF-like  
A0A023JAX7   2.09e-20   1-71   SRF-like  
A0A023JAY1   1.23e-33   1-73   SRF-like  
A0A023JAY6   6.02e-34   2-79   SRF-like  
A0A023JAZ0   6.93e-19   2-58   SRF-like  
A0A023JAZ6   6.54e-31   1-69   SRF-like  
A0A023JAZ9   1.11e-18   2-56   SRF-like  
A0A023JB02   9.16e-20   1-67   SRF-like  
A0A023JB06   1.2e-23   1-73   SRF-like  
A0A023JB11   0.000000000000889   1-60   SRF-like  
A0A023JB15   5.36e-19   1-53   SRF-like  
A0A023JB19   2.88e-22   1-56   SRF-like  
A0A023JB24   4.58e-22   1-58   SRF-like  
A0A023JB30   1.7e-25   1-73   SRF-like  
A0A023JB36   1.7e-25   1-74   SRF-like  
A0A023JB40   1.44e-28   1-78   SRF-like  
A0A023JB45   1.7e-16   1-48   SRF-like  
A0A023JB52   0.00000000000000118   1-54   SRF-like  
A0A023JB56   3.66e-18   1-50   SRF-like  
A0A023JBD4   4.19e-28   1-77   SRF-like  
A0A023JBD8   1.26e-31   3-77   SRF-like  
A0A023JBE2   2.09e-24   3-70   SRF-like  
A0A023JBE8   5.89e-34   1-78   SRF-like  
A0A023JBF2   1.57e-27   2-68   SRF-like  
A0A023JBF8   6.41e-19   2-56   SRF-like  
A0A023JBG3   9.68e-19   1-67   SRF-like  
A0A023JBH3   4.84e-23   1-60   SRF-like  
A0A023JBH8   5.36e-19   1-53   SRF-like  
A0A023JBI2   1.57e-18   1-49   SRF-like  
A0A023JBI6   7.06e-23   1-69   SRF-like  
A0A023JBJ0   9.68e-21   2-53   SRF-like  
A0A023JBJ4   8.76e-17   1-46   SRF-like  
A0A023JBJ5   9.68e-22   1-72   SRF-like  
A0A023JBJ9   7.72e-26   1-70   SRF-like  
A0A023JBK3   4.32e-24   1-66   SRF-like  
A0A023JBK8   1.57e-17   1-60   SRF-like  
A0A023JBL1   9.81e-17   1-46   SRF-like  
A0A023JBL5   8.76e-23   1-70   SRF-like  
A0A023JBM4   3.53e-23   1-74   SRF-like  
A0A023JBN0   0.00000000000131   1-60   SRF-like  
A0A023JBN5   1.7e-18   1-58   SRF-like  
A0A023JBP0   2.09e-22   1-55   SRF-like  
A0A023JBP4   8.24e-19   1-52   SRF-like  
A0A023JBQ0   1.7e-25   1-73   SRF-like  
A0A023JBQ6   1.44e-25   1-74   SRF-like  
A0A023JBR1   4.84e-18   1-49   SRF-like  
A0A023JBR6   2.09e-16   1-46   SRF-like  
A0A023JBS0   0.000000000000562   1-40   SRF-like  
A0A023JBS6   5.62e-18   1-48   SRF-like  
A0A023JBV1   1.02e-22   1-57   SRF-like  
A0A023JBV6   1.24e-37   2-95   SRF-like  
A0A023JBW0   3.01e-30   3-86   SRF-like  
A0A023JBW3   2.35e-35   1-95   SRF-like  
A0A023JBW7   1.01e-20   2-53   SRF-like  
A0A023JBX3   6.8e-38   2-95   SRF-like  
A0A023JBX7   4.19e-24   1-71   SRF-like  
A0A023JBY7   1.7e-25   1-73   SRF-like  
A0A023JBZ2   4.71e-22   1-60   SRF-like  
A0A023JBZ3   2.35e-35   2-96   SRF-like  
A0A023JBZ5   2.62e-19   1-62   SRF-like  
A0A023JBZ6   4.84e-31   3-76   SRF-like  
A0A023JBZ7   8.24e-19   1-52   SRF-like  
A0A023JBZ9   5.89e-25   2-72   SRF-like  
A0A023JC00   1.1e-16   1-45   SRF-like  
A0A023JC02   1.96e-34   1-79   SRF-like  
A0A023JC04   9.81e-25   1-73   SRF-like  
A0A023JC06   7.98e-28   2-68   SRF-like  
A0A023JC07   7.72e-26   1-64   SRF-like  
A0A023JC09   0.00000000863   1-49   SRF-like  
A0A023JC11   5.23e-17   1-67   SRF-like  
A0A023JC13   7.59e-19   1-67   SRF-like  
A0A023JC15   0.00000000000955   1-40   SRF-like  
A0A023JC17   1.96e-21   2-57   SRF-like  
A0A023JC19   4.58e-23   1-73   SRF-like  
A0A023JC23   1.27e-24   1-64   SRF-like  
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A0A0E0QAY6   1.7e-33   2-91   SRF-like  
A0A0E0QAY7   1.44e-33   2-91   SRF-like  
A0A0E0QAY8   1.16e-33   2-91   SRF-like  
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A0A0E0QH26   6.93e-17   221-271   SRF-like  
A0A0E0QH28   3.79e-21   221-295   SRF-like  
A0A0E0QH29   1.57e-17   1-51   SRF-like  
A0A0E0QKM0   1.12e-29   2-84   SRF-like  
A0A0E0QKM1   1.44e-29   2-84   SRF-like  
A0A0E0QLL9   1.19e-33   2-89   SRF-like  
A0A0E0QLM0   1.29e-33   2-89   SRF-like  
A0A0E0QLM1   1.07e-33   2-89   SRF-like  
A0A0E0QLM2   1.44e-30   2-79   SRF-like  
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A0A0E0R1U5   2.09e-31   3-85   SRF-like  
A0A0E0R1U6   7.33e-32   3-85   SRF-like  
A0A0E0RBQ5   2.75e-24   36-129   SRF-like  
A0A0E0RBQ6   2.75e-24   36-129   SRF-like  
A0A0E0RF23   2.75e-28   1-74   SRF-like  
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A0A0E0RGC0   2.62e-26   10-84   SRF-like  
A0A0E0RGC3   1.7e-20   5-70   SRF-like  
A0A0E0RHH7   0.00000000000445   1-37   SRF-like  
A0A0E0RHL1   1.96e-28   2-84   SRF-like  
A0A0E4AZI0   2.35e-31   3-75   SRF-like  
A0A0E9N9W3   3.79e-22   1-77   SRF-like  
A0A0E9ND72   2.35e-23   93-174   SRF-like  
 
Weak hits:
A0A014P241   0.00549   5-44   SRF-like  
A0A022QS69   0.000106   19-71   SRF-like  
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A0A0E9D7P9   0.0262   31-59   SRF-like  

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Showing sequences 1 to 3000 of 20190

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Select to display   Genome       Domains   Proteins
No Yes ALL   51510 51510
No Yes Homo sapiens 76_38 Human 37 37
No Yes Pan troglodytes 76_2.1.4 Chimpanzee 5 5
No Yes Gorilla gorilla 76_3.1 Western gorilla 9 9
No Yes Pongo abelii 76_2 Sumatran orangutan 5 5
No Yes Nomascus leucogenys 76_1.0 Northern white-cheeked gibbon 5 5
No Yes Papio anubis 76 Olive baboon 7 7
No Yes Macaca mulatta 76_1 Rhesus monkey 9 9
No Yes Callithrix jacchus 76_3.2.1 White-tufted-ear marmoset 14 14
No Yes Otolemur garnettii 76_3 Small-eared galago 5 5
No Yes Microcebus murinus 76_1 Gray mouse lemur 4 4
No Yes Rattus norvegicus 76_5.0 Norway rat 8 8
No Yes Mus musculus 76_38 House mouse 20 20
No Yes Dipodomys ordii 76_1 Ord's kangaroo rat 5 5
No Yes Ictidomys tridecemlineatus 76_2 Thirteen-lined ground squirrel 4 4
No Yes Heterocephalus glaber v1.7-2 Naked mole-rat 5 5
No Yes Cavia porcellus 76_3 Domestic guinea pig 4 4
No Yes Oryctolagus cuniculus 76_2 Rabbit 4 4
No Yes Ochotona princeps 76 American pika 4 4
No Yes Tupaia belangeri 76 Northern tree shrew 2 2
No Yes Sus scrofa 76_10.2 Pig 7 7
No Yes Bos taurus 76_3.1 Cattle 5 5
No Yes Ovis aries 76_3.1 Sheep 6 6
No Yes Vicugna pacos 76_1 Alpaca 2 2
No Yes Tursiops truncatus 76_1 Bottlenose dolphin 5 5
No Yes Mustela putorius furo 76_1.0 Domestic ferret 5 5
No Yes Ailuropoda melanoleuca 76_1 Giant panda 6 6
No Yes Canis familiaris 76_3.1 Dog 8 8
No Yes Felis catus 76_6.2 Domestic cat 5 5
No Yes Equus caballus 76_2 Horse 9 9
No Yes Myotis lucifugus 76_2.0 Little brown bat 5 5
No Yes Pteropus vampyrus 76_1 Large flying fox 5 5
No Yes Sorex araneus 76_1 European shrew 2 2
No Yes Erinaceus europaeus 76 Western European hedgehog 4 4
No Yes Procavia capensis 76_1 Cape rock hyrax 3 3
No Yes Loxodonta africana 76_3 African savanna elephant 8 8
No Yes Echinops telfairi 76 Small Madagascar hedgehog 2 2
No Yes Dasypus novemcinctus 76_2 Nine-banded armadillo 8 8
No Yes Choloepus hoffmanni 76_1 Hoffmann's two-fingered sloth 2 2
No Yes Macropus eugenii 76_1.0 Tammar wallaby 5 5
No Yes Sarcophilus harrisii 76_7.0 Tasmanian devil 5 5
No Yes Monodelphis domestica 76_5 Gray short-tailed opossum 6 6
No Yes Ornithorhynchus anatinus 76_5 Platypus 4 4
No Yes Saccoglossus kowalevskii v3.0   14 14
No Yes Meleagris gallopavo 76_2 Turkey 2 2
No Yes Gallus gallus 76_4 Chicken 6 6
No Yes Anas platyrhynchos 76_1.0 Mallard 3 3
No Yes Taeniopygia guttata 76_3.2.4 Zebra finch 4 4
No Yes Ficedula albicollis 76_1.0 Collared flycatcher 5 5
No Yes Pelodiscus sinensis 76_1.0 Chinese soft-shelled turtle 3 3
No Yes Anolis carolinensis 76_2.0 Green anole 4 4
No Yes Xenopus laevis African clawed frog 24 24
No Yes Xenopus tropicalis 76_4.2 Tropical clawed frog 6 6
No Yes Latimeria chalumnae 76_1 Coelacanth 8 8
No Yes Lepisosteus oculatus 76 Spotted gar 7 7
No Yes Gadus morhua 76_1 Atlantic cod 14 14
No Yes Tetraodon nigroviridis 76_8 Spotted green pufferfish 16 16
No Yes Takifugu rubripes 76_4 Torafugu 41 41
No Yes Gasterosteus aculeatus 76_1 Three-spined stickleback 11 11
No Yes Oryzias latipes 76_1 Japanese medaka 9 9
No Yes Xiphophorus maculatus 76_4.4.2 Southern platyfish 9 9
No Yes Poecilia formosa 76 Amazon molly 9 9
No Yes Oreochromis niloticus 76_1.0 Nile tilapia 14 14
No Yes Astyanax mexicanus 76 Mexican tetra 6 6
No Yes Danio rerio 76_9 Zebrafish 22 22
No Yes Oikopleura dioica   3 3
No Yes Ciona savignyi 76_2.0 Pacific transparent sea squirt 2 2
No Yes Ciona intestinalis 76 Vase tunicate 3 3
No Yes Strongylocentrotus purpuratus v3.1 Purple sea urchin 3 3
No Yes Adineta vaga   12 12
No Yes Octopus bimaculoides 280   3 3
No Yes Crassostrea gigas 22 Pacific oyster 5 5
No Yes Lottia gigantea Owl limpet 3 3
No Yes Helobdella robusta   6 6
No Yes Capitella sp. I   5 5
No Yes Danaus plexippus OGS1.0 Monarch butterfly 2 2
No Yes Heliconius melpomene Postman butterfly 3 3
No Yes Bombyx mori Domestic silkworm 3 3
No Yes Nasonia vitripennis Jewel wasp 2 2
No Yes Apis mellifera 38.2d (Not maintained) Honey bee 6 6
No Yes Harpegnathos saltator v3.3 Jerdon's jumping ant 2 2
No Yes Linepithema humile v1.1 Argentine ant 2 2
No Yes Pogonomyrmex barbatus v1.2 Red harvester ant 2 2
No Yes Solenopsis invicta v.2.2.3 Red fire ant 3 3
No Yes Acromyrmex echinatior v3.8 Panamanian leafcutter ant 2 2
No Yes Atta cephalotes v1.1   2 2
No Yes Camponotus floridanus v3.3 Florida carpenter ant 2 2
No Yes Lucilia cuprina Australian sheep blowfly 3 3
No Yes Drosophila grimshawi 1.3   2 2
No Yes Drosophila willistoni 1.3   2 2
No Yes Drosophila pseudoobscura 2.13   2 2
No Yes Drosophila persimilis 1.3   2 2
No Yes Drosophila suzukii   2 2
No Yes Drosophila yakuba 1.3   2 2
No Yes Drosophila simulans 1.3   2 2
No Yes Drosophila sechellia 1.3   2 2
No Yes Drosophila melanogaster 76_5 Fruit fly 9 9
No Yes Drosophila erecta 1.3   2 2
No Yes Drosophila ananassae 1.3   2 2
No Yes Drosophila virilis 1.2   2 2
No Yes Drosophila mojavensis 1.3   2 2
No Yes Megaselia scalaris 22   2 2
No Yes Aedes aegypti 55 (Not maintained) Yellow fever mosquito 4 4
No Yes Culex pipiens quinquefasciatus Southern house mosquito 4 4
No Yes Anopheles darlingi 22 American malaria mosquito 2 2
No Yes Anopheles gambiae 49_3j African malaria mosquito 3 3
No Yes Tribolium castaneum 3.0 Red flour beetle 2 2
No Yes Pediculus humanus corporis (Early assembly) Human body louse 2 2
No Yes Acyrthosiphon pisum Pea aphid 3 3
No Yes Rhodnius prolixus 22   2 2
No Yes Daphnia pulex Common water flea 2 2
No Yes Strigamia maritima 22   2 2
No Yes Sarcoptes scabiei   2 2
No Yes Tetranychus urticae Two-spotted spider mite 4 4
No Yes Ixodes scapularis (Preliminary) Black-legged tick 2 2
No Yes Pristionchus pacificus   1 1
No Yes Meloidogyne incognita Southern root-knot nematode 3 3
No Yes Meloidogyne hapla   1 1
No Yes Onchocerca volvulus 22   2 2
No Yes Brugia malayi WS250 Agent of lymphatic filariasis 4 4
No Yes Caenorhabditis japonica   2 2
No Yes Caenorhabditis brenneri   4 4
No Yes Caenorhabditis remanei   2 2
No Yes Caenorhabditis elegans 76_235 Roundworm 2 2
No Yes Caenorhabditis briggsae 2   2 2
No Yes Trichinella spiralis 22   1 1
No Yes Hymenolepis microstoma   3 3
No Yes Echinococcus multilocularis   3 3
No Yes Echinococcus granulosus   3 3
No Yes Taenia solium Pork tapeworm 4 4
No Yes Schistosoma mansoni   4 4
No Yes Mnemiopsis leidyi Sea walnut 2 2
No Yes Thelohanellus kitauei   1 1
No Yes Acropora digitifera v1.0   1 1
No Yes Nematostella vectensis 1.0 Starlet sea anemone 3 3
No Yes Hydra vulgaris   2 2
No Yes Amphimedon queenslandica   2 2
No Yes Trichoplax adhaerens   3 3
No Yes Proterospongia sp. ATCC 50818   2 2
No Yes Monosiga brevicollis   3 3
No Yes Sphaeroforma arctica JP610   2 2
No Yes Capsaspora owczarzaki ATCC 30864   2 2
No Yes Conidiobolus coronatus NRRL28638 v1.0   3 3
No Yes Mortierella verticillata NRRL 6337   4 4
No Yes Phycomyces blakesleeanus   8 8
No Yes Rhizopus oryzae RA 99-880   10 10
No Yes Mucor circinelloides   10 10
No Yes Rhizomucor miehei CAU432   7 7
No Yes Malassezia globosa CBS 7966   4 4
No Yes Sporisorium reilianum 22   2 2
No Yes Ustilago maydis   2 2
No Yes Mixia osmundae IAM 14324 v1.0   3 3
No Yes Cronartium quercuum f. sp. fusiforme G11 v1.0   3 3
No Yes Puccinia graminis f. sp. tritici CRL 75-36-700-3   2 2
No Yes Melampsora laricis-populina   3 3
No Yes Rhodotorula graminis WP1 v1.0   4 4
No Yes Sporobolomyces roseus IAM 13481   3 3
No Yes Microbotryum violaceum 22   4 4
No Yes Wallemia sebi v1.0   2 2
No Yes Sphaerobolus stellatus v1.0   2 2
No Yes Piloderma croceum F 1598 v1.0   3 3
No Yes Serpula lacrymans var. lacrymans S7.9   1 1
No Yes Coniophora puteana   2 2
No Yes Hydnomerulius pinastri v2.0   2 2
No Yes Paxillus rubicundulus Ve08.2h10 v1.0   2 2
No Yes Pisolithus microcarpus 441 v1.0   2 2
No Yes Pisolithus tinctorius Marx 270 v1.0   2 2
No Yes Scleroderma citrinum Foug A v1.0   2 2
No Yes Coprinopsis cinerea okayama7 130 v3   1 1
No Yes Pleurotus ostreatus Oyster mushroom 2 2
No Yes Amanita thiersii Skay4041 v1.0   4 4
No Yes Amanita muscaria Koide v1.0 Fly agaric 2 2
No Yes Galerina marginata v1.0   6 6
No Yes Hebeloma cylindrosporum h7 v2.0   2 2
No Yes Laccaria bicolor S238N-H82   3 3
No Yes Agaricus bisporus var. bisporus   2 2
No Yes Schizophyllum commune   4 4
No Yes Stereum hirsutum FP-91666 SS1 v1.0   3 3
No Yes Heterobasidion annosum   1 1
No Yes Gloeophyllum trabeumv1.0   3 3
No Yes Punctularia strigosozonata v1.0   5 5
No Yes Sebacina vermifera MAFF 305830 v1.0   2 2
No Yes Fomitiporia mediterranea v1.0   1 1
No Yes Tulasnella calospora AL13/4D v1.0   2 2
No Yes Postia placenta   3 3
No Yes Wolfiporia cocos MD-104 SS10 v1.0   2 2
No Yes Fomitopsis pinicolav1.0   2 2
No Yes Fomitopsis pinicola FP-58527 SS1 v3.0   2 2
No Yes Phanerochaete chrysosporium RP-78 2.1   2 2
No Yes Dichomitus squalens   2 2
No Yes Trametes versicolor v1.0   2 2
No Yes Tremella mesenterica Witches' butter 2 2
No Yes Daldinia eschscholzii EC12 v1.0   2 2
No Yes Apiospora montagnei NRRL 25634 v1.0   2 2
No Yes Magnaporthe poae ATCC 64411 22   2 2
No Yes Magnaporthe grisea 70-15   2 2
No Yes Podospora anserina   2 2
No Yes Sporotrichum thermophile ATCC 42464   1 1
No Yes Thielavia terrestris NRRL 8126   2 2
No Yes Chaetomium globosum CBS 148.51   2 2
No Yes Neurospora tetrasperma   1 1
No Yes Neurospora discreta FGSC 8579   2 2
No Yes Neurospora crassa OR74A   2 2
No Yes Cryphonectria parasitica Chestnut blight fungus 2 2
No Yes Verticillium albo-atrum VaMs.102   6 6
No Yes Verticillium dahliae VdLs.17   8 8
No Yes Acremonium alcalophilumv 1.0   2 2
No Yes Glomerella graminicola 22   2 2
No Yes Fusarium graminearum   2 2
No Yes Nectria haematococca mpVI   2 2
No Yes Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici 4286   4 4
No Yes Fusarium verticillioides 7600   2 2
No Yes Trichoderma asperellum CBS 433.97 v1.0   3 3
No Yes Trichoderma atroviride   2 2
No Yes Trichoderma citrinoviride v1.0   2 2
No Yes Trichoderma reesei 1.2   2 2
No Yes Trichoderma virens Gv29-8   2 2
No Yes Trichoderma longibrachiatum ATCC 18648 v1.0   2 2
No Yes Trichoderma harzianum CBS 226.95 v1.0   2 2
No Yes Amorphotheca resinae v1.0 Creosote fungus 3 3
No Yes Botrytis cinerea B05.10   1 1
No Yes Sclerotinia sclerotiorum   5 5
No Yes Blumeria graminis 22   2 2
No Yes Didymella exigua CBS 183.55 v1.0   2 2
No Yes Leptosphaeria maculans 22   2 2
No Yes Setosphaeria turcica v1.0   2 2
No Yes Cochliobolus miyabeanus ATCC 44560 v1.0   4 4
No Yes Cochliobolus victoriae FI3 v1.0   2 2
No Yes Cochliobolus carbonum 26-R-13 v1.0   2 2
No Yes Cochliobolus heterostrophus Southern corn leaf blight pathogen 2 2
No Yes Alternaria brassicicola   2 2
No Yes Cochliobolus lunatus m118 v2.0   2 2
No Yes Pyrenophora teres f. teres 22   4 4
No Yes Pyrenophora tritici-repentis   2 2
No Yes Stagonospora nodorum   2 2
No Yes Mycosphaerella graminicola IPO323   2 2
No Yes Zasmidium cellare ATCC 36951 v1.0   3 3
No Yes Dothistroma septosporum   2 2
No Yes Septoria musiva v1.0   3 3
No Yes Mycosphaerella fijiensis CIRAD86   3 3
No Yes Aureobasidium pullulans var. subglaciale EXF-2481 v1.0   2 2
No Yes Paracoccidioides brasiliensis Pb18   1 1
No Yes Coccidioides posadasii RMSCC 3488   1 1
No Yes Coccidioides immitis RS   5 5
No Yes Ajellomyces dermatitidis SLH14081   3 3
No Yes Histoplasma capsulatum class NAmI strain WU24   4 4
No Yes Microsporum canis CBS 113480   2 2
No Yes Trichophyton equinum CBS 127.97   1 1
No Yes Trichophyton verrucosum HKI 0517   2 2
No Yes Arthroderma benhamiae CBS 112371   2 2
No Yes Trichophyton tonsurans CBS 112818   2 2
No Yes Trichophyton rubrum CBS 118892   2 2
No Yes Uncinocarpus reesii 1704   2 2
No Yes Aspergillus zonatus v1.0   3 3
No Yes Penicillium chrysogenum Wisconsin 54-1255   25 25
No Yes Penicillium chrysogenum v1.0   6 6
No Yes Aspergillus acidus v1.0   10 10
No Yes Aspergillus fumigatus Af293   4 4
No Yes Aspergillus brasiliensis v1.0   6 6
No Yes Aspergillus nidulans FGSC A4   2 2
No Yes Aspergillus sydowii v1.0   5 5
No Yes Aspergillus versicolor v1.0   3 3
No Yes Aspergillus glaucus   3 3
No Yes Aspergillus carbonarius ITEM 5010   2 2
No Yes Neosartorya fischeri NRRL 181   2 2
No Yes Aspergillus terreus NIH2624   3 3
No Yes Aspergillus tubingensis v1.0   4 4
No Yes Aspergillus wentii v1.0   8 8
No Yes Aspergillus oryzae RIB40   3 3
No Yes Aspergillus niger 22   3 3
No Yes Aspergillus niger ATCC 1015   3 3
No Yes Aspergillus flavus NRRL3357   2 2
No Yes Aspergillus clavatus NRRL 1   2 2
No Yes Penicillium marneffei ATCC 18224   2 2
No Yes Tuber melanosporum Mel28 22   2 2
No Yes Tuber melanosporum Vittad Perigord truffle 2 2
No Yes Hansenula polymorpha v2.0   2 2
No Yes Dekkera bruxellensis CBS 2499 v2.0   2 2
No Yes Pichia membranifaciensv1.0   2 2
No Yes Candida tanzawaensis NRRL Y-17324 v1.0   2 2
No Yes Candida dubliniensis CD36   2 2
No Yes Candida tropicalis MYA-3404   2 2
No Yes Candida parapsilosis   2 2
No Yes Candida albicans SC5314   2 2
No Yes Lodderomyces elongisporus NRRL YB-4239   2 2
No Yes Babjeviella inositovora NRRL Y-12698 v1.0   2 2
No Yes Pichia stipitis CBS 6054   2 2
No Yes Candida guilliermondii ATCC 6260   2 2
No Yes Hyphopichia burtonii NRRL Y-1933 v1.0   1 1
No Yes Debaromyces hansenii   2 2
No Yes Wickerhamomyces anomalus   2 2
No Yes Pichia pastoris GS115   2 2
No Yes Hanseniaspora valbyensis NRRL Y-1626 v1.1   1 1
No Yes Yarrowia lipolytica CLIB122   2 2
No Yes Candida lusitaniae ATCC 42720   2 2
No Yes Metschnikowia bicuspidata NRRL YB-4993 v1.0   2 2
No Yes Vanderwaltozyma polyspora DSM 70294   5 5
No Yes Candida glabrata CBS138   5 5
No Yes Kluyveromyces thermotolerans CBS 6340   2 2
No Yes Lachancea kluyveri   2 2
No Yes Kluyveromyces waltii   1 1
No Yes Ashbya gossypii ATCC 10895   2 2
No Yes Zygosaccharomyces rouxii   3 3
No Yes Saccharomyces mikatae MIT   4 4
No Yes Saccharomyces paradoxus MIT   3 3
No Yes Saccharomyces cerevisiae 76 Baker's yeast 4 4
No Yes Saccharomyces bayanus MIT   4 4
No Yes Kluyveromyces lactis   2 2
No Yes Schizosaccharomyces cryophilus OY26 22   2 2
No Yes Schizosaccharomyces octosporus yFS286   3 3
No Yes Schizosaccharomyces japonicus yFS275   3 3
No Yes Schizosaccharomyces pombe Fission yeast 3 3
No Yes Catenaria anguillulae PL171 v1.0   6 6
No Yes Allomyces macrogynus ATCC 38327   11 11
No Yes Spizellomyces punctatus DAOM BR117   2 2
No Yes Dictyostelium discoideum   4 4
No Yes Dictyostelium purpureum   2 2
No Yes Entamoeba dispar 1.2   3 3
No Yes Entamoeba invadens 1.2   3 3
No Yes Entamoeba histolytica 1   2 2
No Yes Selaginella moellendorffii   30 30
No Yes Pinus taeda Loblolly pine 95 92
No Yes Picea abies Norway spruce 24 22
No Yes Eucalyptus grandis v201 Rose gum 148 148
No Yes Theobroma cacao B97-61/B2 v1 Cacao 70 70
No Yes Gossypium raimondii v221   268 268
No Yes Citrus clementina v165   105 105
No Yes Citrus sinensis v154 Sweet orange 81 81
No Yes Thellungiella halophila v173   127 127
No Yes Brassica rapa Chiifu-401 1.2 Field mustard 162 162
No Yes Capsella rubella v183   133 133
No Yes Arabidopsis lyrata Lyrate rockcress 82 82
No Yes Arabidopsis thaliana 10 Thale cress 147 147
No Yes Carica papaya Papaya 269 268
No Yes Medicago truncatula Barrel medic 158 158
No Yes Phaseolus vulgaris v186 French bean 88 88
No Yes Glycine max v109 Soybean 192 192
No Yes Cucumis sativus v122 Cucumber 65 65
No Yes Fragaria vesca Wild strawberry 89 88
No Yes Malus domestica v196 Apple 144 144
No Yes Prunus persica v139 Peach 82 82
No Yes Linum usitatissimum v200 Flax 121 121
No Yes Manihot esculenta v147 Cassava 81 81
No Yes Populus trichocarpa v156 Black cottonwood 100 100
No Yes Vitis vinifera Wine grape 55 55
No Yes Mimulus guttatus v140 Spotted monkey flower 102 102
No Yes Solanum lycopersicum v.2.3 Tomato 105 105
No Yes Solanum tuberosum Potato 189 189
No Yes Actinidia chinensis Hongyang   85 85
No Yes Aquilegia coerulea v195   107 107
No Yes Triticum urartu 22   70 69
No Yes Triticum aestivum 22 Bread wheat 126 124
No Yes Aegilops tauschii 22   86 86
No Yes Brachypodium distachyon Stiff brome 75 75
No Yes Oryza barthii 22 African wild rice 100 99
No Yes Oryza meridionalis 22   93 91
No Yes Oryza glumaepatula 22   98 96
No Yes Oryza glaberrima African rice 59 59
No Yes Oryza punctata 22   104 102
No Yes Oryza nivara 22   106 100
No Yes Oryza brachyantha 22 Malo sina 60 60
No Yes Oryza sativa ssp. japonica 5.0 Japanese rice 105 105
No Yes Oryza sativa v193 Rice 102 102
No Yes Phyllostachys heterocyclavar. pubescens Kikko-chiku 28 28
No Yes Panicum virgatum v202 Switchgrass 90 90
No Yes Setaria italica v164 Foxtail millet 94 94
No Yes Zea mays subsp. mays Maize 96 96
No Yes Zea mays v181 Maize 138 137
No Yes Sorghum bicolor Sorghum 77 76
No Yes Musa balbisiana Balbis banana 87 86
No Yes Musa acuminata 22 Wild Malaysian banana 81 81
No Yes Amborella trichopoda 22   34 34
No Yes Physcomitrella patens   22 22
No Yes Coccomyxa subellipsoidea sp. C-169 v2   2 2
No Yes Asterochloris sp. Cgr/DA1pho v1.0   1 1
No Yes Chlorella vulgaris   2 2
No Yes Volvox carteri f. nagariensis   1 1
No Yes Volvox carteri v199   1 1
No Yes Chlamydomonas reinhardtii 4.0   2 2
No Yes Ostreococcus sp. RCC809   1 1
No Yes Ostreococcus lucimarinus CCE9901   1 1
No Yes Ostreococcus tauri   1 1
No Yes Bathycoccus prasinos   1 1
No Yes Micromonas sp. RCC299   1 1
No Yes Micromonas pusilla CCMP1545 v3.0   1 1
No Yes Cyanidioschyzon merolae strain 10D 22   1 1
No Yes Cyanidioschyzon merolae   1 1
No Yes Porphyridium purpureum 02_2012   2 2
No Yes Thecamonas trahens ATCC 50062   1 1
No Yes Bigelowiella natans CCMP2755 22   3 3
No Yes Cyanophora paradoxa   1 1
No Yes Albugo laibachii 22   1 1
No Yes Pythium iwayamai DAOM BR242034 22   1 1
No Yes Pythium arrhenomanes ATCC 12531 22   1 1
No Yes Pythium ultimum v1.7-2   1 1
No Yes Pythium aphanidermatum DAOM BR444 22   2 2
No Yes Pythium irregulare DAOM BR486 22   1 1
No Yes Pythium vexans DAOM BR484 22   1 1
No Yes Phytophthora ramorum 1.1 Sudden oak death agent 1 1
No Yes Phytophthora sojae 1.1   1 1
No Yes Phytophthora infestans T30-4   1 1
No Yes Phytophthora capsici   1 1
No Yes Hyaloperonospora arabidopsidis 22   1 1
No Yes Paramecium tetraurelia   5 5
No Yes Tetrahymena thermophila SB210 1   1 1
No Yes Naegleria gruberi   2 2
No Yes Guillardia theta CCMP2712 v1.0   6 6
No Yes Emiliania huxleyi CCMP1516   1 1
No Yes Xenopus (Silurana) tropicalis v7.1 (annotation v7.2) Tropical clawed frog 7 7
No Yes Drosophila melanogaster FlyBase 5.12 (FlyBase) Fruit fly 7 7
No Yes Anopheles gambiae VectorBase AgamP3.6 (VectorBase) African malaria mosquito 3 3
No Yes Ascaris suum Victoria/Ghent Pig roundworm 2 2
No Yes Caenorhabditis elegans WormBase WS218 (WormBase) Roundworm 2 2
No Yes Cryptococcus neoformans var. grubii H99   2 2
No Yes Cryptococcus neoformans B-3501A   2 2
No Yes Cryptococcus neoformans JEC21   2 2
No Yes Paracoccidioides brasiliensis Pb01   1 1
No Yes Paracoccidioides brasiliensis Pb03   2 2
No Yes Coccidioides posadasii str. Silveira   2 2
No Yes Coccidioides immitis RMSCC 3703   1 1
No Yes Coccidioides immitis RMSCC 2394   3 3
No Yes Coccidioides immitis H538.4   2 2
No Yes Ajellomyces dermatitidis ER-3   1 1
No Yes Histoplasma capsulatum H143   4 4
No Yes Histoplasma capsulatum H88   2 2
No Yes Histoplasma capsulatum G186AR   4 4
No Yes Aspergillus fumigatus A1163   4 4
No Yes Candida albicans WO-1   2 2
No Yes Saccharomyces cerevisiae UC5   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae PW5   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae FL100   3 3
No Yes Saccharomyces cerevisiae CLIB324   3 3
No Yes Saccharomyces cerevisiae CBS7960   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae YJM269   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae T7   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae FostersB   3 3
No Yes Saccharomyces cerevisiae FostersO   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae VL3   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae Vin13   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae LalvinQA23   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae AWRI796   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae Sigma1278b   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae W303   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae JAY291   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae AWRI1631   2 2
No Yes Saccharomyces cerevisiae YPS163   3 3
No Yes Saccharomyces cerevisiae M22   3 3
No Yes Saccharomyces cerevisiae T73   1 1
No Yes Saccharomyces cerevisiae CLIB215   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae Y10   2 2
No Yes Saccharomyces cerevisiae YJM789   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae YJM789   4 4
No Yes Saccharomyces cerevisiae RM11-1a   3 3
No Yes Saccharomyces cerevisiae RM11-1a   3 3
No Yes Saccharomyces cerevisiae SGD (SGD) Baker's yeast 4 4
No Yes Schizosaccharomyces pombe 972h-   3 3
No Yes Batrachochytrium dendrobatidis JEL423   1 1
No Yes Batrachochytrium dendrobatidis JAM81   1 1
No Yes Theobroma cacao Matina 1-6 v0.9 Cacao 71 70
No Yes Hordeum vulgare 22 Domesticated barley 50 50
No Yes Oryza sativa ssp. Indica (Subspecies) Long-grained rice 81 81
No Yes Homo sapiens 75_37 (old version GRC) Human 42 42
No Yes Homo sapiens (NCBI version) Human 13 13
No Yes Mus musculus 63_37 (longest transcript per gene) (Duplicate) House mouse 6 6
No Yes Loa loa v3.3 (Request) Eye worm 2 2
No Yes Wuchereria bancrofti v1.0 (Request) Agent of lymphatic filariasis 2 2
No Yes Brugia malayi v1.0 (Duplicate) Agent of lymphatic filariasis 2 2
No Yes Moniliophthora perniciosa FA553 (Genome survey)   1 1
No Yes Encephalitozoon intestinalis (endoparasite)   1 1
No Yes Encephalitozoon cuniculi (endoparasite)   1 1
No Yes Picea sitchensis (Incomplete) Sitka spruce 16 16
No Yes Lotus japonicus (Early assembly)   90 90
No Yes Malus x domestica (Duplicate) Apple 144 144
No Yes Ricinus communis (Early assembly) Castor bean 39 39
No Yes Nicotiana benthamiana 0.4.4 (Early draft)   138 135
No Yes Solanum pimpinellifolium A-1.0 (Early draft) Currant tomato 105 105
No Yes Solanum lycopersicum v2.3 (Early assembly) Tomato 105 105
No Yes Phoenix dactylifera (Early draft) Date palm 15 15
No Yes Homo sapiens 69_37 Human 5 5
No Yes Pan troglodytes 69_2.1.4 Chimpanzee 5 5
No Yes Gorilla gorilla 69_3.1 Western gorilla 5 5
No Yes Pongo abelii 69_2 Sumatran orangutan 5 5
No Yes Nomascus leucogenys 69_1.0 Northern white-cheeked gibbon 4 4
No Yes Macaca mulatta 69_1 Rhesus monkey 5 5
No Yes Callithrix jacchus 69_3.2.1 White-tufted-ear marmoset 7 7
No Yes Otolemur garnettii 69_3 Small-eared galago 5 5
No Yes Microcebus murinus 69_1 Gray mouse lemur 4 4
No Yes Rattus norvegicus 69_3.4 Norway rat 4 4
No Yes Mus musculus 69_38 House mouse 6 6
No Yes Dipodomys ordii 69_1 Ord's kangaroo rat 5 5
No Yes Ictidomys tridecemlineatus 69_2 Thirteen-lined ground squirrel 4 4
No Yes Cavia porcellus 69_3 Domestic guinea pig 4 4
No Yes Oryctolagus cuniculus 69_2 Rabbit 5 5
No Yes Ochotona princeps 69 American pika 4 4
No Yes Tupaia belangeri 69 Northern tree shrew 2 2
No Yes Sus scrofa 69_10.2 Pig 6 6
No Yes Bos taurus 69_3.1 Cattle 5 5
No Yes Vicugna pacos 69_1 Alpaca 2 2
No Yes Tursiops truncatus 69_1 Bottlenose dolphin 5 5
No Yes Mustela putorius furo 69_1.0 Domestic ferret 5 5
No Yes Ailuropoda melanoleuca 69_1 Giant panda 5 5
No Yes Canis familiaris 69_3.1 Dog 5 5
No Yes Felis catus 69 Domestic cat 3 3
No Yes Equus caballus 69_2 Horse 5 5
No Yes Myotis lucifugus 69_2.0 Little brown bat 5 5
No Yes Pteropus vampyrus 69_1 Large flying fox 5 5
No Yes Sorex araneus 69_1 European shrew 2 2
No Yes Erinaceus europaeus 69 Western European hedgehog 4 4
No Yes Procavia capensis 69_1 Cape rock hyrax 3 3
No Yes Loxodonta africana 69_3 African savanna elephant 5 5
No Yes Echinops telfairi 69 Small Madagascar hedgehog 2 2
No Yes Dasypus novemcinctus 69_2 Nine-banded armadillo 3 3
No Yes Choloepus hoffmanni 69_1 Hoffmann's two-fingered sloth 2 2
No Yes Macropus eugenii 69_1.0 Tammar wallaby 5 5
No Yes Sarcophilus harrisii 69_7.0 Tasmanian devil 4 4
No Yes Monodelphis domestica 69_5 Gray short-tailed opossum 5 5
No Yes Ornithorhynchus anatinus 69_5 Platypus 3 3
No Yes Meleagris gallopavo 69_2 Turkey 2 2
No Yes Gallus gallus 69_2 Chicken 3 3
No Yes Taeniopygia guttata 69_3.2.4 Zebra finch 4 4
No Yes Pelodiscus sinensis 69_1.0 Chinese soft-shelled turtle 3 3
No Yes Anolis carolinensis 69_2.0 Green anole 4 4
No Yes Xenopus tropicalis 69_4.2 Tropical clawed frog 4 4
No Yes Latimeria chalumnae 69_1 Coelacanth 5 5
No Yes Gadus morhua 69_1 Atlantic cod 8 8
No Yes Tetraodon nigroviridis 69_8 Spotted green pufferfish 9 9
No Yes Takifugu rubripes 69_4 Torafugu 8 8
No Yes Gasterosteus aculeatus 69_1 Three-spined stickleback 8 8
No Yes Oryzias latipes 69_1 Japanese medaka 5 5
No Yes Xiphophorus maculatus 69_4.4.2 Southern platyfish 9 9
No Yes Oreochromis niloticus 69_1.0 Nile tilapia 9 9
No Yes Danio rerio 69_9 Zebrafish 8 8
No Yes Ciona savignyi 69_2.0 Pacific transparent sea squirt 2 2
No Yes Ciona intestinalis 69 Vase tunicate 3 3
No Yes Drosophila melanogaster 69_5 Fruit fly 2 2
No Yes Caenorhabditis elegans 69_215 Roundworm 2 2
No Yes Saccharomyces cerevisiae 69_4 Baker's yeast 4 4
No Yes Arabidopsis thaliana 10 Thale cress 109 109
No Yes Endophytic microbiome from Rice (meta-genome)   1 1
No Yes Methylotrophic community from Lake Washington sediment combined (v2) (meta-genome)   2 2
No Yes Methylotrophic community from Lake Washington sediment Methane enrichment (meta-genome)   1 1
No Yes Methylotrophic community from Lake Washington sediment Methanol enrichment (meta-genome)   1 1
No Yes NCBI 2017_08 genome   18186 18157
No Yes Protozoadb 2010_08 (Protozoadb)   10 10
No Yes Soil microbial communities from sample at FACE Site 3 Nevada Test Site Creosote CO2+ (meta-genome)   1 1
No Yes STRING v9.0.5 (STRING)   966 965
No Yes Uniprot 2018_03 genome   20244 20190
No Yes Global Ocean Sampling Expedition (GOS)   5 5
No Yes PDB chains (SCOP 1.75) (PDB)   7 7
No Yes Protein Data Bank (all PDB sequenc)   54 54
No Yes SCOP2 SCOPe CATH ECOD (all domain sequ)   111 111
No Yes TargetDB (Targets)   16 16

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